草莓葉片中5種新microRNA的RT-PCR鑒定及靶基因分析
本文關(guān)鍵詞:草莓葉片中5種新microRNA的RT-PCR鑒定及靶基因分析 出處:《沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)》2016年02期 論文類型:期刊論文
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【摘要】:micro RNA(miRNA)是來自真核生物自身基因組的非編碼小分子RNA,在轉(zhuǎn)錄后水平上負(fù)調(diào)控基因表達(dá),在植物的生長發(fā)育和脅迫應(yīng)答等方面起重要作用。以栽培草莓艷麗為試材,利用RT-PCR技術(shù)克隆草莓葉片中5種新miRNA的前體及靶基因,分析靶基因的結(jié)構(gòu)特征與功能,結(jié)果表明:草莓mi R-6,mi R-12,mi R-13,mi R-14,mi R-29的前體長度分別為513 bp,309 bp,464bp,334 bp和343 bp,均能形成典型的莖環(huán)結(jié)構(gòu),其中mi R-12、mi R-13的成熟miRNA序列在莖環(huán)3'端臂上,mi R-6、mi R-14、mi R-29成熟miRNA序列在莖環(huán)的5'端臂上。mi R-14與mi R-29的靶基因分別為854bp和690bp,與森林草莓基因組對(duì)應(yīng)序列一致性為98.72%和99.42%,其中mi R-29靶基因是GRP基因,編碼143個(gè)氨基酸,推測mi R-29靶基因在草莓植株的脅迫響應(yīng)中有重要調(diào)控作用。本研究豐富了草莓miRNA的研究,為揭示草莓miRNA的生物學(xué)功能奠定基礎(chǔ)。
【作者單位】: 遼寧省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所;沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院/設(shè)施園藝省部共建教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:遼寧省高等學(xué)校杰出青年學(xué)者成長計(jì)劃項(xiàng)目(LJQ2014069) 國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31101524)
【分類號(hào)】:S668.4
【正文快照】: micro RNA(mi RNA)是生物體中普遍存在的一種內(nèi)源性非編碼小分子RNA,長度多數(shù)在21~24 nt[1]。mi RNA在植物器官生長發(fā)育,激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),細(xì)菌、病毒侵染及其他非生物脅迫等過程中均起重要作用[2-4]。植物mi R-NA是由mi RNA基因在RNA聚合酶Ⅱ的作用下形成原初轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物(Pri-mi RNA
【參考文獻(xiàn)】
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【共引文獻(xiàn)】
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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】
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【相似文獻(xiàn)】
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1 孫瑞W,
本文編號(hào):1325025
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