亞洲棉bZIP蛋白家族的鑒定及GaFD基因的組織表達分析
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【摘要】:堿性亮氨酸拉鏈(basic leucine zipper,bZIP)是真核生物中數(shù)量最多并且最具多樣性的轉(zhuǎn)錄因子之一,參與植物生長發(fā)育及響應(yīng)生物和非生物脅迫。本研究利用亞洲棉(Gossypium arboreum)全基因組數(shù)據(jù)庫,通過生物信息學分析分布在13條染色體上的159個bZIP家族基因的全序列。系統(tǒng)進化、基因結(jié)構(gòu)和保守基序分析表明這些基因分成13個亞家族。其中,A亞家族有3個GaFD基因GaFD1、GaFD2和GaFD3,通過實時熒光定量PCR分析3個GaFD基因在不同組織中的表達,結(jié)果表明GaFD1和GaFD2在SAM中的表達量最高,GaFD3在莖中表達量最高。研究表明棉花基因組中具有數(shù)量眾多的bZIP家族成員,不同基因結(jié)構(gòu)及FD基因不同的表達特征表明bZIP基因在棉花生長發(fā)育中可能具有不同的功能,這些結(jié)果為進一步解析棉花bZIP家族基因的功能和作用機理積累了有價值的資料。
【作者單位】: 石河子大學生命科學學院/植物基因組學實驗室;
【基金】:教育部新世紀優(yōu)秀人才支持計劃項目(NCET-12-1072) 國家自然科學基金項目(31360366) 新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團博士基金項目(2012BB007)資助~~
【分類號】:S562
【正文快照】: 本研究由教育部新世紀優(yōu)秀人才支持計劃項目(NCET-12-1072),國家自然科學基金項目(31360366)和新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團博士基金項目(2012BB007)資助。This study was supported by the Program for New Century Excellent Talents in University of Ministry of Education of China(
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