本文關(guān)鍵詞：龍骨馬尾杉PcHDR1基因克隆及序列分析

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【摘要】：該研究采用RT-PCR方法對龍骨馬尾杉Phlegmarirus carinatus(Desv.)Ching 1-羥基-2-甲基-2-(E)-丁烯基-4-焦磷酸還原酶[1-hydroxy-2-methyl-2-(E)-butenyl 4-diphosphate reductase,HDR]基因Pc HDR1的編碼區(qū)進(jìn)行克隆并利用生物信息學(xué)方法進(jìn)行序列分析。根據(jù)實(shí)驗(yàn)室已獲得的龍骨馬尾杉轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),從中獲得1條編碼HDR的轉(zhuǎn)錄本,采用RT-PCR方法獲得該基因的全長c DNA序列,所克隆的Pc HDR1基因編碼區(qū)長為1 437 bp,編碼478個(gè)氨基酸殘基,Gen Bank登錄號(hào)為JQ957845。Pc HDR1與銀杏Ginkgo biloba的HDR序列同源性最高,達(dá)78%。生物信息學(xué)預(yù)測Pc HDR1蛋白沒有跨膜區(qū),具有Lyt B保守結(jié)構(gòu)域,不含信號(hào)肽。該研究克隆并獲得了龍骨馬尾杉Pc HDR1基因的編碼區(qū)序列,并對其編碼的蛋白進(jìn)行了序列分析及結(jié)構(gòu)域預(yù)測,為進(jìn)一步研究HDR的功能奠定基礎(chǔ)。
【作者單位】： 中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院藥用植物研究所瀕危藥材繁育國家工程實(shí)驗(yàn)室;長江大學(xué)園藝園林學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： -羥基--甲基--(E)-丁烯基--焦磷酸還原酶 龍骨馬尾杉 萜類生物合成
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(30900113) 教育部長江學(xué)者和創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)發(fā)展計(jì)劃項(xiàng)目(IRT1150)
【分類號(hào)】：S567.239
【正文快照】： 2.長江大學(xué)園藝園林學(xué)院,湖北荊州434025)龍骨馬尾杉Phlegmarirus carinatus(Desv.)Ching是石杉科馬尾杉屬的代表物種[1]。龍骨馬尾杉中含有石松生物堿(lycopodium alkaloids)、萜類(triterpenes)、有機(jī)酸(phenolic acids)和黃酮(fla-vones)等多種成分[2-3],全草入藥,具有重要

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中國重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 張鑫;羅紅梅;殷秀梅;宋經(jīng)元;;龍骨馬尾杉PcFPS1基因克隆及序列分析[A];中藥與天然藥高峰論壇暨第十二屆全國中藥和天然藥物學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2012年

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本文編號(hào)：1068300