本文關鍵詞： 茶條槭 SDH 生物信息學分析 表達載體構建　出處：《中南林業(yè)科技大學學報》2017年04期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：結合茶條槭轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫,利用RT-PCR的方法克隆得到茶條槭SDH基因,命名為AgSDH,并對該基因及其蛋白進行了生物信息學分析。結果顯示,AgSDH基因的ORF全長為1 563 bp,共編碼520個氨基酸,推測蛋白相對分子量為57.219 k Da,理論等電點為5.61,無信號肽,預測亞細胞定位于細胞質(zhì)中。生物信息學分析表明AgSDH蛋白為親水性蛋白,沒有跨膜結構。蛋白質(zhì)二級結構α-螺旋占35.38%,延伸鏈占18.65%,無規(guī)則卷曲占45.96%;三級結構預測表明AgSDH蛋白以單體形式存在。與目前已知的多種植物的SDH蛋白具有相似的結構功能域。系統(tǒng)進化分析表明,AgSDH蛋白與臍橙SDH蛋白親緣關系最為接近。該研究結果為深入了解該基因的功能和茶條槭次生代謝產(chǎn)物合成的調(diào)控機理提供了基礎數(shù)據(jù)。
[Abstract]:The results showed that AgSDH was a hydrophilic protein with a relative molecular weight of 57.219 k Da , a theoretical isoelectric point of 5.61 , and no signal peptide .

【作者單位】： 東北林業(yè)大學生命科學學院;
【基金】：中央高校基本科研經(jīng)費“茶條槭次生代謝合成途徑調(diào)控基因表達譜分析”(DL13CA07) 哈爾濱市青年科技創(chuàng)新項目“誘導子作用下茶條槭細胞次生代謝途徑關鍵酶基因表達研究”(2013RFQXJ026)
【分類號】：S792.35

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本文編號：1507380