本文關(guān)鍵詞：甘蔗獨(dú)腳金內(nèi)酯生物合成基因ScCCD8的克隆與表達(dá)分析

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【摘要】：【目的】克隆甘蔗的Sc CCD8,分析其序列特征并預(yù)測其功能,研究在甘蔗不同組織部位、不同脅迫處理?xiàng)l件以及不同生長時(shí)間點(diǎn)ScCCD8的表達(dá)情況,為該基因在甘蔗基因工程育種中的應(yīng)用提供理論支撐�！痉椒ā恳訬CBI中檢索的甘蔗CCD8同源片段EST序列為模板設(shè)計(jì)引物,擴(kuò)增甘蔗CCD8的片段,采用RACE和RT-PCR技術(shù)分別從甘蔗品種新臺(tái)糖22號(hào)中克隆CCD8的5′、3′目的片段和全長cDNA序列,以生物信息學(xué)方法對序列進(jìn)行預(yù)測分析,利用qRT-PCR方法分析CCD8在不同組織、不同逆境脅迫條件下和不同生長時(shí)間點(diǎn)的表達(dá)特性。【結(jié)果】克隆獲得甘蔗CCD8,命名為ScCCD8,Gen Bank登錄號(hào)為KP742973.1。該cDNA全長2 016 bp,含有1個(gè)1 623 bp的完整開放閱讀框(ORF),編碼540個(gè)氨基酸,編碼的蛋白質(zhì)分子量為59.534 kD。生物信息學(xué)分析表明ScCCD8編碼的蛋白是定位于葉綠體上的非分泌性蛋白,不是典型的跨膜蛋白,沒有信號(hào)肽位點(diǎn)。存在著多個(gè)糖基化位點(diǎn)和磷酸化位點(diǎn)等活性位點(diǎn)。序列分析表明,ScCCD8與其他植物的CCD8蛋白有很高的相似性。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析顯示,甘蔗ScCCD8與高粱的CCD8蛋白親緣關(guān)系較近。實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)分析表明,ScCCD8的表達(dá)具有組織特異性,在根中的表達(dá)量最高,是老葉中表達(dá)量的18倍。其在模擬重度干旱脅迫(20%PEG)、鹽脅迫(200 mmol·L~(-1)NaCl)、磷缺乏(1/8 mmol·L~(-1))和營養(yǎng)缺乏(純水培養(yǎng))4種脅迫處理下,莖尖中的ScCCD8均被誘導(dǎo)表達(dá),且在處理24 h以后,ScCCD8的表達(dá)量增加較為明顯。在不同生長時(shí)期,ScCCD8在甘蔗不同生長時(shí)期的莖尖中均有表達(dá),且在幼苗期的表達(dá)量高于萌芽期和分蘗期�！窘Y(jié)論】從甘蔗品種ROC22中克隆獲得的甘蔗獨(dú)腳金內(nèi)酯生物合成關(guān)鍵基因ScCCD8是CCD8基因家族成員,推測ScCCD8可能與甘蔗SLs響應(yīng)逆境脅迫有關(guān)。
【作者單位】： 云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院甘蔗研究所/云南省甘蔗遺傳改良重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(31360359) 國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系專項(xiàng)資金(CARS-20-1-1) 云南省應(yīng)用基礎(chǔ)研究計(jì)劃(2016FB071) 云南省中青年學(xué)術(shù)技術(shù)帶頭人后備人才(2014HB038)
【分類號(hào)】：S566.1
【正文快照】：

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前3條

1 王秀梅;梁越洋;李玲;貢常委;王海鵬;黃曉西;李雙成;鄧其明;朱軍;鄭愛萍;李平;王世全;;OsMAX1a,OsMAX1e通過參與獨(dú)角金內(nèi)酯的合成調(diào)控水稻分蘗[J];中國水稻科學(xué);2015年03期

2 ;The Interactions among DWARF10,Auxin and Cytokinin Underlie Lateral Bud Outgrowth in Rice[J];Journal of Integrative Plant Biology;2010年07期

3 闕友雄;許莉萍;徐景升;張積森;張木清;陳如凱;;甘蔗基因表達(dá)定量PCR分析中內(nèi)參基因的選擇[J];熱帶作物學(xué)報(bào);2009年03期

