草麻黃高通量轉(zhuǎn)錄組分析及黃酮類代謝途徑相關(guān)基因的鑒定
發(fā)布時間:2017-12-05 13:38
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【摘要】:草麻黃(Ephedra sinica Stapf)植物富含黃酮類和生物堿類化合物,具有重要藥用價值,并且適應(yīng)性強,在防風(fēng)固沙、改善沙漠環(huán)境等方面具有重要作用。通過對已測序草麻黃轉(zhuǎn)錄組的原始數(shù)據(jù)進行重新組裝、拼接等生物信息學(xué)分析,共得到7 947 954個clean reads,13 389條unigene序列。經(jīng)過Nr,KOGs,GO,KEGG和Swiss-Prot等數(shù)據(jù)庫分析后,獲得10 481個Nr注釋,4 533個KOG功能注釋,7 121個GO功能注釋,5 833個KEGG注釋,8 039個Swiss-Prot注釋,并利用KEGG通路分析技術(shù)發(fā)掘草麻黃中參與黃酮類化合物代謝途徑相關(guān)基因,為克隆草麻黃黃酮合成關(guān)鍵基因、黃酮類化合物的生物合成提供重要的遺傳資源,同時為其抗逆機制的研究和藥用價值開發(fā)提供依據(jù)。
【作者單位】: 中國林業(yè)科學(xué)研究院林業(yè)研究所/國家林業(yè)局林木培育重點實驗室;南京林業(yè)大學(xué)生物與環(huán)境學(xué)院;南寧樹木園;
【基金】:林木遺傳育種國家重點實驗室專項(CAFYBB2012040) 國家自然科學(xué)基金資助項目(31270707)
【分類號】:S567.239
【正文快照】: 草麻黃(Ephedra sinica Stapf)屬于麻黃科(Ephedraceae)麻黃屬(Ephedra),是草本狀灌木植物,屬于超旱生、強旱生、旱生系列植物,根系發(fā)達,適應(yīng)性強,四季常綠[1]。該屬植物在防風(fēng)固沙、增加植被覆蓋等方面具有重要作用,是河西和西北荒漠地區(qū)的主要建群種[1]。麻黃屬在我國有廣泛
【相似文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前8條
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8 ;[J];;年期
,本文編號:1255029
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