Zip轉(zhuǎn)錄因子家族抗旱相關(guān)基因的鑒定及Zmhdz10功能分析
本文關(guān)鍵詞:玉米HD-Zip轉(zhuǎn)錄因子家族抗旱相關(guān)基因的鑒定及Zmhdz10功能分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
《安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)》 2013年
玉米HD-Zip轉(zhuǎn)錄因子家族抗旱相關(guān)基因的鑒定及Zmhdz10功能分析
趙陽(yáng)
【摘要】:玉米是世界上重要的糧食作物之一,干旱、鹽漬、低溫等非生物脅迫對(duì)玉米的生長(zhǎng)造成了嚴(yán)重的影響,也是限制其產(chǎn)量的主要脅迫因素,抗逆育種一直是重要的育種目標(biāo)。挖掘抗逆相關(guān)功能基因并利用這些基因培育抗逆新品種是應(yīng)對(duì)逆境脅迫,提高玉米產(chǎn)量的最為有效途徑。研究表明,轉(zhuǎn)錄因子在提高作物對(duì)脅迫的耐受性過(guò)程中起到了重要作用。過(guò)量表達(dá)特定的脅迫應(yīng)答轉(zhuǎn)錄因子可以調(diào)控多個(gè)下游抗逆功能基因的同時(shí)表達(dá),從而使作物獲得良好的綜合改良效果。目前,這種方法已經(jīng)成為植物抗逆遺傳改良育種中的研究熱點(diǎn)。同源異型-亮氨酸拉鏈(HD-Zip)蛋白是高等植物特異的一類轉(zhuǎn)錄因子,參與了植物的脅迫應(yīng)答和生長(zhǎng)發(fā)育調(diào)控。因此,挖掘脅迫應(yīng)答HD-Zip基因?qū)﹂_(kāi)展玉米抗逆改良育種具有重要的意義。本研究運(yùn)用生物信息學(xué)的方法對(duì)玉米全基因組HD-Zip基因進(jìn)行鑒定,分析這些基因的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)、進(jìn)化關(guān)系以及干旱誘導(dǎo)表達(dá)模式,并通過(guò)過(guò)量表達(dá)技術(shù)對(duì)玉米Zmhdz10基因在植物非生物脅迫應(yīng)答過(guò)程中的功能及作用機(jī)制進(jìn)行了研究,獲得了如下主要結(jié)果: 1.通過(guò)Blast同源搜索,共鑒定了55個(gè)非重復(fù)的玉米HD-Zip基因家族成員并從基因結(jié)構(gòu)和進(jìn)化等方面進(jìn)行了分析。研究發(fā)現(xiàn),玉米HD-Zip家族的大部分基因序列高度保守,與擬南芥和水稻HD-Zip基因在結(jié)構(gòu)上不存在明顯差異。根據(jù)進(jìn)化關(guān)系,55個(gè)玉米HD-Zip基因被進(jìn)一步分為4個(gè)亞族(I-IV)。染色體定位分析顯示,55個(gè)基因在10條染色體上的分布是非隨機(jī)的。對(duì)玉米HD-Zip基因復(fù)制事件進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)參與片段復(fù)制的基因占玉米HD-Zip基因總數(shù)的62%,表明片段復(fù)制對(duì)玉米HD-Zip基因數(shù)量的擴(kuò)張起到了重要作用。 2.對(duì)17個(gè)HD-Zip I基因上游2kb啟動(dòng)子序列的抗逆相關(guān)順式作用元件(ABRE,LTRE和DRE)進(jìn)行了分析,發(fā)現(xiàn)除Zmhdz16外,其余16個(gè)基因的啟動(dòng)子區(qū)域均含有1到多個(gè)抗逆相關(guān)順式作用元件。對(duì)復(fù)制基因啟動(dòng)子區(qū)域內(nèi)的3種順式作用元件的分布進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)三種順式作用元件在復(fù)制基因啟動(dòng)子區(qū)域內(nèi)的數(shù)量和位置有較大的差異。利用熒光定量PCR方法對(duì)HD-Zip I基因的干旱誘導(dǎo)表達(dá)模式進(jìn)行了分析,發(fā)現(xiàn)有12個(gè)基因的表達(dá)顯著上調(diào),,其它5個(gè)基因表達(dá)下調(diào)。對(duì)復(fù)制基因的干旱誘導(dǎo)表達(dá)模式進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)復(fù)制基因的表達(dá)模式總體較為相似,說(shuō)明這些基因可能存在著基因功能的冗余現(xiàn)象。 3.