本文關鍵詞：葡萄CHS和STS基因家族生物信息學鑒定和表達分析

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【摘要】：查爾酮合成酶(CHS,chalcone synthase)是植物體類黃酮類化合物合成的第1個關鍵酶和限速酶,它能夠催化丙二酰-Co A和對香豆酸-Co A合成柚皮素查爾酮。二苯乙烯合成酶(STS,stilbene synthase)是芪類化合物合成路徑的關鍵酶,與查爾酮合成酶有共同的作用底物,二者具有很高的相似度。為更好地了解葡萄中CHS和STS基因的種類和數(shù)量,本研究采用生物信息學方法檢索獲得葡萄(Vitis vinifera L.)基因組數(shù)據(jù)庫中的CHS和STS基因,通過分析其染色體定位、系統(tǒng)進化和保守基序,發(fā)現(xiàn)葡萄基因組可能含有33個STS基因,9個CHS基因,這些基因集中分布在6條葡萄染色體上,部分家族基因在染色體上形成基因簇。葡萄CHS和STS基因家族蛋白長度、基因結構和蛋白基序非常保守,具有很近的進化關系。葡萄芯片數(shù)據(jù)結果表明,葡萄CHS和STS基因在葡萄果實不同發(fā)育時期的果皮和果肉中均有表達,尤其葡萄CHS GroupsⅢ亞家族基因在葡萄果皮中大量表達。葡萄STS基因家族在果實中的表達量較低,部分探針在葡萄果實成熟期的果皮中表達量急劇增加。本研究結果可為葡萄CHS和STS基因在果實發(fā)育過程中的功能研究提供參考。
【作者單位】： 江蘇省農(nóng)業(yè)科學院園藝研究所/江蘇省高效園藝作物遺傳改良重點實驗室;
【基金】：江蘇省自然科學基金項目(BK20131331) 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術體系專項基金項目(CARS-3O)
【分類號】：S663.1
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