中華獼猴桃‘紅陽(yáng)’Alase家族基因的克隆及表達(dá)分析
本文關(guān)鍵詞: 醛糖酸內(nèi)酯酶 抗壞血酸 生物信息學(xué)分析 基因表達(dá)分析 出處:《應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報(bào)》2017年02期 論文類(lèi)型:期刊論文
【摘要】:在高等植物中醛糖酸內(nèi)酯酶(Alase)催化L-半乳糖酸(L-Gal A)形成抗壞血酸(Ascorbic acid,As A)的前體物質(zhì)L-半乳糖-1,4-內(nèi)酯(L-Ga IL),是As A合成分支途徑D-半乳糖醛酸途徑中的關(guān)鍵步驟.基于最新的獼猴桃基因組數(shù)據(jù)庫(kù),分離并克隆到3個(gè)Alase家族基因,分別命名為Alase1、Alase2、Alase3,并從基因信息、蛋白質(zhì)理化性質(zhì)、二級(jí)結(jié)構(gòu)及序列特征方面對(duì)其進(jìn)行預(yù)測(cè)及分析.結(jié)果表明,Alase為親水性蛋白,二級(jí)結(jié)構(gòu)主要以α-螺旋和不規(guī)則卷曲為主,3個(gè)Alase基因具有高度的相似性.定量RT-PCR分析表明3個(gè)Alase家族基因在不同組織中均有表達(dá),且在成熟的葉片中表達(dá)量最高.同時(shí)在獼猴桃果實(shí)發(fā)育及成熟過(guò)程中,Alase家族基因在幼果中的表達(dá)水平較低,而在果實(shí)發(fā)育后期及果實(shí)成熟過(guò)程中表達(dá)量不斷升高.本研究可為Alase家族基因后續(xù)功能研究及獼猴桃中As A生物合成和積累分子機(jī)制解析奠定基礎(chǔ).
[Abstract]:The formation of Ascorbic acid ascorbic acid (Ascorbic acidas) as a precursor of Alasease catalyzed by Alasease in higher plants is a key step in the Dgalacturonic acid pathway, which is a branch pathway of as A synthesis. In the latest kiwifruit genome database, Three Alase family genes were isolated and cloned. They were named Alase1, Alase2 and Alase3, and were predicted and analyzed from the aspects of gene information, protein physicochemical properties, secondary structure and sequence characteristics. The results showed that Alase was a hydrophilic protein. The secondary structure was mainly 偽 -helix and irregular crimp, and the three Alase genes were highly similar. Quantitative RT-PCR analysis showed that the three Alase family genes were all expressed in different tissues. At the same time, the expression level of Alase family genes in young fruit was lower during the development and maturation of kiwifruit. This study can be used to study the gene function of Alase family and explain the molecular mechanism of as A biosynthesis and accumulation in Actinidia deliciosa.
【作者單位】: 四川大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院生物資源與生態(tài)環(huán)境教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 水力學(xué)與山區(qū)河流開(kāi)發(fā)保護(hù)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;合肥工業(yè)大學(xué)生物與食品工程學(xué)院;
【基金】:國(guó)家973計(jì)劃重大項(xiàng)目(2011CB100401)資助~~
【分類(lèi)號(hào)】:Q943.2;S663.4
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,本文編號(hào):1549568
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