本文關(guān)鍵詞：用于羊草基因分型的SNP分子標(biāo)記技術(shù)研究

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【摘要】：以我國(guó)廣泛分布的多年生優(yōu)勢(shì)禾本科牧草羊草為研究材料,針對(duì)羊草目前尚無(wú)SNP標(biāo)記技術(shù)的報(bào)道,基于實(shí)驗(yàn)室已有的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),挖掘其中的SNP分子標(biāo)記,建立一種利用高分辨率熔解曲線(high-resolution melting,HRM)進(jìn)行羊草SNP基因分型的方法。結(jié)果表明,從羊草轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中獲得41843個(gè)SNPs,轉(zhuǎn)換的數(shù)量是顛換數(shù)量的2倍;建立了基于SNP的HRM基因分型方法,設(shè)計(jì)了112對(duì)SNP引物,其中有98對(duì)(87.5%)能擴(kuò)增出明亮單一條帶,擴(kuò)增條帶大小符合預(yù)期的有72對(duì)(64.29%),適宜進(jìn)行HRM基因分型的引物有46對(duì),占41.07%;用其中的7對(duì)引物可將羊草48份種質(zhì)區(qū)分開,并繪制出指紋圖譜。通過對(duì)部分HRM基因分型結(jié)果進(jìn)行測(cè)序驗(yàn)證,表明測(cè)序分析的基因型結(jié)果與HRM基因分型結(jié)果一致,證明HRM基因分型結(jié)果是可靠的。本研究首次建立的基于SNP的HRM基因分型方法,可用于羊草種質(zhì)資源的指紋圖譜繪制、育種親本的選配、基因關(guān)聯(lián)分析、分子標(biāo)記輔助育種、功能分子標(biāo)記開發(fā)、新品種的保護(hù)等育種工作。
【作者單位】： 中國(guó)科學(xué)院植物研究所北方資源植物重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院草原研究所;全國(guó)畜牧總站;
【基金】：國(guó)家草品種區(qū)域試驗(yàn)項(xiàng)目-羊草新品種“三性”測(cè)試(農(nóng)財(cái)發(fā)[2015]36號(hào)) 國(guó)家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究發(fā)展計(jì)劃(973計(jì)劃)項(xiàng)目(2014CB138704)資助
【分類號(hào)】：S543.9
【正文快照】： 單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)指在個(gè)體基因組上任何一個(gè)核苷酸的變異形成的DNA序列多態(tài)性[1]。與其他分子標(biāo)記(如SSR)相比[2],SNP分子標(biāo)記具有明顯的優(yōu)勢(shì)。SNPs數(shù)量多,分布廣泛,多態(tài)性豐富,密度高。在植物基因組內(nèi),平均每21bp就出現(xiàn)一個(gè)SNP。一般只

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前6條

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7 蔣小玲;袁靜;周伯平;徐六妹;n澤涎潘，

本文編號(hào)：1205187