本文關(guān)鍵詞：侵染新疆甜瓜的ZYMV衣殼蛋白基因克隆及其序列分析

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【摘要】：新疆作為中國有名的瓜果之鄉(xiāng),其瓜類不僅成為其中最具代表性的品牌也日益成為農(nóng)民增收致富的經(jīng)濟支柱產(chǎn)業(yè)。然而近年來由于新疆瓜果日益受到病毒病威脅,嚴(yán)重時造成大面積減產(chǎn)甚至絕收,大幅度制約了農(nóng)民生產(chǎn)積極性和生活水平的提高。小西葫蘆黃花葉病毒(Zucchini yellow mosaic virus,ZYMV)是其中比較具有代表性的病毒,為了對新疆不同主栽地區(qū)甜瓜(Cucumis melo)ZYMV進(jìn)行生物防治和抗病毒甜瓜的研究。本研究利用同源克隆的方法,擴增獲得了新疆19個樣點ZYMV分離物衣殼蛋白(coat protein,CP)基因全長序列,ZYMV分離物CP基因全長介于1 080~1 180 bp,編碼253~301個氨基酸,蛋白質(zhì)大小約33 k D。序列比對發(fā)現(xiàn),ZYMV核酸序列的3'和5'非編碼區(qū)末端保守性較低,編碼區(qū)及其周圍序列保守性較高,氨基酸序列的N端保守性高于C端。ZYMV同源性比對結(jié)果發(fā)現(xiàn),病毒屬于同一ZYMV基因型。通過核酸序列構(gòu)建的分子進(jìn)化樹可以將ZYMV分為4個亞組,亞組分離依據(jù)符合地區(qū)分布特性。根據(jù)對蛋白質(zhì)理化性質(zhì),包括蛋白質(zhì)的動力學(xué)、化學(xué)和熱力學(xué)穩(wěn)定性分析得出,ZYMV均屬于穩(wěn)定性蛋白。結(jié)合新疆夏季平均降水量和平均氣溫變化趨勢發(fā)現(xiàn),其與對應(yīng)地區(qū)ZYMV CP的疏水性指數(shù)和脂溶性指數(shù)的變化趨勢存在一定相關(guān)性。分析認(rèn)為,不同地區(qū)ZYMV CP的穩(wěn)定性存在一定的差異,這可能與新疆特殊的氣候條件與分離物所處地理環(huán)境有關(guān)。本研究通過序列分析獲得19個樣點ZYMV CP核酸序列以及CP特征,為今后以RNA干擾技術(shù)或基因組編輯技術(shù)培育抗病毒甜瓜,進(jìn)行生物農(nóng)藥研發(fā)等提供了基礎(chǔ)的數(shù)據(jù)支持,同時為開展對植物病毒的致病機理以及探究環(huán)境與病毒傳播機制的研究提供初期的研究方向。
【作者單位】： 新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院;新疆農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所/農(nóng)業(yè)部西北荒漠綠洲作物有害生物綜合治理重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】： 新疆 小西葫蘆黃瓜花葉病毒(ZYMV) 克隆 序列分析 蛋白穩(wěn)定性 環(huán)境影響
【基金】：中國科學(xué)院“西部之光”人才培養(yǎng)計劃項目(No.YB201307)
【分類號】：S436.5
【正文快照】： 烏魯木齊830091小西葫蘆黃花葉病毒(Zucchini yellow mosaicvirus,ZYMV)為馬鈴薯Y病毒屬(Potyvirus)重要成員,是一種廣泛分布于葫蘆科作物,具有世界性危害的主要病毒(古勤生等,2003)。20世紀(jì)70年代初在歐洲首次被發(fā)現(xiàn),其后在中東、美國、法國和臺灣等地區(qū)開始大規(guī)模流行與蔓延

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