本文關(guān)鍵詞：基于PEG脅迫表達(dá)譜發(fā)掘調(diào)控谷子干旱脅迫的泛素連接酶E3基因

  更多相關(guān)文章： 谷子 泛素連接酶E 干旱脅迫 表達(dá)譜

【摘要】：[目的]探析谷子調(diào)控干旱脅迫的E3基因。[方法]本文基于二代測序技術(shù)獲得勾勾母雞咀(GG)和晉汾16(JF)在PEG脅迫下的轉(zhuǎn)錄表達(dá)譜數(shù)據(jù),運(yùn)用生物信息學(xué)檢索篩選出11個(gè)干旱相關(guān)的E3基因,對其理化性質(zhì)、功能域、啟動(dòng)子元件、表達(dá)模式以及與其它物種E3基因的系統(tǒng)進(jìn)化分析。[結(jié)果]蛋白等電點(diǎn)介于4.78~8.88之間,功能域主要為ZF_UBR型、ZF_RING和U_BOX型三類,啟動(dòng)子序列包含干旱誘導(dǎo)響應(yīng)元件MBS或脫落酸響應(yīng)元件ABRE等,其中Si001665m和Si022170m與PUB22/23親緣關(guān)系較近,Si029090m與PUB19親緣關(guān)系較近。[結(jié)論]初步確定這些是調(diào)控谷子干旱脅迫的E3候選基因,可能受干旱或脫落酸誘導(dǎo)表達(dá),這為進(jìn)一步研究谷子干旱響應(yīng)相關(guān)的泛素連接酶E3基因提供理論依據(jù)。
【作者單位】： 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院;特色雜糧種質(zhì)資源發(fā)掘與育種改良山西省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;山西農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)業(yè)生物工程研究所;農(nóng)業(yè)部黃土高原作物基因資源與種質(zhì)創(chuàng)制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 谷子 泛素連接酶E 干旱脅迫 表達(dá)譜
【基金】：國家自然科學(xué)基金(31371693,31471556,31401396)
【分類號(hào)】：S515
【正文快照】： 谷子(Setaria italica),禾本科,狗尾草屬,在我國已有7 000多年的栽培史[1],廣泛分布于我國北方干旱與半干旱地區(qū),具有抗旱耐貧瘠特性,是一種適應(yīng)性較廣的小雜糧。干旱是影響作物生長發(fā)育的關(guān)鍵因素之一,因此發(fā)掘谷子抗旱相關(guān)基因?qū)Ξa(chǎn)量提高尤為重要。泛素蛋白酶體系統(tǒng)(ubiquit

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本文編號(hào)：1095320