發(fā)布時間：2017-12-21 07:32

  本文關(guān)鍵詞：葡萄SnRK2家族基因的鑒定與表達(dá)分析　出處：《園藝學(xué)報(bào)》2016年10期 　論文類型：期刊論文

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【摘要】：以‘寶石無核’(Ruby Seedless)葡萄試管苗為材料,采用RT-PCR技術(shù),克隆得到8個葡萄Sn RK2家族基因。序列分析發(fā)現(xiàn),該家族基因蛋白結(jié)構(gòu)在N端相對保守,而在C端極其特異;聚類結(jié)果表明葡萄Sn RK2基因家族可以分為3個亞家族;對這8個基因所編碼的蛋白質(zhì)進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),其富含酸性氨基酸,且均為親水蛋白;基因組結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn)Vv Sn RK2.2和Vv Sn RK2.8含有10個外顯子,其他6個均含9個外顯子;對蛋白二級結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn)8個基因編碼的蛋白主要以α 螺旋、β 轉(zhuǎn)角和不規(guī)則卷曲為主;亞細(xì)胞定位預(yù)測,8個基因主要定位于細(xì)胞質(zhì)中。順式作用元件分析表明,除Vv Sn RK2.1、Vv Sn RK2.2、Vv Sn RK2.6外,其他基因順式作用元件包含ABRE、DRE/CRT、LRTE中的一個或多個。定量PCR分析表明,Vv Sn RK2的表達(dá)存在組織差異性,Vv Sn RK2.7在根中表達(dá)水平最高,是葉片的3.8倍,Vv Sn RK2.8在莖中表達(dá)水平最高,是葉片的5.0倍。0~ 4℃處理后,表達(dá)水平下調(diào)幅度最小的為Vv Sn RK2.2,Vv Sn RK2.7下調(diào)幅度較大,Vv Sn RK2.8的表達(dá)水平為0;30℃處理后Vv Sn RK2.2和Vv Sn RK2.5上調(diào)表達(dá),分別為對照的3.8倍和3.6倍;Vv Sn RK2.1和Vv Sn RK2.2與鹽脅迫調(diào)節(jié)緊密相關(guān),Vv Sn RK2.5與干旱脅迫調(diào)節(jié)密切相關(guān)。
【作者單位】： 甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31460500)
【分類號】：S663.1
【正文快照】： Sn RK(蔗糖非發(fā)酵型蛋白激酶家族)是植物體內(nèi)廣泛存在的一類絲氨酸/蘇氨酸(Ser/Thr)類蛋白激酶,分為Sn RK1、Sn RK2和Sn RK3等3個亞家族(HalfordHardie,1998;Hrabak et al.,2003;Coello et al.,2012)。Sn RK1與酵母的SNF1和哺乳動物的AMPKs同源,并且具有高度保守的N端催化結(jié)

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