本文關(guān)鍵詞： 小桐子 SNAREs JcYkt 克隆 生物信息學(xué)分析 表達分析　出處：《植物生理學(xué)報》2017年04期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：以小桐子(Jatropha curcas)c DNA為模版,克隆了Jc Ykt6基因的CDS序列。序列分析表明該基因包含600 bp完全閱讀框(ORF),編碼199個氨基酸。預(yù)測其編碼蛋白質(zhì)的分子量為22.53 k Da,等電點為6.90。Blast搜索結(jié)果及進化分析結(jié)果表明,Jc Ykt6蛋白與香瓜和黃瓜的Ykt6蛋白序列一致性最高(91%),親緣關(guān)系最近。該基因編碼的蛋白具有一個典型的VAMP基元。定量分析結(jié)果顯示,Jc Ykt6基因在小桐子根、莖、葉、花、果皮和種子中都有表達,并且在種子中表達量最高。在種子生長發(fā)育的前期其表達水平不斷增加,在種子生長發(fā)育的后期(50 d)達到最高值,然后下降。表達量變化過程與種子中儲藏蛋白質(zhì)合成趨勢基本一致,推測其參與小桐子種子儲藏蛋白質(zhì)的合成和運輸。ABA、PEG、Na Cl、4°C和機械損傷處理下Jc Ykt6表達水平都不同程度上調(diào),推測Jc Ykt6具有多種功能,可能參與小桐子非生物脅迫響應(yīng)和激素信號傳導(dǎo)。
[Abstract]:Jatropha curcas)c DNA was used as template. The CDS sequence of JC Ykt6 gene was cloned. The sequence analysis showed that the gene contained 600bp complete reading frame (ORF). The predicted molecular weight of the encoded protein was 22.53 kDa, and the isoelectric point was 6.90. Blast search results and evolutionary analysis. JC Ykt6 protein had the highest consistency with Ykt6 protein sequence of muskmelon and cucumber. The result of quantitative analysis showed that JC Ykt6 gene was expressed in root, stem, leaf, flower, pericarp and seed of Tung Tung. The expression level increased continuously at the early stage of seed growth and development, and reached the highest value at the later stage of seed growth and development. The process of expression change was basically consistent with the trend of protein synthesis in seed storage. It was speculated that it was involved in the synthesis and transport of stored protein in jatropha jatropha seed. The expression of JC Ykt6 was up-regulated at 4 擄C and mechanical injury, suggesting that JC Ykt6 had many functions and might be involved in abiotic stress response and hormone signal transduction.
【作者單位】： 昆明理工大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)工程學(xué)院;云南農(nóng)業(yè)大學(xué)園林園藝學(xué)院;云南師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;昆明理工大學(xué)建筑與城市規(guī)劃學(xué)院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(31460355、31260064和31460059)~~
【分類號】：Q943.2;S794.9
【正文快照】： 收稿2016-11-09修定2017-03-14真核細胞含有復(fù)雜的內(nèi)膜系統(tǒng),細胞內(nèi)的物質(zhì)交換通過囊泡運輸方式來完成(Staehelin 1997)。囊泡運輸主要包括運輸囊泡的出芽、定向移動、錨定和膜融合等過程,可溶性N-乙基馬來酰亞胺敏感因子附著蛋白受體(SNAREs)在膜融合過程中發(fā)揮重要作用(Cai等

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本文編號：1477089