玉米快速葉綠素熒光參數(shù)的基因定位及候選基因挖掘
本文關(guān)鍵詞:玉米快速葉綠素熒光參數(shù)的基因定位及候選基因挖掘
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【摘要】:玉米是重要的糧食和飼料作物,在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)和經(jīng)濟發(fā)展中占有重要地位。通過增加種植密度提高玉米產(chǎn)量是現(xiàn)代玉米育種及生產(chǎn)的一項重要成就,而密植條件下提高植株光能利用率又是玉米產(chǎn)量進一步提高的關(guān)鍵?焖偃~綠素熒光參數(shù)可以準確快速地探測植株光能轉(zhuǎn)化利用效率。挖掘與玉米葉綠素熒光參數(shù)相關(guān)的基因,對于揭示光合作用的遺傳機理和分子標記輔助選擇具有重要意義。本文采用連鎖分析和全基因組關(guān)聯(lián)分析的方法解析玉米快速葉綠素熒光參數(shù)的遺傳結(jié)構(gòu),主要研究結(jié)果如下:1.以242份玉米家系組成的重組自交系(RIL)群體為材料,利用Wincartographer軟件的復合區(qū)間作圖法對8個葉綠素熒光參數(shù)進行連鎖分析,2個環(huán)境下共檢測到21個與玉米快速葉綠素熒光參數(shù)相關(guān)的QTL位點,LOD值為2.53-5.75,可解釋的表型變異為5.41%-15.99%。2.以404份玉米自交系組成的自然群體為材料,利用覆蓋全基因組558629個SNP標記,在考慮群體結(jié)構(gòu)與親緣關(guān)系情況下,通過TASSEL軟件的混合線性模型對5個葉綠素熒光參數(shù)進行全基因組關(guān)聯(lián)分析。4個環(huán)境下經(jīng)過最佳線性無偏估計共檢測到44個與玉米快速葉綠素熒光參數(shù)顯著關(guān)聯(lián)的SNP位點,其中8個SNP位點與ETo/TRo顯著關(guān)聯(lián),6個SNP位點與ABS/CSo顯著關(guān)聯(lián),18個SNP位點與TRo/ABS顯著關(guān)聯(lián),4個SNP位點與ETo/CSo顯著關(guān)聯(lián),5個SNP位點與PIcs顯著關(guān)聯(lián),3個SNP位點與ABS/RC顯著關(guān)聯(lián)。3.通過生物信息學分析和基因表達分析的方法,確定GRMZM2G064949為與快速葉綠素熒光參數(shù)相關(guān)的候選基因。從玉米中克隆出GRMZM2G064949基因全長cDNA序列,包含一個732bp長的開放閱讀框,編碼244個氨基酸,并構(gòu)建了基因過表達載體。該基因具有組織表達特異性,而未呈現(xiàn)出明顯的生物鐘特性。
【學位授予單位】:揚州大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:S513
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