本文關(guān)鍵詞： 胡楊 異形葉 發(fā)育相關(guān)基因 表達(dá)模式 作用　出處：《基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)》2017年11期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：為了闡明胡楊異形葉發(fā)生的分子機(jī)制,本研究以胡楊披針形葉和寬卵形葉為材料,通過RNA-seq分析了上述兩種葉形的基因表達(dá)譜,發(fā)現(xiàn)在胡楊異形中發(fā)生的4個時期中,共有3 991個基因在兩種葉形中差異表達(dá),利用權(quán)重基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析(WGCNA)發(fā)現(xiàn)一個含有583個基因的模塊與葉形指數(shù)高度相關(guān)(r=0.93,p=0.004)。然后我們用Gene Ontology對這些基因的功能進(jìn)行了注釋和富集,發(fā)現(xiàn)其中有40個基因與發(fā)育密切相關(guān)。這40個基因的表達(dá)模式和功能分析表明,這些基因可以通過參與極性建成、細(xì)胞增殖、細(xì)胞生長、信號傳導(dǎo)和代謝等生物學(xué)過程在胡楊異形葉發(fā)生中起重要作用。因此,我們的研究有助于進(jìn)一步完善葉形發(fā)育的調(diào)控機(jī)制。
[Abstract]:In order to elucidate the molecular mechanism of heteromorphic leaves of Populus euphratica, the gene expression profiles of these two leaves were analyzed by RNA-seq using lanceolate leaves and broad ovate leaves of Populus euphratica as materials. A total of 3 991 genes were found to be differentially expressed in the two leaf shapes in the four stages in which the abnormal shapes of Populus euphratica occurred. A model containing 583 genes was found to be highly correlated with leaf shape index by using weighted gene coexpression network analysis (WGCNA). Then we used Gene Ontology to annotate and enrich the function of these genes. It was found that 40 genes were closely related to development, and the expression patterns and functional analysis of these 40 genes showed that these genes could be involved in polarity building, cell proliferation and cell growth. Biological processes such as signal transduction and metabolism play an important role in the development of heteromorphic leaves of Populus euphratica.
【作者單位】： 塔里木大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;兵團(tuán)塔里木盆地生物資源保護(hù)利用重點實驗室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(No.31660298;No.31260275) 塔里木大學(xué)校長基金博士項目(TDZKBS201501)共同資助
【分類號】：Q943.2;S792.11
【正文快照】： *通訊作者,lifengz2011@126.comExpression Patterns and Functions of Genes Related to the Development ofPopulus euphratica Oliv.Heteromorphic Leaves MorphogenesisQin Shaowei1Li Cailin1Guo Zhongzhong1Bao Lianghong1Jiang Renjun1,2Zhang Na1Liu Zhanwen1Zhao Lif

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本文編號：1452843