變形假單胞菌2-酮基葡萄糖酸轉(zhuǎn)運蛋白基因的克隆與分析
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更多相關(guān)文章: 變形假單胞菌 -酮基葡萄糖酸轉(zhuǎn)運蛋白 kgu T基因 克隆 生物信息學
【摘要】:該研究旨在克隆變形假單胞菌JUIM01的2-酮基葡萄糖酸轉(zhuǎn)運蛋白基因kgu T,并明確其基本的生物學信息。根據(jù)已報道的假單胞菌的基因組信息及其2-酮基葡萄糖酸操縱子的物理圖譜設(shè)計簡并引物,采用TD-PCR技術(shù)從變形假單胞菌中克隆到全長為1278 bp的kgu T,其核苷酸序列與Pseudomonas sp.CCOS191的編碼2-酮基葡萄糖酸轉(zhuǎn)運蛋白(Kgu T)的核苷酸序列的一致性為87%,編碼一個由425個氨基酸殘基組成的蛋白。該蛋白與Pseudomonas sp.M1的Kgu T在氨基酸序列上的一致性達90%,定位于細胞膜,是一個具有12個跨膜結(jié)構(gòu)的疏水性的跨膜蛋白,無信號肽,其二級結(jié)構(gòu)中α螺旋、延伸鏈和無規(guī)卷曲所占的比例分別為75.76%、2.12%和22.12%。本研究首次從2-酮基葡萄糖酸的工業(yè)生產(chǎn)用菌中克隆到基因kgu T,并對其進行了生物信息學分析,為變形假單胞菌的Kgu T的功能研究奠定了基礎(chǔ)。
【作者單位】: 江蘇大學食品與生物工程學院;百勤異VC鈉有限公司;江南大學生物工程學院;
【基金】:國家自然科學基金項目(31571885) 國家高技術(shù)研究發(fā)展計劃項目(2012AA022103) 江西省科技計劃項目(贛知發(fā)[2015]64號) 江蘇大學研究生科研創(chuàng)新計劃項目(KYXX_0046);江蘇大學大學生科研立項項目(13A083) 德興市科技計劃項目(德科發(fā)[2015]44號)
【分類號】:Q933
【正文快照】:
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本文編號:1175164
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