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草莓葉片中5種新microRNA的RT-PCR鑒定及靶基因分析

發(fā)布時(shí)間:2017-12-23 18:29

  本文關(guān)鍵詞:草莓葉片中5種新microRNA的RT-PCR鑒定及靶基因分析 出處:《沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)》2016年02期  論文類型:期刊論文


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【摘要】:micro RNA(miRNA)是來自真核生物自身基因組的非編碼小分子RNA,在轉(zhuǎn)錄后水平上負(fù)調(diào)控基因表達(dá),在植物的生長發(fā)育和脅迫應(yīng)答等方面起重要作用。以栽培草莓艷麗為試材,利用RT-PCR技術(shù)克隆草莓葉片中5種新miRNA的前體及靶基因,分析靶基因的結(jié)構(gòu)特征與功能,結(jié)果表明:草莓mi R-6,mi R-12,mi R-13,mi R-14,mi R-29的前體長度分別為513 bp,309 bp,464bp,334 bp和343 bp,均能形成典型的莖環(huán)結(jié)構(gòu),其中mi R-12、mi R-13的成熟miRNA序列在莖環(huán)3'端臂上,mi R-6、mi R-14、mi R-29成熟miRNA序列在莖環(huán)的5'端臂上。mi R-14與mi R-29的靶基因分別為854bp和690bp,與森林草莓基因組對(duì)應(yīng)序列一致性為98.72%和99.42%,其中mi R-29靶基因是GRP基因,編碼143個(gè)氨基酸,推測mi R-29靶基因在草莓植株的脅迫響應(yīng)中有重要調(diào)控作用。本研究豐富了草莓miRNA的研究,為揭示草莓miRNA的生物學(xué)功能奠定基礎(chǔ)。
【作者單位】: 遼寧省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所;沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院/設(shè)施園藝省部共建教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:遼寧省高等學(xué)校杰出青年學(xué)者成長計(jì)劃項(xiàng)目(LJQ2014069) 國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31101524)
【分類號(hào)】:S668.4
【正文快照】: micro RNA(mi RNA)是生物體中普遍存在的一種內(nèi)源性非編碼小分子RNA,長度多數(shù)在21~24 nt[1]。mi RNA在植物器官生長發(fā)育,激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),細(xì)菌、病毒侵染及其他非生物脅迫等過程中均起重要作用[2-4]。植物mi R-NA是由mi RNA基因在RNA聚合酶Ⅱ的作用下形成原初轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物(Pri-mi RNA

【參考文獻(xiàn)】

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1 陳璇;曾千春;張家瑞;胡尊紅;李文正;;煙草屬RGP-3基因克隆及多樣性分析[J];西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào);2014年03期

2 潘妍;王玉成;張大偉;楊傳平;;二色補(bǔ)血草LbGRP基因的克隆及抗逆能力分析[J];遺傳;2010年03期

3 劉宗旨,王建龍,王群,黃勛,徐衛(wèi)輝,朱立煌,何平,方榮祥;Structure, expression pattern and chromosomal localization of the rice Osgrp-2 gene[J];Science in China(Series C:Life Sciences);2003年06期

相關(guān)博士學(xué)位論文 前1條

1 李賀;草莓microRNA的鑒定及差異表達(dá)研究[D];沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué);2009年

【共引文獻(xiàn)】

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1 張馨宇;戚華彩;董向向;李賀;張志宏;;草莓葉片中5種新microRNA的RT-PCR鑒定及靶基因分析[J];沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2016年02期

2 張靜;范娟;;擬南芥和小菜蛾相互作用的差異蛋白分析[J];黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)學(xué)報(bào);2015年02期

3 周偉;吳憲;賈承國;胡瑞雪;杜茜;李啟云;潘洪玉;;山葡萄轉(zhuǎn)錄因子基因VaDREB的克隆及其抗逆功能分析[J];植物生理學(xué)報(bào);2014年10期

4 王琳珊;馬麗;吳文龍;李維林;;補(bǔ)血草屬植物資源的耐鹽性研究進(jìn)展[J];西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2014年09期

5 陳璇;曾千春;張家瑞;胡尊紅;李文正;;煙草屬RGP-3基因克隆及多樣性分析[J];西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào);2014年03期