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 陳小娟;生長素及獨(dú)腳金內(nèi)酯介導(dǎo)H_2O_2調(diào)控番茄側(cè)枝生長發(fā)育的機(jī)制研究[D];浙江大學(xué);2015年

【共引文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 吳轉(zhuǎn)娣;劉新龍;劉家勇;昝逢剛;趙培方;林秀琴;陳學(xué)寬;蘇火生;劉洪博;吳才文;;甘蔗獨(dú)腳金內(nèi)酯生物合成基因ScCCD8的克隆與表達(dá)分析[J];中國農(nóng)業(yè)科學(xué);2016年14期

2 楊善;謝平;李廣翔;葉昌輝;周鴻凱;;錳素對甘蔗脯氨酸合成積累的影響[J];浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào);2016年06期

3 呂愛麗;李旭娟;劉洪博;吳才文;曾千春;劉新龍;;甘蔗ScHTD2基因的克隆及生物信息學(xué)分析[J];熱帶作物學(xué)報(bào);2016年06期

4 楊航;劉紅昌;石小兵;葛菲;趙致;羅輝;;三葉木通果實(shí)成熟過程內(nèi)參基因篩選[J];基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué);2016年05期

5 蘇煒華;黃瓏;黃寧;劉峰;蘇亞春;肖新?lián)Q;凌輝;闕友雄;;甘蔗細(xì)胞色素P450還原酶基因的RT-PCR擴(kuò)增與表達(dá)分析[J];應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報(bào);2016年02期

6 潘暢;張宇宏;龐虹;;孟氏隱唇瓢蟲qRT-PCR分析中內(nèi)參基因的篩選[J];環(huán)境昆蟲學(xué)報(bào);2016年02期

7 楊善;王熙乾;葉昌輝;謝平;黃興;周鴻凱;;氮素對甘蔗脯氨酸合成積累及其關(guān)鍵基因的效應(yīng)分析[J];熱帶作物學(xué)報(bào);2016年02期

8 肖新?lián)Q;闕萬才;黃寧;劉峰;蘇煒華;吳期濱;蘇亞春;;與甘蔗抗黑穗病性相關(guān)的14-3-3基因的克隆和表達(dá)分析[J];熱帶作物學(xué)報(bào);2016年01期

9 闕萬才;黃寧;劉峰;肖新?lián)Q;凌輝;張玉葉;蘇煒華;蘇亞春;吳期濱;闕友雄;;甘蔗真核生物翻譯起始因子5A基因的克隆與表達(dá)分析[J];應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報(bào);2015年06期

10 楊善;葉昌輝;莫俊杰;黃興;楊杰文;周鴻凱;;不同磷肥水平對甘蔗脯氨酸合成積累及關(guān)鍵基因表達(dá)的效應(yīng)[J];華南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2015年06期

【二級參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前7條

1 闕友雄;許莉萍;林劍偉;陳如凱;;甘蔗NBS-LRR類抗病基因同源序列的分離與鑒定[J];作物學(xué)報(bào);2009年04期

2 闕友雄;許莉萍;陳如凱;;對甘蔗受黑穗病菌侵染后差異表達(dá)基因的分離與鑒定[J];作物學(xué)報(bào);2009年03期

3 張積森;李偉;闕友雄;阮妙鴻;張木清;陳如凱;;斑茅兩個(gè)看家基因片段的克隆及其在基因芯片中的應(yīng)用[J];熱帶亞熱帶植物學(xué)報(bào);2007年04期

4 張艷君;朱志峰;陸融;徐瓊;石琳熙;簡序;劉俊燕;姚智;;基因表達(dá)轉(zhuǎn)錄分析中內(nèi)參基因的選擇[J];生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展;2007年05期

5 王曼玲,胡中立,周明全,宋運(yùn)淳;植物多酚氧化酶的研究進(jìn)展[J];植物學(xué)通報(bào);2005年02期

6 朱宏波,騰冰,高鳳蘭,吳宗璞;不同抗性大豆品種感染SMV_1后若干生化變化[J];西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào);2001年03期

7 ;Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation of rice with the spider insecticidal gene conferring resistance to leaffolder and striped stem borer[J];Cell Research;2001年02期

