ROS1融合基因檢測(cè)方法的建立
發(fā)布時(shí)間:2017-10-18 21:00
本文關(guān)鍵詞:ROS1融合基因檢測(cè)方法的建立
更多相關(guān)文章: 肺癌驅(qū)動(dòng)基因 ROS原癌基因 融合基因 熒光聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng) 個(gè)體化靶向治療
【摘要】:目的:建立檢測(cè)ROS1融合基因的熒光PCR法,為肺癌病人的個(gè)體化藥物治療提供新的檢測(cè)試劑盒。方法:根據(jù)人類(lèi)ROS1基因的外顯子和融合伙伴基因的外顯子序列設(shè)計(jì)引物和探針,建立ROS1融合基因的熒光PCR法。然后采用不同ROS1基因融合的假病毒質(zhì)粒作為質(zhì)控品,評(píng)價(jià)方法的準(zhǔn)確性、檢測(cè)限和特異性。檢測(cè)350例臨床樣本,并與直接測(cè)序結(jié)果進(jìn)行比較,評(píng)價(jià)方法的臨床適用性。結(jié)果:建立的ROS1融合基因PCR-熒光探針?lè)?能準(zhǔn)確檢測(cè)出14種不同的ROS1融合基因;檢測(cè)限是不高于總量0.01μg的RNA模板;正常人RNA的結(jié)果顯示為融合突變陰性。臨床樣本的結(jié)果與測(cè)序結(jié)果的一致性好,Kappa值為1.00。結(jié)論:建立的ROS1融合基因檢測(cè)方法具有很好的準(zhǔn)確性、檢測(cè)限和特異性,并且具有很好的臨床適用性。
【作者單位】: 中國(guó)食品藥品檢定研究院;湖北省腫瘤醫(yī)院檢驗(yàn)科;武漢友芝友醫(yī)療科技有限公司;
【關(guān)鍵詞】: 肺癌驅(qū)動(dòng)基因 ROS原癌基因 融合基因 熒光聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng) 個(gè)體化靶向治療
【分類(lèi)號(hào)】:R734.2
【正文快照】: 2方法2.1方法的建立應(yīng)用Primer Premier 5.0及Primer Express 3.0軟件,根據(jù)ROS1基因的外顯子(32、34、35、36)序列和融合伙伴基因(SLC34A2、CD74、SDC4、EZR、LRIG3、TPM3和GOPC)斷裂外顯子序列,設(shè)計(jì)特異性引物和探針,同時(shí)選擇β2微球蛋白(B2M)基因作為質(zhì)控基因。通過(guò)4個(gè)不同
【相似文獻(xiàn)】
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1 黃明,楊桂斌;長(zhǎng)期生存的急性早幼粒細(xì)胞白血病PML/RARα融合基因的變化及意義[J];白血病.淋巴瘤;2004年01期
2 朱曉華;高怡瑾;楊毅;吳s,
本文編號(hào):1057105
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