本文關(guān)鍵詞：基于微衛(wèi)星和線粒體基因的中國西北地區(qū)狼的分子生態(tài)學(xué)研究

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【摘要】：狼(Canis lupus)曾廣泛分布在亞歐大陸和北美地區(qū),是現(xiàn)存的最大的犬科動物。在我國,狼目前主要分布在新疆、西藏、青海、內(nèi)蒙、四川西部和云南西北部等人口密度較小的偏遠(yuǎn)地區(qū),而且呈現(xiàn)片段化分布。由于人類的干擾和棲息地的破壞,狼的生存現(xiàn)狀越來越令人擔(dān)憂,也受到越來越多的關(guān)注。本研究使用14對微衛(wèi)星引物對內(nèi)蒙、蒙古、新疆、青海和西藏5個地理種群的80個狼個體進(jìn)行分析,同時對5個地理種群的74個狼個體的線粒體DNA的控制區(qū)(D-loop)和細(xì)胞色素b(Cytb)的部分序列進(jìn)行系統(tǒng)分析。采用微衛(wèi)星DNA和mtDNA兩種不同的分子標(biāo)記探討5個地理種群狼的分子生態(tài)學(xué)問題。主要結(jié)果如下:1.篩選14對微衛(wèi)星位點(diǎn)分析狼的5個地理種群的遺傳多樣性。結(jié)果顯示,14個微衛(wèi)星位點(diǎn)的等位基因的數(shù)目在5-20之間不等,平均為9.786個,多態(tài)信息含量PIC為0.740,各地理種群的等位基因數(shù)平均為5.6個,平期望雜合度0.6778,平均觀察雜合度為0.6738。2.對狼的5個地理種群狼的線粒體HVRI和Cytb的部分序列分析。結(jié)果顯示,5個地理狼種群中共檢測出D-loop基因單倍型20種,Cytb基因單倍型19種。平均核苷酸多樣性為0.1084和0.0065,變異位點(diǎn)占序列長度的比例為7.90%和10.18%。3.利用STRUCTURE軟件的聚類結(jié)果,當(dāng)K=2時,5個狼地理種群間的遺傳結(jié)構(gòu)最為清晰。根據(jù)STRUCTURE的結(jié)果,利用AMOVA軟件對兩個大居群的5個狼地理種群進(jìn)行變異分析。結(jié)果顯示,居群間的變異比例是11%,種群間的變異比例是5%,主要變異產(chǎn)生在種群內(nèi)部,為84%。因此,中國西北地區(qū)的狼在各地理種群之間的遺傳分化不顯著,只是在兩個居群之間存在一定的遺傳分化。4.利用微衛(wèi)星與線粒體數(shù)據(jù)對狼的5個地理種群構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹,結(jié)果表現(xiàn)一致,即青海與西藏兩個地理種群聚為一支,而新疆、蒙古和外蒙三個地理種群聚為一支。5.根據(jù)Cytb基因分子鐘原理,計算出5個地理種群狼的分歧時間,青海與西藏兩個地理種群和新疆、內(nèi)蒙和外蒙三個地理種群之間的分化時間在1.175-1.3MYA前。推斷這一結(jié)果與青藏高原的隆起有關(guān)。6.從保護(hù)遺傳學(xué)的角度,我們建議將我國西北地區(qū)狼劃分為蒙新區(qū)和青藏區(qū)兩個ESUs進(jìn)行研究和管理。
【關(guān)鍵詞】：狼 微衛(wèi)星DNA 線粒體DNA 遺傳多樣性 系統(tǒng)分化
【學(xué)位授予單位】：曲阜師范大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：Q953
【目錄】：

• 摘要4-5
• Abstract5-9
• 第一章 綜述9-20
• 1.1 分子標(biāo)記9-15
• 1.1.1 線粒體9-11
• 1.1.2 微衛(wèi)星（microsatellite）11-15
• 1.2 狼的研究綜述15-18
• 1.2.1 狼的形態(tài)學(xué)研究15-16
• 1.2.2 狼的進(jìn)化以及與家犬的關(guān)系16-17
• 1.2.3 狼的分布與現(xiàn)狀17-18
• 1.2.4 中國狼的分布與分類18
• 1.3 本研究的目的和意義18-20
• 第二章 基于微衛(wèi)星標(biāo)記分析5個狼地理種群20-34
• 2.1 材料、藥品與儀器20-22
• 2.1.1 樣品信息20
• 2.1.2 儀器與試劑20-22
• 2.2 試驗(yàn)方法22-27
• 2.2.1 總DNA的提取22-24
• 2.2.2 微衛(wèi)星位點(diǎn)的初步篩選24-26
• 2.2.3 熒光引物設(shè)計與分組26
• 2.2.4 PCR擴(kuò)增體系與條件26
• 2.2.5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析方法26-27
• 2.3 微衛(wèi)星DNA的結(jié)果與分析27-31
• 2.3.1 種群的遺傳變異27-28
• 2.3.2 種群間的遺傳分化28-29
• 2.3.3 聚類分析29-30
• 2.3.4 不同地理種群間的遺傳結(jié)構(gòu)和分化30-31
• 2.4 討論31-34
• 2.4.1 5個地理種群狼的遺傳多樣性分析31-32
• 2.4.2 多態(tài)信息含量（PIC）32
• 2.4.3 等位基因數(shù)和基因雜合度32
• 2.4.4 種群間的遺傳分化32-33
• 2.4.5 種群間的遺傳結(jié)構(gòu)與變異分析33-34
• 第三章 基于線粒體基因分析5個狼地理種群34-58
• 3.1 材料、藥品與儀器34
• 3.2 試驗(yàn)方法34-36
• 3.2.1 引物信息34
• 3.2.2 目的片段擴(kuò)增的條件及體系34
• 3.2.3 凝膠電泳檢測及PCR產(chǎn)物回收測序34-36
• 3.2.4 線粒體數(shù)據(jù)的處理與分析36
• 3.3 線粒體DNA的結(jié)果與分析36-54
• 3.3.1 線粒體基因D-loop的HVRI部分序列結(jié)果與分析36-46
• 3.3.2 線粒體基因cytb部分序列結(jié)果與分析46-54
• 3.4 討論54-58
• 3.4.1 線粒體DNA序列的變異分析54-55
• 3.4.2 基于線粒體DNA的遺傳多樣性55
• 3.4.3 狼的分子系統(tǒng)地理學(xué)55-56
• 3.4.4 兩種分子標(biāo)記分析結(jié)果的比較分析56
• 3.4.5 狼的保護(hù)與管理建議56-58
• 第四章 結(jié)論與展望58-59
• 4.1 結(jié)論58
• 4.2 展望58-59
• 參考文獻(xiàn)59-71
• 在校期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文71-72
• 致謝72-73
• 附錄73-85

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1 陳曉敏;朱芬;張s，

本文編號：1087181