本文關(guān)鍵詞： 滇龍膽 香葉醇-羥化酶 基因克隆 生物信息學(xué) 基因表達(dá)　出處：《中草藥》2017年03期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：目的克隆滇龍膽Gentiana rigescens香葉醇-10-羥化酶(geraniol-10-hydroxylase,G10H)基因,對(duì)其進(jìn)行定量表達(dá)以及生物信息學(xué)分析。方法采用PCR技術(shù)獲得G10H的c DNA序列,對(duì)G10H蛋白進(jìn)行理化性質(zhì)、二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)等生物信息學(xué)分析,并利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法檢測(cè)G10H基因在滇龍膽根、莖、葉中的表達(dá)情況。結(jié)果克隆得到滇龍膽G10H基因,全長為1 400 bp,ORF 1 248 bp,編碼415個(gè)氨基酸。生物信息學(xué)預(yù)測(cè)該基因編碼蛋白質(zhì)分子式為C_(2131)H_(3390)N_(586)O_(615)S_(17),等電點(diǎn)為7.62,不穩(wěn)定系數(shù)為44.20,疏水性系數(shù)GRAVY為-0.245。G10H基因在滇龍膽根、莖、葉中均有表達(dá),其中在根中表達(dá)量最高,莖中最低。結(jié)論首次從滇龍膽中克隆得到了G10H基因,為進(jìn)一步闡明該基因的羥基化功能在滇龍膽龍膽苦苷生物合成途徑中的重要作用奠定基礎(chǔ)。
[Abstract]:Objective to clone and express the geraniol-10-hydroxylase G10H gene of Gentiana rigescens and analyze its bioinformatics. Methods the c DNA sequence of G10H was obtained by PCR, and the physicochemical properties of G10H protein were obtained. The expression of G10H gene in root, stem and leaf of Dian Gentiana was detected by real-time fluorescence quantitative PCR. The total length is 1 400 BP ORF 1 248 BP, encoding 415 amino acids. Bioinformatics predicts that the molecular formula of the protein encoded by this gene is CX 2131 HX 3390 NSP, isoelectric point 7.62, instability coefficient 44.20, hydrophobicity coefficient GRAVY -0.245 G10H expressed in root, stem and leaf of Gentiana yunnanensis. Conclusion the G10H gene was cloned from Gentiana davidiana for the first time, which laid a foundation for further elucidating the important role of Gentiopicrin in the biosynthesis pathway of Gentiopicrin.
【作者單位】： 云南中醫(yī)學(xué)院中藥學(xué)院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(81660634) 云南省科技計(jì)劃項(xiàng)目(2014FZ077) 云南省教育廳重點(diǎn)項(xiàng)目(2013Z002) 云南省應(yīng)用基礎(chǔ)研究-中醫(yī)聯(lián)合專項(xiàng)[2015FB205(-024)]
【分類號(hào)】：S567.239;Q943.2

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本文編號(hào)：1504961