本文關(guān)鍵詞：香樟1-脫氧-D-木酮糖-5-磷酸還原異構(gòu)酶基因CcDXR1的克隆和表達(dá)分析

  更多相關(guān)文章： 香樟 -磷酸脫氧木酮糖還原異構(gòu)酶 RACE 生物信息學(xué) 表達(dá)分析

【摘要】：1-脫氧-D-木酮糖-5-磷酸還原異構(gòu)酶(1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate reductoisomerase,DXR)是萜類甲基赤蘚醇-4-磷酸途徑(methylerythritol-4-phosphate pathway,DXP/MEP)上的第二個(gè)限速酶。本研究以5種化學(xué)型的香樟(Cinnamomum camphora)作為實(shí)驗(yàn)材料,基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),運(yùn)用快速擴(kuò)增c DNA末端技術(shù)(RACE),從香樟中克隆出DXR基因的c DNA,命名為Cc DXR1(Gen Bank登錄號(hào):KU886266)。該基因開放閱讀框(ORF)長1 413 bp,編碼470個(gè)氨基酸殘基,生物信息學(xué)分析推測其分子質(zhì)量為51.1 k D,等電點(diǎn)(Theoretical p I)為6.62,不含信號(hào)肽,不存在跨膜結(jié)構(gòu)。結(jié)合蛋白質(zhì)保守區(qū)以及進(jìn)化樹分析,證實(shí)該基因確為DXR家族基因。利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測得出香樟中CcDXR1基因在成熟葉片表達(dá)量高于幼嫩葉片,根與葉中表達(dá)量相當(dāng),枝中最低。Cc DXR1在香樟5種化學(xué)型中的表達(dá)量不同,在龍腦樟中的表達(dá)量要高于油樟、芳樟、腦樟和異樟4種化學(xué)型。本研究首次從香樟中克隆出了Cc DXR1序列全長,并揭示了Cc DXR1在不同組織、生長時(shí)期及5種化學(xué)型中的差異表達(dá),為香樟萜類化合物生物合成途徑關(guān)鍵酶基因的挖掘提供研究基礎(chǔ)。
【作者單位】： 安徽中醫(yī)藥大學(xué)藥學(xué)院;中國中醫(yī)科學(xué)院中藥資源中心道地藥材國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室培育基地;
【關(guān)鍵詞】： 香樟 -磷酸脫氧木酮糖還原異構(gòu)酶 RACE 生物信息學(xué) 表達(dá)分析
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(30901963)
【分類號(hào)】：Q943.2
【正文快照】： 不含信號(hào)肽,不存在跨膜結(jié)構(gòu)。結(jié)合蛋白質(zhì)保守區(qū)以及進(jìn)化樹分析,證實(shí)該基因確為DXR家族基因。利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測得出香樟中Cc DXR1基因在成熟葉片表達(dá)量高于幼嫩葉片,根與葉中表達(dá)量相當(dāng),枝中最低。Cc DXR1在香樟5種化學(xué)型中的表達(dá)量不同,在龍腦樟中的表達(dá)量要高于油樟、

【相似文獻(xiàn)】

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 馬靚;煙草5-磷酸脫氧木酮糖還原異構(gòu)酶（DXR）基因全長cDNA的克隆及序列分析[D];華中科技大學(xué);2007年

，

本文編號(hào)：1046714