細(xì)粒棘球蚴RTN4基因的克隆及序列分析
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更多相關(guān)文章: 細(xì)粒棘球蚴 抗原基因 基因克隆 生物信息學(xué)分析
【摘要】:【目的】克隆細(xì)粒棘球蚴(Eg)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜蛋白4(Reticulon-4,RTN4)抗原基因,對(duì)其序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析!痉椒ā坎杉腥綞g的綿羊肝臟和肺臟,提取Eg頭節(jié)總RNA為模板,對(duì)RTN4基因進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增,將PCR產(chǎn)物克隆到pMD19-T載體后測(cè)序,對(duì)其核苷酸序列及氨基酸序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析。【結(jié)果】Eg RTN4cDNA全長654bp,編碼217個(gè)氨基酸,蛋白質(zhì)分子質(zhì)量為25.3ku,等電點(diǎn)為8.83。編碼氨基酸序列中含有1個(gè)N端;稽c(diǎn)、2個(gè)酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位點(diǎn)和4個(gè)蛋白激酶C磷酸化位點(diǎn)。經(jīng)生物信息學(xué)軟件預(yù)測(cè),RTN4蛋白的抗原表位區(qū)主要集中在第1-47位、第71-147位和第171-217位區(qū)域;含有2個(gè)高度疏水區(qū),2個(gè)跨膜區(qū),膜外區(qū)分別位于第1-47位和第171-217位!窘Y(jié)論】成功克隆了Eg RTN4基因,預(yù)測(cè)了其編碼蛋白抗原的結(jié)構(gòu)和表位。
【作者單位】: 石河子大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蘭州獸醫(yī)研究所;
【關(guān)鍵詞】: 細(xì)粒棘球蚴 抗原基因 基因克隆 生物信息學(xué)分析
【基金】:國家公益性(農(nóng)業(yè))行業(yè)專項(xiàng)(201303037) 國家國際科技合作項(xiàng)目(2014DFR31310) 新疆自治區(qū)研究生科研創(chuàng)新項(xiàng)目(XJGRI2014059)
【分類號(hào)】:S852.734
【正文快照】: 細(xì)粒棘球蚴病(Echinococcosis)是由中絳期細(xì)粒棘球蚴(Echinococcus granulosus,Eg)寄生于人和其他中間宿主的肝、肺、腹腔等內(nèi)臟器官形成機(jī)械性壓迫,造成不同程度的組織損傷和功能障礙,同時(shí)可導(dǎo)致過敏反應(yīng)引起死亡的一種人畜共患寄生蟲病[1-4]。由幼蟲棘球蚴引起的棘球蚴病,又
【相似文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):1117790
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