本文關(guān)鍵詞：分枝桿菌噬菌體D29 holin基因的克隆及其編碼蛋白的生物信息學(xué)分析

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【摘要】：目的研究分枝桿菌噬菌體D29holin基因編碼蛋白的理化特點(diǎn)及生物學(xué)特性,分析噬菌體抗結(jié)核菌的潛力。方法根據(jù)GenBank中登錄的分枝桿菌噬菌體D29holin基因序列設(shè)計(jì)上、下游引物,以分枝桿菌噬菌體D29基因組為模板,PCR擴(kuò)增holin基因,構(gòu)建重組質(zhì)粒pET32a-holin,進(jìn)行雙酶切鑒定、測序鑒定及生物信息學(xué)分析。結(jié)果 PCR擴(kuò)增得到序列正確的holin基因產(chǎn)物并成功構(gòu)建重組質(zhì)粒pET32a-holin。進(jìn)化分析顯示分枝桿菌噬菌體D29holin基因與已知有尾分枝桿菌噬菌體Chy1、Chy4、Chy5holin基因親緣關(guān)系較近。生物信息學(xué)分析顯示,該基因編碼Holin蛋白為穩(wěn)定、疏水性蛋白,具有2個(gè)跨膜區(qū)域和親水性C-端;二級結(jié)構(gòu)中以α-螺旋和無規(guī)則卷曲為主,有信號(hào)肽,蛋白序列中存在2個(gè)絲氨酸磷酸化位點(diǎn)。結(jié)論分枝桿菌噬菌體D29 Holin蛋白的兩個(gè)跨膜區(qū)及親水性C-端構(gòu)象發(fā)生變化,有助于闡明Holin"定時(shí)"打孔及啟動(dòng)噬菌體裂解細(xì)菌的機(jī)制,為研發(fā)抗結(jié)核Holin多肽藥物奠定了基礎(chǔ)。
【作者單位】： 濰坊醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)學(xué)系;濰坊醫(yī)學(xué)院臨床醫(yī)學(xué)院病原生物學(xué)教研室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.81100006) 山東省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.ZR2010HM073)
【分類號(hào)】：R378.911
【正文快照】： *?**?結(jié)核病是由結(jié)核分枝桿菌引起的慢性傳染病,長期不規(guī)范抗生素治療導(dǎo)致的耐多藥結(jié)核菌株的危害日益凸顯[1]。耐藥結(jié)核分枝桿菌呈增多趨勢[2],即使新型抗生素也可出現(xiàn)細(xì)菌耐藥性。分枝桿菌噬菌體D29[3]是一種可侵染快生型和慢生型分枝桿菌的裂解性dsDNA病毒,具有抗菌作用,但

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