小麥TaTAC1基因同源克隆及表達(dá)分析
發(fā)布時間:2017-12-22 08:25
本文關(guān)鍵詞:小麥TaTAC1基因同源克隆及表達(dá)分析 出處:《四川農(nóng)業(yè)大學(xué)》2016年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文
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【摘要】:分蘗角度影響植物群體結(jié)構(gòu)、光合效率以及植株的形態(tài)建成,最終影響其產(chǎn)量及品質(zhì),小麥中有關(guān)分蘗角度的研究罕見報(bào)道。為解析小麥TAC1的表達(dá)模式,初步了解該基因的分子遺傳機(jī)制及其與分蘗角度的遺傳關(guān)系。本研究以CN16、SM969、Lan2399以及SHW-1為材料.根據(jù)前人克隆出的TAC1基因的cDNA序列,設(shè)計(jì)出適宜普通小麥中的特異引物,并在上述四個材料中同源克隆出TaTACl基因的cDNA序列。通過生物信息學(xué)分析以及熒光定量表達(dá)模式分析,揭示普通小麥中TaTAC1的生物學(xué)功能和表達(dá)特性,研究結(jié)果如下:1.在供試小麥中擴(kuò)得兩類TaTAC1的cDNA序列。第一類cDNA長度為1118bp,其中包括780bpORF和338bp的3’-UTR。ORF編碼260個氨基酸。第二類cDNA長度為1143bp,其中包括780bp ORF和363bp的3’-UTR,ORF也編碼260個氨基酸。其中CN16-2、SM969-2的第10號堿基發(fā)生突變,引起終止子提前,導(dǎo)致TaTAC1表達(dá)受阻;Lan2399-2和SHW-1-2在109-115堿基位置有"CGCGCG"片段插入導(dǎo)致蛋白質(zhì)β-折疊片減少。2.小麥TaTAC1基因氨基酸序列與水稻OsTAC1、玉米ZmTAC1、高粱SbTAC1的氨基酸序列相似度分別為:75.95%、62.02%、65.04%,且氨基酸序列有5個區(qū)域高度保守,區(qū)域Ⅰ內(nèi)存在“IGT”結(jié)構(gòu),其中Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ區(qū)域的保守性與IGT基因家族相同。3. TaTAC1基因分子量為29033.2,等電點(diǎn)為5.42,其二級結(jié)構(gòu)中存在多核苷酸和蛋白質(zhì)的特異結(jié)合位點(diǎn)、α-螺旋、延伸鏈、無規(guī)則卷曲以及一個明顯的跨膜結(jié)構(gòu)域。4.實(shí)時熒光定量PCR分析表明,TaTAC1在分蘗期的葉鞘、莖高效表達(dá),分蘗節(jié)其次,葉與根表達(dá)量最低;SPSS20.0分析該基因在分蘗節(jié)各時期表達(dá)量與分蘗角度顯著正相關(guān),Pearson相關(guān)性系數(shù)為0.677:其他組織表達(dá)量與分蘗角度無顯著相關(guān)性。5、TaTAC1亞細(xì)胞定位于細(xì)胞膜。TaTACl在不同時期下不同組織均有表達(dá),其具有組織時空表達(dá)特異性;該基因在葉鞘、莖、分蘗節(jié)表達(dá)高,分蘗節(jié)處表達(dá)量與表型顯著相關(guān)且蛋白定位于細(xì)胞膜,推測TaTACl在mRNA水平上正向調(diào)控分蘗角度,且其可能參與生長素極性運(yùn)輸過程從而改變分蘗角度大小。
【學(xué)位授予單位】:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:S512.1
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1 曹鑫;小麥TaTAC1基因同源克隆及表達(dá)分析[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2016年
,本文編號:1319092
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