本文關(guān)鍵詞：大豆MPBQ-MT基因的克隆與生物信息學(xué)分析

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【摘要】：以大豆品種合豐25和Bayfield為材料,克隆大豆2-甲基-6-植基-1,4-苯醌甲基轉(zhuǎn)移酶(MPBQMTase)基因,獲得1 029 bp的MPBQ-MT基因c DNA序列。通過(guò)序列比對(duì)發(fā)現(xiàn)10個(gè)大豆MPBQ-MT基因c DNA區(qū)內(nèi)的潛在SNP位點(diǎn)。采用生物信息學(xué)方法分析MPBQ-MT基因編碼的氨基酸序列和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)。結(jié)果表明:MPBQ-MT基因CDS區(qū)共編碼342個(gè)氨基酸,其中纈氨酸(Val)含量最多,占該基因編碼氨基酸總數(shù)的8.8%;半胱氨酸(Cys)含量最少,占該基因編碼氨基酸總數(shù)的1.2%;MPBQ-MT蛋白N端包含由58個(gè)氨基酸組成的葉綠體轉(zhuǎn)運(yùn)肽,為親水性蛋白質(zhì)。合豐25與Bayfield的MPBQ-MT蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)有所不同,2個(gè)品種的MPBQ-MT蛋白質(zhì)中α-螺旋分別約占25.44%和27.49%,β-轉(zhuǎn)角分別約占9.36%和9.06%,無(wú)規(guī)則卷曲分別約占40.35%和38.60%。2個(gè)品種的MPBQMT蛋白質(zhì)中片層結(jié)構(gòu)均約占24.85%。兩個(gè)品種的MPBQ-MT蛋白質(zhì)均有1個(gè)S-腺苷基甲硫氨酸結(jié)合位點(diǎn)。對(duì)MPBQ-MT蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè),發(fā)現(xiàn)去掉轉(zhuǎn)運(yùn)肽后,MPBQ-MT蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)主要由11個(gè)連續(xù)的α-螺旋區(qū)域和8個(gè)連續(xù)的片層結(jié)構(gòu)區(qū)域組成。結(jié)合MPBQ-MT蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)對(duì)MPBQ-MT基因的生物學(xué)功能進(jìn)一步分析,提出了較為合理的MPBQ-MT作用模型。由系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)可知MPBQ-MT蛋白在大豆與菜豆中的親緣關(guān)系較近。
【作者單位】： 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)大豆生物學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/農(nóng)業(yè)部東北大豆生物學(xué)與遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 大豆 維生素E MPBQ-MT基因 生物信息學(xué)分析
【基金】：中國(guó)博士后項(xiàng)目(20110491025) 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)博士啟動(dòng)基金(2012RCB32)
【分類(lèi)號(hào)】：S565.1
【正文快照】： 維生素E是一種脂溶性的維生素,又稱(chēng)生育酚、生殖維生素等,是一類(lèi)廣泛存在于高等動(dòng)植物體內(nèi)的天然強(qiáng)抗氧化劑。維生素E是一類(lèi)同系物的總稱(chēng),自然界中有8種類(lèi)型,分別為α、β、γ和δ-生育酚(toeopherol)及α、β、γ和δ-生育三烯酚(to-cotrienol)[1],它們的區(qū)別在于苯環(huán)上甲基

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1046556