本文關(guān)鍵詞： 日本沼蝦 表皮蛋白 基因克隆 表達 KK-　出處：《水產(chǎn)科學(xué)》2017年06期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：為探究甲殼動物表皮蛋白多樣性及其功能,根據(jù)表皮轉(zhuǎn)錄組資料,利用RACE技術(shù)擴增得到日本沼蝦表皮蛋白-5基因的cDNA全長序列,分析其生物信息學(xué)、不同蛻皮時期的表達特征以及KK-42對其表達特征的影響。日本沼蝦表皮蛋白-5基因的cDNA全長796bp,開放閱讀框477bp,編碼158個氨基酸,含RR基序,預(yù)測蛋白等電點為4.22,分子量為16.46ku;氨基酸序列比對發(fā)現(xiàn)日本沼蝦表皮蛋白-5與克氏原螯蝦Casp-2相似性最高,為76%,與其他甲殼動物表皮蛋白相似性為41%~53%。實時熒光定量PCR結(jié)果顯示,日本沼蝦表皮蛋白-5基因在3個時期——蛻皮間期、蛻皮前早期和蛻皮前晚期均有表達,其中在脫皮前晚期的相對表達量最高,為蛻皮間期的1400倍,與之有極顯著差異(P0.01)。KK-42處理顯著上調(diào)日本沼蝦表皮蛋白-5基因在蛻皮前早期的表達,在處理后3、6h和48h表達量分別是對照組的6.3、4.8和11.4倍。KK-42誘導(dǎo)日本沼蝦表皮蛋白-5基因的表達,使峰值前移,這可能是KK-42縮短日本沼蝦幼蝦蛻皮周期的機制之一。
[Abstract]:In order to explore the diversity and function of crustacean epidermal protein, the full-length cDNA sequence of the epidermal protein-5 gene of Macrobrachium japonicus was amplified by RACE based on the data of epidermal transcriptome. The bioinformatics, the expression characteristics of different molting stages and the effect of KK-42 on its expression were analyzed. The cDNA of the epidermal protein-5 gene of Macrobrachium japonicus was 796bp in length. Open reading frame 477bp, encoding 158 amino acids, containing RR motifs, predicted protein isoelectric point 4.22, molecular weight 16.46ku. Amino acid sequence alignment showed that the Casp-2 similarity between Macrobrachium nipponensis epidermis protein -5 and Prochelia claricarpa was the highest (76%). The similarity of epidermal protein with other crustaceans was 41 and 53. The results of real-time fluorescence quantitative PCR showed that the epidermal protein 5 gene of Macrobrachium japonicus was at three stages of ecdysis. The relative expression was highest in the early stage of premolting and in the late stage of molting, which was 1400 times of that in the interphase of molting. KK-42 significantly up-regulated the expression of epidermal protein-5 gene of Macrobrachium japonicus in the early stage of premolting. At 6h and 48h, the expression of epidermal protein-5 gene in Macrobrachium japonicus was induced by 6.3N 4.8 and 11.4 times as much as that of control group, and the peak value was moved forward. This may be one of the mechanisms by which KK-42 shortens the molting cycle of juvenile Macrobrachium japonicus.
【作者單位】： 河南師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【基金】：河南省基礎(chǔ)與前沿技術(shù)研究項目(142300410021)
【分類號】：S917.4
【正文快照】： 由于堅硬表皮的限制,甲殼動物必須經(jīng)過蛻皮才能生長,蛻皮是一個周期性的動態(tài)過程,包括舊表皮降解和新表皮的形成。作為表皮組成成分的幾丁質(zhì)是和蛋白質(zhì)以結(jié)合的形式存在,此蛋白即為表皮蛋白(CPs),是甲殼動物表皮中重要的結(jié)構(gòu)性蛋白,由蛻皮激素的靶組織——表皮上皮細胞按照一

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本文編號：1457770