【相似文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 ;浚蔗二號(hào)甘蔗[J];技術(shù)與市場;2001年12期

2 ;廣西柳城推廣甘蔗良種良法種植效益驟增[J];中國糖料;2001年01期

3 ;崇左調(diào)整甘蔗品種農(nóng)民喜增收[J];中國糖料;2001年02期

4 王水琦,王子琳,潘世明,曾東火,李海明;幾個(gè)優(yōu)良食用甘蔗品種的脫毒和組培快繁[J];植物生理學(xué)通訊;2002年02期

5 陳玉水;干旱與甘蔗[J];廣西蔗糖;2002年03期

6 張春良;勐海氣候與甘蔗高產(chǎn)[J];甘蔗糖業(yè);2004年01期

7 宗武;依靠科技促甘蔗增產(chǎn)[J];云南農(nóng)業(yè);2004年08期

8 韋超妹;;甘蔗低產(chǎn)的原因與對策[J];廣西農(nóng)學(xué)報(bào);2006年02期

9 張躍彬;;云南甘蔗科技與新時(shí)期發(fā)展方向[J];云南科技管理;2007年01期

10 羅贛豐;劉小全;張遠(yuǎn)福;孫火喜;;江西甘蔗品種改良的現(xiàn)狀及發(fā)展對策[J];江西農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào);2007年08期

中國重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 劉慶庭;陳金侃;區(qū)穎剛;;田間倒伏甘蔗的空間姿態(tài)[A];中國農(nóng)業(yè)工程學(xué)會(huì)2011年學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2011年

2 韋麗嬌;李明;;甘蔗橫向潛在價(jià)值分析[A];紀(jì)念中國農(nóng)業(yè)工程學(xué)會(huì)成立30周年暨中國農(nóng)業(yè)工程學(xué)會(huì)2009年學(xué)術(shù)年會(huì)（CSAE 2009）論文集[C];2009年

3 陳超君;韋漢文;黃有總;韓世健;陸國盈;余勇;;引進(jìn)甘蔗品種(系)的抗旱性研究[A];2010中國作物學(xué)會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)論文摘要集[C];2010年

4 黎煥光;譚裕模;譚芳;王倫旺;;甘蔗纖維分與農(nóng)藝工藝性狀的相關(guān)分析[A];2010中國作物學(xué)會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)論文摘要集[C];2010年

5 張保青;楊麗濤;李楊瑞;;自然條件下甘蔗品種抗寒生理生化特性的比較研[A];2010中國作物學(xué)會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)論文摘要集[C];2010年

6 楊榮仲;李楊瑞;王維贊;楊麗濤;朱秋珍;梁闐;周會(huì);唐仕云;;不同條件下的甘蔗耐寒評價(jià)分析[A];2010中國作物學(xué)會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)論文摘要集[C];2010年

7 許莉萍;陳如凱;潘大仁;;生物技術(shù)與甘蔗[A];中國青年農(nóng)業(yè)科學(xué)學(xué)術(shù)年報(bào)[C];2002年

8 王維贊;朱秋珍;鄧展云;;國內(nèi)外引進(jìn)甘蔗品種資源的聚類分析[A];廣西甘蔗研究所論文集[C];2003年

9 張亦誠;岑健枝;;生物工程技術(shù)在甘蔗上的應(yīng)用[A];’2003中國作物學(xué)會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)文集[C];2003年

10 楊榮仲;譚裕模;譚芳;劉海斌;黎煥光;;甘蔗常用雜交組合的剝?nèi)~性能差異[A];中國作物學(xué)會(huì)甘蔗專業(yè)委員會(huì)第十一次學(xué)術(shù)討論會(huì)論文集[C];2004年

中國重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 陳超邋通訊員 田婉瑩 林紅生;海南入選我國甘蔗區(qū)試點(diǎn)[N];海南日報(bào);2008年

