本文關(guān)鍵詞： 從江香豬 MEFD基因 SNP 啟動(dòng)子 生物信息學(xué)　出處：《中國畜牧雜志》2017年10期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：研究以從江香豬、杜×長(zhǎng)×大外三元雜交豬及貴州宗地花豬為研究對(duì)象,采用混合DNA池結(jié)合直接測(cè)序技術(shù)篩選豬MEF2D基因5'UTR及第1外顯子區(qū)SNPs位點(diǎn);同時(shí)利用生物信息學(xué)軟件分析SNPs位點(diǎn)對(duì)核心啟動(dòng)子區(qū)、Cp G島和轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)的影響。結(jié)果表明:在豬MEF2D基因5'UTR區(qū)共篩查到4個(gè)SNPs位點(diǎn),分別為A-511G、T-453A、T-242G和T-180A;生物信息學(xué)軟件預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn)T-453A和T-242G位點(diǎn)附近有重要轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)消失和新位點(diǎn)生成,據(jù)此推測(cè)豬MEF2D基因5'UTR區(qū)的T-453A和T-242G位點(diǎn)對(duì)調(diào)控啟動(dòng)子功能元件可能存在重要影響。
[Abstract]:In this study, Congjiang Xiang pig, du 脳 Chang 脳 Dawei three-way crossbred pig and Guizhou Zongdi Hua pig were taken as the research objects. Mixed DNA pool combined with direct sequencing was used to screen porcine MEF2D 5 UTR and SNPs locus in exon 1. At the same time, the core promoter region of SNPs locus was analyzed by bioinformatics software. The results showed that four SNPs loci were screened in the 5UR region of porcine MEF2D gene, which were A-511GnT-453A. T-242G and T-180A; Bioinformatics software predicted the disappearance of important transcription factor binding sites and the formation of new sites near T-453A and T-242G sites. It is inferred that the T-453A and T-242G loci in the 5UR region of porcine MEF2D gene may have important effects on the regulation of promoter functional elements.
【作者單位】： 貴州大學(xué)高原山地動(dòng)物遺傳育種與繁殖省部共建教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室貴州省動(dòng)物遺傳育種與繁殖重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室貴州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院;貴州省生豬健康養(yǎng)殖工程技術(shù)研究中心;貴州省種畜禽種質(zhì)測(cè)定中心;
【基金】：貴州大學(xué)引進(jìn)人才科研項(xiàng)目[貴大人基合字2013(21)號(hào)] 貴州省工程中心建設(shè)項(xiàng)目(黔科合農(nóng)C字[2011]4022號(hào))
【分類號(hào)】：Q78;S828
【正文快照】： 肌細(xì)胞增強(qiáng)因子2(Myocyte Enhancerfactor2,MEF2)是廣泛存在于肌肉細(xì)胞的DNA結(jié)合活性因子,可與大多數(shù)肌肉發(fā)育相關(guān)基因的啟動(dòng)子或增強(qiáng)子結(jié)合,激活其活性。MEF2基因家族的4個(gè)成員(MEF2A、MEF2B、MEF2C、MEF2D)即使是同一物種中也位于不同染色體上。Larsen等[1]將豬MEF2A、MEF2C

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1 趙慧,鄭文嶺,崔東,馬文麗;泛素啟動(dòng)子的研究進(jìn)展[J];廣東醫(yī)學(xué);2003年12期

2 況守龍;胡廷章;;啟動(dòng)子的克隆和研究方法[J];重慶工學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2007年01期

3 李志新;曹雙河;張相岐;張懷剛;;偽鵝觀草高分子量麥谷蛋白基因啟動(dòng)子的克隆[J];長(zhǎng)江大學(xué)學(xué)報(bào)(自科版)農(nóng)學(xué)卷;2007年02期

4 高剛;魯艷芹;韓金祥;趙麗;;雙啟動(dòng)子對(duì)增強(qiáng)型綠色熒光蛋白表達(dá)的影響[J];中國生物制品學(xué)雜志;2009年10期

5 郝迪，

本文編號(hào)：1469267