發(fā)布時間：2017-10-30 19:27

  本文關鍵詞：β-catenin調控小鼠腎臟發(fā)育的基因表達譜富集分析

  更多相關文章： β-catenin 腎臟 發(fā)育不全 基因表達譜 調控機制

【摘要】：敲除β-catenin基因的第3號外顯子可使其過表達。以往很多研究主要通過基因表達譜分析β-catenin過表達對腎臟發(fā)育產(chǎn)生的影響,并鑒定了多個關鍵基因。但相關通路及相關通路間的共表達模式(co-expression pattern)很少被涉及。本研究選取公共數(shù)據(jù)庫GEO(gene expression omnibus)中和小鼠β-catenin過表達腎臟轉錄組密切相關微陣列(microarray)數(shù)據(jù)集作為研究對象,并進行GSEA(gene set enrichment analysis)分析,篩選相關轉錄因子。我們鑒定出了63條被β-catenin上調的通路如Notch信號通路(Notch signaling pathway),以及43條被下調的通路如ABC轉運體(ABC transporters)等通路。最終,我們構建了包含有核心基因和轉錄因子如STATs的相關通路共表達網(wǎng)絡,我們的研究結果將幫助我們更好地在全基因組層面上了解β-catenin對于小鼠腎臟發(fā)育的調控作用。
【作者單位】： 安徽大學生命科學學院干細胞及轉化醫(yī)學研究中心;
【關鍵詞】： β-catenin 腎臟 發(fā)育不全 基因表達譜 調控機制
【基金】：安徽省自然科學基金面上項目(1508085MH189) 國家自然科學基金面上項目(Y06050525)共同資助
【分類號】：Q344
【正文快照】： 哺乳動物腎臟起源于中胚層外段的細胞團,腎臟發(fā)育主要經(jīng)歷3個階段,即原腎、中腎和后腎。小鼠的臨時性腎臟結構原腎和中腎形成于胚胎發(fā)育的第8~10天(即E8~E10時期),E10.5天后將發(fā)育出成熟的腎臟結構后腎(Lechner and Dressler,1997)。腎臟最終結構的形成依賴于輸尿管芽與后腎間

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本文編號：1118989