6 王慧敏;龍瑞才;沈益新;康俊梅;張鐵軍;張瑜;楊青川;;紫花苜蓿MsRBP基因的克隆、分析及煙草的遺傳轉(zhuǎn)化[J];草地學(xué)報(bào);2013年02期

7 畢江濤;潘潤霞;黃盼盼;呂雯;關(guān)曉慶;;藥用植物二色補(bǔ)血草內(nèi)生真菌分離及其抑菌活性初步研究[J];西北植物學(xué)報(bào);2012年12期

8 張大勇;胡國民;易金鑫;許玲;Ali ZULFIQAR;劉曉慶;袁玲玲;徐照龍;何曉蘭;黃益洪;馬鴻翔;;大豆GmTIP1;1基因的克隆與表達(dá)分析[J];作物學(xué)報(bào);2013年01期

9 李敬濤;余剛;陳宣明;范臻;劉金亮;潘洪玉;;四翅濱藜AcDHN基因的克隆及其抗逆功能分析[J];植物生理學(xué)報(bào);2012年07期

10 陳宗瑜;畢婷;吳瀟瀟;;濾減UV-B輻射對(duì)烤煙蛋白質(zhì)組變化的影響[J];生態(tài)學(xué)雜志;2012年05期

【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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1 龍亞芹;王萬東;李凡;楊文娟;陳海如;;云南水稻條紋病毒RNA3的分子變異及遺傳多樣性分析[J];西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào);2011年02期

2 ;Characterization and Expression Analysis of Four Glycine-Rich RNA-Binding Proteins Involved in Osmotic Response in Tobacco (Nicotiana tabacum cv. Xanthi)[J];Agricultural Sciences in China;2010年11期

3 潘妍;王玉成;張大偉;楊傳平;;二色補(bǔ)血草LbGRP基因的克隆及抗逆能力分析[J];遺傳;2010年03期

4 王海震;王瑩;劉定干;;真核生物mRNA 3′非翻譯區(qū)的功能[J];生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展;2008年09期

5 董霞;李文正;黃夸克;蘭建強(qiáng);李正風(fēng);劉世貴;;水楊酸對(duì)煙草GRPs基因表達(dá)的影響[J];吉首大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2008年02期

6 靳霞;呂占軍;;內(nèi)含子的進(jìn)化及基因表達(dá)調(diào)節(jié)[J];生命的化學(xué);2008年01期

7 許旭明;;煙草的起源與進(jìn)化[J];三明農(nóng)業(yè)科技;2007年03期

8 陳璇;李文正;邵巖;曾千春;;動(dòng)植物中RNA結(jié)合蛋白的研究進(jìn)展[J];生物技術(shù)通報(bào);2007年03期

9 王玉成;張國棟;姜靜;;一種適用范圍廣的總RNA提取方法[J];植物研究;2006年01期

10 邵宏波,梁宗鎖,邵明安;轉(zhuǎn)基因生物體對(duì)生態(tài)環(huán)境的影響及其發(fā)展趨向[J];農(nóng)業(yè)工程學(xué)報(bào);2005年S1期

【相似文獻(xiàn)】

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1 ;草莓優(yōu)質(zhì)高產(chǎn) 重在春季培管[J];北京農(nóng)業(yè);2001年03期

2 趙月營;提高大棚草莓果實(shí)品質(zhì)的措施[J];北京農(nóng)業(yè);2001年11期

3 李駿;鮮草莓貯藏法[J];農(nóng)村新技術(shù);2001年11期

4 孟小雄;改善草莓風(fēng)味的基因[J];植物雜志;2001年05期

5 趙月營;提高大棚草莓果實(shí)品質(zhì)的措施[J];河北果樹;2002年02期

6 李君蘭;草莓的貯藏、分級(jí)、包裝、運(yùn)輸[J];北方園藝;2004年01期

7 翟洪民;草莓加工二法[J];蔬菜;2004年04期

8 劉鳳生;草莓果實(shí)大 色澤艷 口感好是噴了激素嗎[J];上海蔬菜;2004年04期

9 ;草莓的采摘及貯藏[J];果農(nóng)之友;2005年06期

10 鐘灼仔;寧德市草莓遭受污染現(xiàn)狀及治理對(duì)策[J];福建果樹;2005年03期

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1 孫瑞W,

本文編號(hào):1325025


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