本文關(guān)鍵詞： 大黃屬CHS基因 密碼子偏愛(ài)性 GC GC ENC 最優(yōu)密碼子　出處：《分子植物育種》2017年06期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：為探究蓼科大黃屬物種CHS基因密碼子的偏愛(ài)性,鑒定出該類基因的最優(yōu)密碼子。利用EMBOSS、Codon W1.4.4和SPSS 17.0軟件對(duì)24條來(lái)源于大黃屬不同物種的CHS基因進(jìn)行多元統(tǒng)計(jì)分析,以深入研究其偏愛(ài)性。結(jié)果表明,大黃屬CHS基因密碼子的GC_3含量最高,其與GC_(12)的相關(guān)性檢驗(yàn)未達(dá)到顯著水平。ENC-plot分析顯示,24條CHS基因的ENC值均低于預(yù)期值。以上證明了自然選擇是CHS基因密碼子偏愛(ài)性形成的主導(dǎo)因素。篩選出的26個(gè)最優(yōu)密碼子中,17個(gè)密碼子的第3位堿基為G/C,表明CHS基因最優(yōu)密碼子偏愛(ài)以G/C結(jié)尾。
[Abstract]:In order to investigate the codon preference of CHS gene in Rheum species of Polygonaceae, the optimal codon of this kind of gene was identified. EMBOSS was used. Codon W1.4.4 and SPSS 17.0 software were used to analyze 24 CHS genes from different species of Rhubarb in order to study their preference. The GC_3 content of CHS gene codon was the highest in Rhubarb, and the correlation test between GC_3 and GCS-12) did not reach the significant level. ENC-plot analysis showed that the codon content of rhubarb gene was the highest. The ENC values of 24 CHS genes were all lower than the expected values, which proved that natural selection was the leading factor in the formation of codon preference of CHS gene. The third base of 17 codon is G / C, which indicates that the optimal codon of CHS gene ends with G / C.
【作者單位】： 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【基金】：四川農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院學(xué)科建設(shè)雙支項(xiàng)目,四川農(nóng)業(yè)大學(xué)雙支計(jì)劃共同資助
【分類號(hào)】：Q943.2
【正文快照】： The Codon Usage Analysis in CHS Gene within the Polygonaceae RheumMa Shengchao Yu Xinmei Yao Huipeng*College of Life Science,Sichuan Agricultural University,Ya'an,625014*Corresponding author,yaohuipeng0921@163.comYuzhong(Molecular Plant Breeding),15(6):2

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 袁哲明,王智,張永生,吉洪湖,歐陽(yáng)芳,文迪彪;線粒體和核基因密碼子的若干統(tǒng)計(jì)特征及其關(guān)聯(lián)[J];生命科學(xué)研究;2005年02期

2 楊平;周峰;張邊江;華春;;植物KCO基因密碼子使用特性[J];植物生理學(xué)報(bào);2012年11期

3 楊平;;擬南芥NHX基因密碼子使用特性分析[J];南京曉莊學(xué)院學(xué)報(bào);2011年06期

4 劉超洋;莊文穎;;子囊菌延長(zhǎng)因子1 alpha基因密碼子偏好性分析(英文)[J];菌物研究;2012年04期

5 汪福源;唐寧;楊平;;擬南芥POT基因密碼子使用特性分析[J];湖北農(nóng)業(yè)科學(xué);2013年04期

6 張濤;張跟喜;韓昆鵬;王金玉;樊慶燦;李婷婷;段煉;王永娟;;京海黃雞MyoG基因密碼子特性分析[J];華北農(nóng)學(xué)報(bào);2014年04期

7 王艷君;楊謙;;一種快速獲得基因密碼子偏愛(ài)性改造的方法——SOE-PCR[J];中國(guó)生物工程雜志;2008年08期

8 范三紅,郭藹光,單麗偉,胡小平;擬南芥基因密碼子偏愛(ài)性分析[J];生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展;2003年02期

9 杜新華;趙志輝;于浩;李俊雅;高雪;許尚忠;;線蟲(chóng)fat-1基因密碼子優(yōu)化設(shè)計(jì)[J];中國(guó)畜牧獸醫(yī);2010年10期

10 李國(guó)慶;范松;裴建軍;趙林果;高樹(shù)峰;;黑曲霉外切葡聚糖酶基因密碼子的優(yōu)化及表達(dá)[J];南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2012年04期

相關(guān)會(huì)議論文 前1條

1 韓大雄;趙玉芬;;核苷-5′-磷�；被嶙鳛槭中云鹪茨Ｐ偷难芯縖A];中國(guó)空間科學(xué)學(xué)會(huì)第七次學(xué)術(shù)年會(huì)會(huì)議手冊(cè)及文集[C];2009年

，

本文編號(hào)：1465031