根據(jù)進(jìn)化關(guān)系和干旱誘導(dǎo)表達(dá)模式,篩選了一個(gè)受干旱強(qiáng)烈誘導(dǎo)表達(dá)的候選基因Zmhdz10并從玉米自交系B73中克隆了該基因。序列分析顯示,Zmhdz10基因cDNA全長(zhǎng)為825bp,編碼274個(gè)氨基酸,與玉米B73數(shù)據(jù)庫(kù)中公布的序列完全一致。進(jìn)一步的表達(dá)分析發(fā)現(xiàn)Zmhdz10的表達(dá)還受到鹽和外源ABA的誘導(dǎo)。組織表達(dá)模式分析顯示,Zmhdz10在根、莖、葉、果穗、雄花序、幼芽和花絲7個(gè)組織中均有表達(dá),其中在葉中的表達(dá)量最高。通過(guò)基因槍轟擊洋蔥表皮細(xì)胞的瞬時(shí)表達(dá)分析顯示,Zmhdz10-GFP融合表達(dá)蛋白定位在細(xì)胞核中。酵母雜交實(shí)驗(yàn)表明,Zmhdz10在酵母細(xì)胞中能夠激活報(bào)告基因的表達(dá),能夠?qū)Ψ聪蛑貜?fù)序列CAAT(A/T)ATTG發(fā)生特異性的結(jié)合。 4.過(guò)量表達(dá)Zmhdz10的轉(zhuǎn)基因植株在生長(zhǎng)表型上與對(duì)照植株沒(méi)有明顯差異。在干旱和鹽脅迫處理后,Zmhdz10轉(zhuǎn)基因水稻表現(xiàn)出對(duì)脅迫較強(qiáng)的耐受性。通過(guò)對(duì)相對(duì)電解質(zhì)滲透率、丙二醛含量和脯氨酸含量等生理生化指標(biāo)進(jìn)行測(cè)定,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因植株在脅迫條件下的相對(duì)電解質(zhì)滲透率和丙二醛含量低于野生型植株,脯氨酸含量高于野生型植株。另外,ABA敏感性實(shí)驗(yàn)顯示Zmhdz10過(guò)量表達(dá)轉(zhuǎn)基因植株顯著提高了對(duì)外源ABA的敏感性。 5. Zmhdz10過(guò)量表達(dá)的轉(zhuǎn)基因擬南芥植株同樣表現(xiàn)出對(duì)干旱和鹽脅迫較強(qiáng)的適應(yīng)性和忍耐力。通過(guò)對(duì)P5CS1、RD22、RD29B和ABI14個(gè)脅迫/ABA應(yīng)答功能基因的表達(dá)分析發(fā)現(xiàn),在干旱條件下,這些抗逆功能基因在轉(zhuǎn)基因擬南芥中的表達(dá)量顯著高于野生型植株,表達(dá)被激活。對(duì)參與非依賴ABA信號(hào)傳導(dǎo)途徑的ERD1表達(dá)分析顯示,該基因在野生型和轉(zhuǎn)基因植株中的表達(dá)沒(méi)有顯著差異。 綜上所述,本研究通過(guò)Blast同源搜索,在玉米全基因組水平上共鑒定了55個(gè)HD-Zip基因。根據(jù)基因結(jié)構(gòu)、進(jìn)化和干旱誘導(dǎo)表達(dá)模式等分析結(jié)果,克隆了Zmhdz10基因并對(duì)其分子生物學(xué)特性進(jìn)行分析。過(guò)量表達(dá)該基因顯著提高了轉(zhuǎn)基因植株耐旱和耐鹽性,為利用基因工程的方法改良作物的抗逆性提供了優(yōu)良的基因資源。同時(shí),轉(zhuǎn)基因植株對(duì)ABA的敏感性的增加和脅迫/ABA應(yīng)答功能基因的表達(dá)上調(diào),表明該基因主要通過(guò)ABA信號(hào)傳導(dǎo)途徑調(diào)控抗逆功能基因的表達(dá),從而提高轉(zhuǎn)基因植株的耐旱和耐鹽性。
【關(guān)鍵詞】:
【學(xué)位授予單位】:安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號(hào)】:S513
【目錄】:
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【參考文獻(xiàn)】
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6 吳小萍;席夢(mèng)利;施季森;;麝香百合LLGLO1基因的克隆和表達(dá)[J];植物生理學(xué)通訊;2006年05期
7 劉運(yùn)華;劉灶長(zhǎng);周立國(guó);余舜武;劉鴻艷;羅利軍;;干旱脅迫下耐旱稻中旱3號(hào)全長(zhǎng)cDNA文庫(kù)的構(gòu)建[J];分子植物育種;2007年03期
8 呂志一;孫健紅;徐薇;蘇峰;權(quán)富生;華松;張涌;;小鼠2細(xì)胞胚胎基因表達(dá)譜分析[J];西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào);2010年06期
