本文關(guān)鍵詞： 豬流行性腹瀉病毒 遼寧分離株 S基因 抗原表位 變異分析　出處：《中國獸醫(yī)學(xué)報(bào)》2017年08期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：為了解遼寧豬流行性腹瀉病毒(PEDV)來源及變異特性,經(jīng)PCR診斷,細(xì)胞分離,細(xì)胞病變觀察、RT-PCR以及S基因序列鑒定,成功分離1株P(guān)EDV毒株(LN-2015-1)。S基因序列分析顯示,與CV777毒株相比,除點(diǎn)突變外,分離株還出現(xiàn)最長9bp的插入,6bp的缺失和13bp連續(xù)突變。氨基酸也存在最長3aa插入和2aa缺失,同時(shí)存在4處連續(xù)3個(gè)及以上的氨基酸突變,抗原表位分析表明在5個(gè)表位區(qū)共發(fā)生16個(gè)氨基酸的突變。同源性分析顯示與HB-HA2015毒株的同源關(guān)系最近,序列相似性為99.2%,與2010年以來國內(nèi)外代表變異毒株同源性較高,達(dá)到98.5%~98.8%,而與2010年以前的傳統(tǒng)同源性較低,在93.2%~95.6%之間;進(jìn)化樹分析顯示該毒株與近年來國內(nèi)外流行的變異毒株屬于同一群,并且與HB-HA2015形成一小的分支,而與傳統(tǒng)毒株進(jìn)化距離較遠(yuǎn)。
[Abstract]:In order to understand the origin and variation characteristics of Liaoning porcine epidemic diarrhea virus (PEDVV), PCR diagnosis, cell isolation, cytopathic observation, RT-PCR and S gene sequence identification were performed. The sequence analysis of LN-2015-1N. S gene of one PEDV strain showed that, in addition to the point mutation, the longest 9 BP insertion was found in the isolated strain compared with the CV777 strain. 6 BP deletion and 13 BP continuous mutation. The amino acid also had the longest 3 AA insertion and 2 AA deletion, and there were 4 consecutive 3 or more amino acid mutations. The antigenic epitope analysis showed that there were 16 amino acid mutations in 5 epitopes. Homology analysis showed that the homology with HB-HA2015 strain was the closest, the sequence similarity was 99.2%. The homology was higher than that of domestic and foreign representative mutant strains since 2010, reaching 98.5% and 98.8%, but lower than that of traditional strains before 2010 (93.2% or 95.6%). The phylogenetic tree analysis showed that the strain belonged to the same group as the mutant strain that had been prevalent in recent years, and formed a small branch with HB-HA2015, but it was far from the traditional strain.
【作者單位】： 錦州醫(yī)科大學(xué)畜牧獸醫(yī)學(xué)院;中國科學(xué)院微生物研究所;遼寧省動(dòng)物衛(wèi)生監(jiān)測預(yù)警中心;營口市動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心;
【基金】：遼寧省自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(2015010779) 遼寧省百千萬人才工程資助項(xiàng)目(2014921012)
【分類號(hào)】：S852.651
【正文快照】： 豬流行性腹瀉(porcine　epidemic　diarrhea,加入雙抗使終濃度青霉素100 U/mL、鏈霉素PED)是由豬流行性腹瀉病毒(porcine　epidemic　di-100mg/L,經(jīng)0.22μm濾膜過濾,-80℃保存?zhèn)溆谩rrhea　virus,PEDV)引起的以腹瀉、嘔吐、脫水和對1.2　主要材料　Trans　2KDNA　Marker、Tra

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