玉米快速葉綠素?zé)晒鈪?shù)的基因定位及候選基因挖掘
本文關(guān)鍵詞:玉米快速葉綠素?zé)晒鈪?shù)的基因定位及候選基因挖掘
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【摘要】:玉米是重要的糧食和飼料作物,在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)和經(jīng)濟(jì)發(fā)展中占有重要地位。通過增加種植密度提高玉米產(chǎn)量是現(xiàn)代玉米育種及生產(chǎn)的一項(xiàng)重要成就,而密植條件下提高植株光能利用率又是玉米產(chǎn)量進(jìn)一步提高的關(guān)鍵。快速葉綠素?zé)晒鈪?shù)可以準(zhǔn)確快速地探測(cè)植株光能轉(zhuǎn)化利用效率。挖掘與玉米葉綠素?zé)晒鈪?shù)相關(guān)的基因,對(duì)于揭示光合作用的遺傳機(jī)理和分子標(biāo)記輔助選擇具有重要意義。本文采用連鎖分析和全基因組關(guān)聯(lián)分析的方法解析玉米快速葉綠素?zé)晒鈪?shù)的遺傳結(jié)構(gòu),主要研究結(jié)果如下:1.以242份玉米家系組成的重組自交系(RIL)群體為材料,利用Wincartographer軟件的復(fù)合區(qū)間作圖法對(duì)8個(gè)葉綠素?zé)晒鈪?shù)進(jìn)行連鎖分析,2個(gè)環(huán)境下共檢測(cè)到21個(gè)與玉米快速葉綠素?zé)晒鈪?shù)相關(guān)的QTL位點(diǎn),LOD值為2.53-5.75,可解釋的表型變異為5.41%-15.99%。2.以404份玉米自交系組成的自然群體為材料,利用覆蓋全基因組558629個(gè)SNP標(biāo)記,在考慮群體結(jié)構(gòu)與親緣關(guān)系情況下,通過TASSEL軟件的混合線性模型對(duì)5個(gè)葉綠素?zé)晒鈪?shù)進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析。4個(gè)環(huán)境下經(jīng)過最佳線性無偏估計(jì)共檢測(cè)到44個(gè)與玉米快速葉綠素?zé)晒鈪?shù)顯著關(guān)聯(lián)的SNP位點(diǎn),其中8個(gè)SNP位點(diǎn)與ETo/TRo顯著關(guān)聯(lián),6個(gè)SNP位點(diǎn)與ABS/CSo顯著關(guān)聯(lián),18個(gè)SNP位點(diǎn)與TRo/ABS顯著關(guān)聯(lián),4個(gè)SNP位點(diǎn)與ETo/CSo顯著關(guān)聯(lián),5個(gè)SNP位點(diǎn)與PIcs顯著關(guān)聯(lián),3個(gè)SNP位點(diǎn)與ABS/RC顯著關(guān)聯(lián)。3.通過生物信息學(xué)分析和基因表達(dá)分析的方法,確定GRMZM2G064949為與快速葉綠素?zé)晒鈪?shù)相關(guān)的候選基因。從玉米中克隆出GRMZM2G064949基因全長(zhǎng)cDNA序列,包含一個(gè)732bp長(zhǎng)的開放閱讀框,編碼244個(gè)氨基酸,并構(gòu)建了基因過表達(dá)載體。該基因具有組織表達(dá)特異性,而未呈現(xiàn)出明顯的生物鐘特性。
【學(xué)位授予單位】:揚(yáng)州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:S513
【相似文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):1186836
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