9 單長(zhǎng)卷;劉潤(rùn)強(qiáng);張勝利;;植物水分與抗旱分子生物學(xué)的發(fā)展及其影響[J];河南科技學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2011年03期
10 曾華宗,鄭成木;甘蔗抗旱生理測(cè)驗(yàn)及BADH基因PCR擴(kuò)增的研究[J];熱帶作物學(xué)報(bào);2003年01期
中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 何慧慧;嚴(yán)繼舟;;Hox基因表達(dá)模式對(duì)成體干細(xì)胞遷移和巢居的影響[A];“細(xì)胞活動(dòng) 生命活力”——中國(guó)細(xì)胞生物學(xué)學(xué)會(huì)全體會(huì)員代表大會(huì)暨第十二次學(xué)術(shù)大會(huì)論文摘要集[C];2011年
2 閻愛(ài)華;張韞瑋;張立峰;劉猛;王冬梅;;葉銹菌侵染早期TcLr19 SSH文庫(kù)構(gòu)建及ESTs序列分析[A];中國(guó)植物生理學(xué)會(huì)第十次會(huì)員代表大會(huì)暨全國(guó)學(xué)術(shù)年會(huì)論文摘要匯編[C];2009年
3 劉建斌;郎俠;郭健;楊博輝;孫曉萍;岳耀敬;馮瑞林;;心臟型脂肪酸結(jié)合蛋白基因研究進(jìn)展[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)養(yǎng)羊?qū)W分會(huì)全國(guó)養(yǎng)羊生產(chǎn)與學(xué)術(shù)研討會(huì)議論文集[C];2010年
4 廖為儀;朱曉彤;束剛;王松波;高萍;江青艷;;雞不同部位脂肪前體細(xì)胞分化及相關(guān)基因表達(dá)模式的差異[A];全國(guó)動(dòng)物生理生化第十一次學(xué)術(shù)交流會(huì)論文摘要匯編[C];2010年
5 張修國(guó);馮寶珍;王和美;;辣椒疫霉菌效應(yīng)蛋白NPP基因家族致病遺傳機(jī)制及其功能分析[A];中國(guó)菌物學(xué)會(huì)第五屆會(huì)員代表大會(huì)暨2011年學(xué)術(shù)年會(huì)論文摘要集[C];2011年
6 李文學(xué);劉剛;柴春利;魯成;;家蠶mago nashi基因的克隆、序列分析及原核表達(dá)研究[A];中國(guó)蠶學(xué)會(huì)第六屆青年學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集(1)[C];2009年
7 金志強(qiáng);;人類基因組計(jì)劃——從基因組到后基因組[A];中國(guó)熱帶作物學(xué)會(huì)六屆二次理事會(huì)暨學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2000年
8 陳思;黃欣;陳少華;楊力建;鄭海濤;李揚(yáng)秋;;BCL11B基因在T細(xì)胞分化和增殖中調(diào)節(jié)作用的研究[A];中國(guó)病理生理學(xué)會(huì)第九屆全國(guó)代表大會(huì)及學(xué)術(shù)會(huì)議論文摘要[C];2010年
9 郝香芬;曾小明;夏機(jī)良;顏孫興;劉曉明;彭白露;;食蟹猴糖尿病模型不同時(shí)期相關(guān)基因表達(dá)模式[A];第九屆中國(guó)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物科學(xué)年會(huì)(2010新疆)論文集[C];2010年
10 裴軍;;用基因芯片尋找差異表達(dá)基因[A];中國(guó)生物工程學(xué)會(huì)第三次全國(guó)會(huì)員代表大會(huì)暨學(xué)術(shù)討論會(huì)論文摘要集[C];2001年
中國(guó)重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前7條
1 陸志城;[N];醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)報(bào);2002年
2 麥迪信;[N];醫(yī)藥經(jīng)濟(jì)報(bào);2003年
3 雷毅;[N];科技日?qǐng)?bào);2000年
4 本報(bào)記者 楊曙光;[N];農(nóng)民日?qǐng)?bào);2009年
5 記者 解悅 通訊員 周景山;[N];南京日?qǐng)?bào);2009年
