萬壽菊類胡蘿卜素裂解雙加氧酶基因CCD1克隆與表達分析
發(fā)布時間:2018-02-23 20:13
本文關(guān)鍵詞: 萬壽菊 類胡蘿卜素裂解雙加氧酶基因 花色 基因表達 出處:《中國農(nóng)業(yè)科學》2017年10期 論文類型:期刊論文
【摘要】:【目的】克隆萬壽菊(Tagetes erecta L.‘Scarletade’)類胡蘿卜素裂解雙加氧酶基因CCD1(TeCCD1),分析其序列特征和表達特性,為闡明其在類胡蘿卜素降解途徑中生物學功能及進一步探討萬壽菊花色形成機理提供理論基礎(chǔ)。【方法】依據(jù)萬壽菊花蕾轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),利用同源序列比對結(jié)果設(shè)計引物,結(jié)合RT-PCR技術(shù)克隆獲得萬壽菊CCD1 cDNA全長,分析其序列特征;利用Real-time PCR分析舌狀花未開花蕾、半開花蕾、開放的頭狀花序和完全開放的頭狀花序4個不同發(fā)育時期的基因表達特性!窘Y(jié)果】克隆獲得萬壽菊CCD1(Gen Bank登錄號:KX557488)的cDNA全長序列為1 746 bp,編碼區(qū)長度1 626 bp,編碼541個氨基酸。蛋白質(zhì)分析表明TeCCD1為不穩(wěn)定蛋白,不含信號肽,屬RPE65超家族(登錄號:PF03055),包含CCD家族保守結(jié)構(gòu)域,主要定位于細胞質(zhì)。萬壽菊CCD1核酸序列與除蟲菊CCD1同源性最高,為89%;氨基酸序列分析表明萬壽菊CCD1與除蟲菊CCD1同源性高達93%,與其他19個不同種屬的CCD1同源性在75%—83%,說明TeCCD1是高度保守的基因;系統(tǒng)進化樹分析顯示TeCCD1的進化基本符合植物分類學的進化規(guī)律,并具有明顯的種屬特征,萬壽菊與菊科同源基因親緣關(guān)系最近。Real-time PCR分析表明TeCCD1在舌狀花發(fā)育過程中均有表達,隨舌狀花的開放逐漸升高,S4期達到最大值!窘Y(jié)論】克隆獲得萬壽菊舌狀花的CCD1,是典型的CCD家族成員,為高度保守的基因,主要定位于細胞質(zhì),萬壽菊舌狀花顏色變淺可能與CCD1表達量增加導致類胡蘿卜素降解有關(guān)。
[Abstract]:In this paper , the cDNA full - length cDNA sequence of Tagetes erecta L . ' Scarletade ' ) was cloned and its sequence identity and expression were analyzed . Conclusion The CCD 1 , a typical CCD family member , is a typical CCD family member . It is a highly conserved gene . It is mainly localized in the cytoplasm , and the color of the tongue - like flower of Tagetes erecta may be related to the increase of the expression level of the CCD 1 , which results in the degradation of carotenoid .
【作者單位】: 上海交通大學農(nóng)業(yè)與生物學院;農(nóng)業(yè)部都市農(nóng)業(yè)(南方)重點實驗室;華中農(nóng)業(yè)大學園藝林學學院/園藝植物生物學教育部重點實驗室;
【基金】:教育部“創(chuàng)新團隊發(fā)展計劃”(IRT13065)
【分類號】:Q943.2;S681.9
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,本文編號:1527454
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