柴達木盆地梭梭CMO基因的克隆及其蛋白結構預測
本文關鍵詞: 梭梭 CMO基因 序列分析 蛋白結構 出處:《西北林學院學報》2016年02期 論文類型:期刊論文
【摘要】:對柴達木盆地梭梭的CMO基因進行擴增,并利用生物軟件對CMO基因序列進行分析、對蛋白結構進行預測。結果表明,柴達木盆地梭梭CMO基因長度為1 341bp,編碼447個氨基酸。CMO蛋白親水性、二級結構、亞細胞定位、信號肽、跨膜螺旋區(qū)、三級結構預測結果顯示柴達木盆地梭梭CMO蛋白亞細胞定位于葉綠體,無信號肽,蛋白二級結構主要為無規(guī)則卷曲。CMO蛋白具有多個多種類型的功能位點,為蛋白功能的實現(xiàn)提供了保障。此外CMO蛋白的親水性較強,無跨膜螺旋區(qū)。柴達木盆地梭梭CMO蛋白三維結構預測結果顯示CMO蛋白三維結構由α螺旋、β折疊和無規(guī)則卷曲互相盤繞而成。
[Abstract]:The CMO gene of Haloxylon ammodendron in Chaidamurum Basin was amplified, and the sequence of CMO gene was analyzed by using biological software, and the protein structure was predicted. The length of CMO gene of Haloxylon ammodendron in Chaidamu Basin was 1341 BP, encoding 447 amino acid. CMO protein hydrophilic, secondary structure, subcellular localization, signal peptide, transmembrane helical region. The results of tertiary structure prediction showed that the CMO subcells of Haloxylon ammodendron in Chaidamu Basin were located in chloroplast and had no signal peptide. The protein secondary structure is mainly irregular curl. CMO protein has many kinds of functional sites, which provides a guarantee for the realization of protein function. In addition, CMO protein has strong hydrophilicity. The prediction results of three-dimensional structure of CMO protein of Haloxylon ammodendron in Chaidamu Basin show that the three-dimensional structure of CMO protein is composed of 偽 helix, 尾 folding and irregular coiling.
【作者單位】: 青海大學農(nóng)牧學院;
【基金】:青海省科技廳自然科學基金項目(2012-Z-938Q) “123高層次人才培養(yǎng)工程”項目
【分類號】:S792.99
【正文快照】: 梭梭(Haloxylon ammodendron)為藜科(Che-nopodiaceae)梭梭屬(Haloxylon Bunge)多年生小喬木,主要分布在我國新疆、內(nèi)蒙古、甘肅、青海的半荒漠和荒漠地區(qū)。梭梭具有很強的抗旱性[1],是柴達木盆地旱生、鹽生荒漠植被組成的主體,也是當?shù)亓鲃由车刂卫淼南蠕h樹種[2]。在眾多的滲
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,本文編號:1475587
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