本文關(guān)鍵詞： 燒傷 免疫系統(tǒng)過程 差異表達基因 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)　出處：《南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報》2017年06期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：目的利用生物信息學(xué)方法對小鼠燒傷早期免疫細胞差異基因表達譜進行分析并檢測,篩選相關(guān)差異基因,以期找到潛在的診斷及治療靶標。方法從GEO數(shù)據(jù)庫中下載GSE7404數(shù)據(jù)集,通過配對樣本t檢驗、倍比法及GO功能富集分析篩選差異表達基因,應(yīng)用STRING數(shù)據(jù)庫及Cytoscape軟件構(gòu)建蛋白互作網(wǎng)絡(luò)篩選相關(guān)基因靶標,運用實時熒光定量PCR及Western blotting進行試驗驗證。結(jié)果在燒傷后第1天,有1825個基因被選出,其中上調(diào)基因658個,下調(diào)基因1167個。運用STRING數(shù)據(jù)庫及Cytoscape軟件構(gòu)建蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析,發(fā)現(xiàn)Stat1、Cdk1、Cd19、Lck及Jun基因在燒傷后免疫系統(tǒng)功能變化過程中可能起到重要作用。實時熒光定量PCR及Western blotting檢測顯示Stat1、Cdk1和Jun基因表達情況與分析結(jié)果相一致。結(jié)論通過對小鼠燒傷后早期全血游離白細胞基因芯片分析我們發(fā)現(xiàn)Stat1、Cdk1和Jun基因在燒傷早期免疫細胞功能變化的過程中發(fā)揮重要的作用,可能是燒傷早期診斷及治療的潛在的生物學(xué)靶標。
[Abstract]:Objective to analyze and detect the differential gene expression profiles of mouse immune cells in the early stage of burn by bioinformatics, and to screen the related differentially expressed genes. Methods GSE7404 data sets were downloaded from GEO database, and differentially expressed genes were screened by paired t-test, doubling analysis and go function enrichment analysis. STRING database and Cytoscape software were used to construct protein interaction network to screen related gene targets. Real-time fluorescence quantitative PCR and Western blotting were used to verify the results. Results on the first day after burn, 1825 genes were selected, of which 658 genes were up-regulated. STRING database and Cytoscape software were used to construct protein interaction network analysis. Lck and Jun genes may play an important role in the changes of immune system function after burn. Real-time fluorescence quantitative PCR and Western blotting detection show Stat1. The expression of Cdk1 and Jun genes was consistent with the results of the analysis. Conclusion Stat1 was found by gene microarray analysis of the whole blood free leukocytes in the early stage of burn in mice. Cdk1 and Jun genes play an important role in the changes of immune cell function in the early stage of burn and may be potential biological targets for early diagnosis and treatment of burn.
【作者單位】： 南方醫(yī)科大學(xué)南方醫(yī)院燒傷科;
【基金】：廣東省科技計劃項目(2014A020212189) 南方醫(yī)科大學(xué)南方醫(yī)院院長基金(2014B013) 廣州市科技計劃項目(201607010242)
【分類號】：R644
【正文快照】： 嚴重?zé)齻颊邆笕菀装l(fā)生多種難以控制的并發(fā)癥,尤其是全身炎癥反應(yīng)綜合征(SIRS)和多器官功能衰竭(MODS)甚至是死亡[1-2]。而導(dǎo)致諸多并發(fā)癥發(fā)生的各種原因中,免疫功能紊亂是其中的重要因素之一[2-3]。目前對于燒傷免疫方面的研究多是對免疫細胞、免疫因子的作用機制或感染、

【參考文獻】

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【共引文獻】

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本文編號：1465070