2014—2015年我國華東部分地區(qū)豬流行性腹瀉病毒的檢測及S基因的序列分析
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【摘要】:采用RT-PCR方法對2014年至2015年送至實驗室的104份腹瀉仔豬小腸組織病料進行檢測,結(jié)果顯示42份為豬流行性腹瀉病毒(PEDV)陽性,選擇不同地區(qū)的7份陽性病料進行S基因克隆和測序,并與Gen Bank中已發(fā)布的PEDV S基因比對分析。核苷酸和氨基酸比對結(jié)果顯示,7株流行毒株S基因核苷酸和氨基酸序列的同源性分別是98.1%~99.2%和97.6%~99.1%。該7株流行毒株與經(jīng)典毒株CV777和DR13核苷酸序列的同源性分別為94.0%~94.2%和93.9%~94.1%,氨基酸序列的同源性分別為93.1%~93.6%和92.5%~93.1%。S基因進化樹分析結(jié)果表明,根據(jù)S基因的變異情況PEDV可以分為3個型,本試驗分析的7株P(guān)EDV流行毒株均屬于Ⅲ型,與2012年以來中國流行毒株的親緣關(guān)系較近,與國外傳統(tǒng)毒株和中國較早分離到的毒株的親緣關(guān)系較遠。
【作者單位】: 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)業(yè)部動物疫病診斷與免疫重點開放實驗室;
【基金】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)校內(nèi)項目(KJQN201619)
【分類號】:S852.651
【正文快照】: 豬流行性腹瀉病毒(porcine epidemic diarrheavirus,PEDV)是引起豬流行性腹瀉(porcine epidemicdiarrhea,PED)的主要病原,PED臨床上以腹瀉、嘔吐、脫水以及哺乳仔豬的高死亡率為特征[1-2]。由于其傳染性強和較短的病程,尤其是對7日齡內(nèi)的仔豬,其病死率接近100%,給養(yǎng)豬業(yè)帶來巨
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,本文編號:1139869
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