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西門(mén)塔爾牛瘤胃木聚糖酶基因的克隆及相關(guān)序列分析

發(fā)布時(shí)間:2017-12-30 00:36

  本文關(guān)鍵詞:西門(mén)塔爾牛瘤胃木聚糖酶基因的克隆及相關(guān)序列分析 出處:《中國(guó)生物制品學(xué)雜志》2016年02期  論文類(lèi)型:期刊論文


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【摘要】:目的克隆西門(mén)塔爾牛(Simmental)瘤胃木聚糖酶基因Rua11A,并進(jìn)行相關(guān)序列分析。方法采用巢式PCR及單側(cè)PCR技術(shù)從西門(mén)塔爾牛瘤胃微生物宏基因組DNA內(nèi)直接克隆木聚糖酶基因Rua11A,并利用生物信息學(xué)軟件對(duì)該基因序列及其編碼氨基酸序列進(jìn)行預(yù)測(cè)和分析。結(jié)果拼接后獲得了1 278 bp的Rua11A編碼區(qū)DNA序列,包括762 bp的木聚糖酶編碼區(qū)、102 bp的連接序列編碼區(qū)和411 bp的碳水化合物結(jié)合域(carbohydrate binding module,CBM)編碼區(qū),共編碼425個(gè)氨基酸。氨基酸序列N-末端有1處富含疏水性氨基酸,不存在跨膜結(jié)構(gòu)域;包含31個(gè)氨基酸的信號(hào)肽(signal peptide)及394個(gè)氨基酸的成熟肽(mature peptide),且理化性質(zhì)穩(wěn)定;預(yù)測(cè)的Rua11A空間結(jié)構(gòu)具有11家族木聚糖酶的典型特征,屬于CBM第四家族;含有11家族木聚糖酶高度保守的氨基酸片段及催化活性中心(catalytic active center)。結(jié)論成功克隆了西門(mén)塔爾牛瘤胃木聚糖酶基因Rua11A,并進(jìn)行了相關(guān)序列分析,為Rua11A的異源高效表達(dá)及分子改造奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:......
【作者單位】: 揚(yáng)州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;云南省草地動(dòng)物科學(xué)研究院;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(31472067) 國(guó)家重點(diǎn)863項(xiàng)目(2013-AA102505-5) 云南省重大基礎(chǔ)研究計(jì)劃(2013FC004) 江蘇省高校自然科學(xué)研究面上項(xiàng)目資助(15KJB230004) 揚(yáng)州大學(xué)科技創(chuàng)新培育基金(2015CXJ055)
【分類(lèi)號(hào)】:Q78
【正文快照】: 木聚糖(xylan)是植物細(xì)胞壁中半纖維素(he-micellulose)的重要組分,約占細(xì)胞干重的35%,是自然界中繼纖維素(cellulose)之后含量最豐富的可再生生物資源[1]。由于木聚糖結(jié)構(gòu)的復(fù)雜性,將其徹底水解需要一系列酶的協(xié)同作用,其中最關(guān)鍵的酶是β-1,4-內(nèi)切木聚糖酶(β-1,4-endoxylan

【共引文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前2條

1 林源清;張光亞;;G/11木聚糖酶最適pH值的預(yù)測(cè)及其與氨基酸位置的關(guān)系[J];華僑大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2014年03期

2 張獻(xiàn)偉;張冠冠;吳珍芳;孟繁明;劉德武;張茂;許衛(wèi)華;鄭恩琴;賀曉燕;李真;李紫聰;;木聚糖酶-甘露聚糖酶融合酶基因Linker優(yōu)化及其在豬腎pK15細(xì)胞中共表達(dá)[J];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué);2013年22期

相關(guān)博士學(xué)位論文 前4條

1 李中媛;綿羊瘤胃環(huán)境木聚糖酶和植酸酶轉(zhuǎn)錄水平基因多樣性分析和幾個(gè)新穎木聚糖酶和植酸酶的研究[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2013年

2 張慧敏;計(jì)算機(jī)輔助設(shè)計(jì)提高宇佐美曲霉GHF11木聚糖酶熱穩(wěn)定性的研究[D];江南大學(xué);2013年

3 湯海鷗;NSP復(fù)合酶優(yōu)化及在肉雞日糧中高劑量添加效果研究[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2013年

4 安嬌;糖苷水解酶與酯水解酶穩(wěn)定性和底物選擇性調(diào)控的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)[D];吉林大學(xué);2015年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前1條

1 王燕;嗜熱木聚糖酶的基因克隆、蛋白表達(dá)及突變研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 方洛云,鄒曉庭,許梓榮;木聚糖酶基因的分子生物學(xué)與基因工程[J];畜禽業(yè);2002年02期

2 張世敏;劉寅;劉新育;陳紅歌;王會(huì)娟;崔黨群;;木聚糖酶基因研究進(jìn)展[J];微生物學(xué)雜志;2006年04期

3 張桂敏;饒r,

本文編號(hào):1352597


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