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海南仙人掌matK基因的克隆和序列分析

發(fā)布時間:2017-10-31 18:15

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【摘要】:2015年12月,為了分析采自海南?诔俏飨扇苏苖at K基因的序列及同源關(guān)系,利用RNA plant Reagent試劑盒提取仙人掌葉總RNA,反轉(zhuǎn)錄成第一鏈c DNA。同時設(shè)計仙人掌成熟酶K基因(mat K)的1對保守引物,利用RT-PCR的方法擴(kuò)增仙人掌成熟酶K基因,所得序列經(jīng)Blastn進(jìn)行比對,發(fā)現(xiàn)與已報道的22個仙人掌mat K基因核苷酸序列一致;利用Blastn的Distance tree of results構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,結(jié)果顯示海南仙人掌mat K基因與其它報道的30個仙人掌mat K基因同源性最高,同源性在99%以上,屬于同一組,而與Opuntia basilaris(Gen Bank accession No.JF786750.1)同源性最低,為96.6%。本研究利用RT-PCR方法獲得了仙人掌成熟酶K基因序列,同時構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹確定了該仙人掌成熟酶K基因的同源關(guān)系。本結(jié)果將為海南仙人掌的進(jìn)化研究提供科學(xué)線索。
【作者單位】: 文昌市農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全檢驗檢測站;中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶生物技術(shù)研究所農(nóng)業(yè)部熱帶作物生物學(xué)與遺傳資源利用重點(diǎn)實(shí)驗室;
【關(guān)鍵詞】仙人掌 matK基因 克隆 序列分析
【基金】:海南省自然科學(xué)基金項目(20153130,313076) 海南省創(chuàng)新引用集成專項(KJHZ2014-01)共同資助
【分類號】:S682.33;Q943.2
【正文快照】: Cloning and Sequence Analysis of mat K Gene from CactusWu Yupeng1Yu Naitong2*Zhou Qilin2Wang Jianhua2Liu Zhixin2*1 Quality and Safety Inspection Station of Agricultural Products,Wenchang,571300;2 Key Laboratory of Biology and Genetic Resources of Tropica

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本文編號:1123203

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