6 記者 束洪福;[N];科技日?qǐng)?bào);2009年
7 記者 張秀華;[N];上?萍紙(bào);2011年
中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 趙陽(yáng);玉米HD-Zip轉(zhuǎn)錄因子家族抗旱相關(guān)基因的鑒定及Zmhdz10功能分析[D];安徽農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年
2 張中保;玉米抗旱相關(guān)基因的克隆與功能分析[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2010年
3 時(shí)桂芹;家蠶抗氧化基因注釋及功能研究[D];重慶大學(xué);2013年
4 張翠翠;水稻可塑性基因RPL1的分離與鑒定[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年
5 張洪映;小麥逆境應(yīng)答基因TaSnRK2.8的克隆與分析[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2011年
6 孫立平;玉米胞質(zhì)Ⅰ類小分子量熱激蛋白基因ZmHSP16.9的分離及功能分析[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年
7 鄒央云;酵母倍增基因功能分化機(jī)制研究[D];復(fù)旦大學(xué);2011年
8 張東;轉(zhuǎn)fat-1基因體細(xì)胞克隆綿羊的研究[D];內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年
9 王澤英;Clusterin基因在奶牛乳腺炎中的作用及表達(dá)調(diào)控機(jī)制[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年
10 王強(qiáng);局部疊加基因表達(dá)模式聚類分析方法研究[D];哈爾濱工業(yè)大學(xué);2012年
中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 肖慶生;甘藍(lán)型油菜抗旱相關(guān)基因的表達(dá)分析[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2011年
2 劉春慧;基于GSEA分析的犬膨大性心肌癥關(guān)鍵基因通路篩選[D];上海交通大學(xué);2012年
3 李慧;果蠅Hox基因系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系分析[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2011年
4 李萍;玉米淀粉合成關(guān)鍵基因Brittle-2表達(dá)模式分析及啟動(dòng)子關(guān)鍵區(qū)域鑒定[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年
5 連愛(ài)娥;基于基因本體(GO)的基因語(yǔ)義相似性度量方法的研究及應(yīng)用[D];上海師范大學(xué);2010年
6 丁健;spoT基因在幽門螺桿菌定植過(guò)程中的功能研究[D];山東大學(xué);2010年
7 郭寶平;SATB1基因與乳腺癌的關(guān)系研究[D];廣西醫(yī)科大學(xué);2011年
8 郭小毛;Igf2基因在克隆胚胎早期發(fā)育過(guò)程中異常印記模式的研究[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年
9 張旭;人HSPC117基因?qū)?xì)胞遷移行為影響及基因表觀調(diào)控的初步研究[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年
10 萬(wàn)喬;甘藍(lán)型油菜抗旱相關(guān)基因BnBiP的克隆與功能鑒定[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年
本文關(guān)鍵詞:玉米HD-Zip轉(zhuǎn)錄因子家族抗旱相關(guān)基因的鑒定及Zmhdz10功能分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號(hào):142951
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