2 劉廣金;同是種甘蔗 收入天壤別[N];中國特產(chǎn)報(bào);2001年

3 本報(bào)記者 張穎;為了讓甘蔗越來越甜[N];福建日報(bào);2013年

4 諸葛子房;舒四棠20畝甘蔗可獲13萬元[N];中國特產(chǎn)報(bào);2003年

5 張銳;云南推廣甘蔗良種結(jié)碩果[N];農(nóng)民日報(bào);2004年

6 廣東省湛江農(nóng)墾局局長 陳劍峰;以現(xiàn)代農(nóng)業(yè)理念建設(shè)湛江甘蔗示范區(qū)[N];農(nóng)民日報(bào);2006年

7 本報(bào)記者 劉旭;甘蔗良種“待字閨中”難出閣[N];國際商報(bào);2008年

8 記者 董明 通訊員 梁麗娟;甘蔗品種提前更新?lián)Q代[N];柳州日報(bào);2008年

9 肖衛(wèi)萍 肖衛(wèi)秋;抓管理重投入增甘蔗單產(chǎn)[N];云南經(jīng)濟(jì)日報(bào);2008年

10 記者 鄭嵐嵐;國家級重點(diǎn)甘蔗科研基地遭破壞？[N];湛江日報(bào);2008年

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 楊建波;間作大豆對甘蔗生長及內(nèi)生細(xì)菌、固氮細(xì)菌多樣性的效應(yīng)[D];廣西大學(xué);2014年

2 葉頡;轉(zhuǎn)基因甘蔗在中國商業(yè)化的潛在經(jīng)濟(jì)影響研究[D];福建農(nóng)林大學(xué);2015年

3 韋麗君;甘蔗干旱脅迫的形態(tài)結(jié)構(gòu)及生理機(jī)制研究[D];湖南農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

4 吳棉國;我國甘蔗及制品質(zhì)量與技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)的研究[D];福建農(nóng)林大學(xué);2011年

5 朱琳;甘蔗中蔗糖代謝途徑關(guān)鍵基因和糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的系統(tǒng)發(fā)育研究[D];吉林大學(xué);2013年

6 梁潘霞;硅提高甘蔗抗旱性的生理及分子基礎(chǔ)研究[D];廣西大學(xué);2013年

7 張?jiān)鰧W(xué);梳刷式甘蔗剝?nèi)~機(jī)剝?nèi)~機(jī)理的試驗(yàn)研究[D];華南農(nóng)業(yè)大學(xué);2002年

8 許莉萍;甘蔗抗感黑穗病池的構(gòu)建和抗病基因分子標(biāo)記[D];福建農(nóng)林大學(xué);2000年

9 闕友雄;甘蔗與黑穗病菌互作的分子應(yīng)答研究[D];福建農(nóng)林大學(xué);2008年

10 張保青;低溫脅迫下甘蔗后期生理特性及差異蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D];廣西大學(xué);2013年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 程文偉;甘蔗對鉛和鎘的吸收特性及生理響應(yīng)研究[D];浙江工商大學(xué);2009年

2 唐云仙;甘蔗莖尖組織培養(yǎng)過程中褐變與生理生化性狀的關(guān)系[D];廣西大學(xué);2015年

3 陳家慧;不同甘蔗品種基因組DNA甲基化分析[D];廣西大學(xué);2015年

4 王尊欣;31個(gè)甘蔗品種田間綜合評價(jià)及優(yōu)良品種的抗旱性分析[D];海南大學(xué);2014年

5 葉琳莉;甘蔗SSR分子指紋圖譜數(shù)據(jù)庫構(gòu)建與管理系統(tǒng)的開發(fā)[D];福建農(nóng)林大學(xué);2012年

6 林兆里;甘蔗品種（系）對二點(diǎn)螟抗性評價(jià)[D];福建農(nóng)林大學(xué);2015年

7 楊聲澉;不同施氮時(shí)期和施氮終止期對甘蔗氮素吸收分布影響的研究[D];廣西大學(xué);2008年

8 陳永繼;甘蔗—土壤系統(tǒng)仿真模型的研究[D];廣西大學(xué);2008年

9 張躍彬;云南甘蔗農(nóng)業(yè)栽培專家系統(tǒng)研制[D];中國農(nóng)業(yè)大學(xué);2005年

10 陳偉績;有機(jī)—無機(jī)復(fù)混肥對甘蔗生長和土壤養(yǎng)分的效應(yīng)研究[D];福建農(nóng)林大學(xué);2007年

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本文編號(hào)：1238537