RNA甲基化酶TRDMT1基因敲除及其功能初探
發(fā)布時間:2024-07-02 21:54
RNA甲基化作為一種表觀遺傳標記,在基因調控中發(fā)揮著重要作用。至今為止,已發(fā)現RNA存在著100多種修飾,其中甲基化是主要的修飾形式,6-甲基腺嘌呤(m6A)和5-甲基胞嘧啶(m5C)是最具有代表性的兩種甲基化修飾。有研究表明RNAm5C修飾在生物體的發(fā)育以及癌癥的發(fā)生中起重要作用。最初被認為是DNA甲基轉移酶的TRDMT1(tRNA aspartic acid methyltransferase 1)近十年來被證實是RNA m5C甲基轉移酶,催化tRNA產生5-甲基胞嘧啶修飾。最近有研究發(fā)現TRDMT1基因對器官形成、生物體的發(fā)育以及疾病的發(fā)生有影響。然而,對TRDMT1調控這些過程的分子機制尚不清楚。本研究利用CRISPR/Cas9誘導的同源重組技術在RNA甲基化酶TRDMT1基因的轉錄起始位點上敲入轉錄終止序列BGH ploy(A),終止TRDMT1的表達從而達到敲除的目的。通過構建TRDMT1敲除的HEK293細胞系,研究TRDMT1去表達對細胞表型以及其他基因表達的影響,從而了解TRDMT1基因的功能,為研究RNAm5C甲基化的功能提供新思路。主要的研究方法與結果如下:1、建...
【文章頁數】:78 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
本文編號:4000069
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圖1-1?CRISPR7Cas9系統的作用原理(引用)??Fig.?1-1?The?principle?of?action?of?CRISPR/Cas9?system??
被改編為一個基因編輯工具,改造后的系統包含兩部分:向導RNA?(single?guide?RNA,??sgRNA)和Cas9蛋白。sgRNA是人工合成的一段能夠識別目標序列的RNA序列,其中包??含招募Cas9蛋白的crRNA-tracrRNA復合體的發(fā)夾結構。作用原理如圖1-1....
圖2-1?gRNA和檢測引物位置示意圖??.-
2.2.1獲得同源重組片段LOXN-Puro??利用PCR的方法在Puro-BGH?poly?(A)片段5’端添加T2A和LOXN序列,構建同源??重組片段LOXN-Puro?(圖2-2)。以pSMPUW-IRES-Puro載體為模板,使用高保真酶(Phanta???Super-....
圖2-2LC)RN-Pwo結構以及PCR引物位置示意圖
圖2-1?gRNA和檢測引物位置示意圖??Fig.2-1?Schematic?diagram?of?gRNA?and?primer?position??2.2構建TRDMTl-LOXN-Puro同源重組載體??2.2.1獲得同源重組片段LOXN-Puro??利用PCR的方法在Pu....
圖2-3?TRDMT1-LR結構以及PCR引物位置示意圖??
?2.2.2擴增左端同源臂TRDMT1-LR??利用引物擴增靶位點左端同源臂TRDMT1-LR?(圖2-3)。具體實驗方法如下:??(1)
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