本文關(guān)鍵詞：β-catenin調(diào)控小鼠腎臟發(fā)育的基因表達(dá)譜富集分析

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【摘要】：敲除β-catenin基因的第3號外顯子可使其過表達(dá)。以往很多研究主要通過基因表達(dá)譜分析β-catenin過表達(dá)對腎臟發(fā)育產(chǎn)生的影響,并鑒定了多個關(guān)鍵基因。但相關(guān)通路及相關(guān)通路間的共表達(dá)模式(co-expression pattern)很少被涉及。本研究選取公共數(shù)據(jù)庫GEO(gene expression omnibus)中和小鼠β-catenin過表達(dá)腎臟轉(zhuǎn)錄組密切相關(guān)微陣列(microarray)數(shù)據(jù)集作為研究對象,并進(jìn)行GSEA(gene set enrichment analysis)分析,篩選相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子。我們鑒定出了63條被β-catenin上調(diào)的通路如Notch信號通路(Notch signaling pathway),以及43條被下調(diào)的通路如ABC轉(zhuǎn)運(yùn)體(ABC transporters)等通路。最終,我們構(gòu)建了包含有核心基因和轉(zhuǎn)錄因子如STATs的相關(guān)通路共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),我們的研究結(jié)果將幫助我們更好地在全基因組層面上了解β-catenin對于小鼠腎臟發(fā)育的調(diào)控作用。
【作者單位】： 安徽大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院干細(xì)胞及轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究中心;
【關(guān)鍵詞】： β-catenin 腎臟 發(fā)育不全 基因表達(dá)譜 調(diào)控機(jī)制
【基金】：安徽省自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目(1508085MH189) 國家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目(Y06050525)共同資助
【分類號】：Q344
【正文快照】： 哺乳動物腎臟起源于中胚層外段的細(xì)胞團(tuán),腎臟發(fā)育主要經(jīng)歷3個階段,即原腎、中腎和后腎。小鼠的臨時性腎臟結(jié)構(gòu)原腎和中腎形成于胚胎發(fā)育的第8~10天(即E8~E10時期),E10.5天后將發(fā)育出成熟的腎臟結(jié)構(gòu)后腎(Lechner and Dressler,1997)。腎臟最終結(jié)構(gòu)的形成依賴于輸尿管芽與后腎間

【相似文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

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