基于表達(dá)譜芯片數(shù)據(jù)的阿爾茨海默病易感基因的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)挖掘
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【摘要】:目的:采用生物信息學(xué)對阿爾茨海默病(AD)表達(dá)譜芯片結(jié)果進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘,尋找影響AD發(fā)病的差異表達(dá)基因,為AD的前期有效預(yù)防提供一定的基礎(chǔ)。方法:從GEO數(shù)據(jù)庫中下載符合條件的表達(dá)譜芯片研究結(jié)果,通過Expression Console對數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理后,導(dǎo)入Transcriptome Analysis Console進(jìn)行數(shù)據(jù)分析比較。將得到的數(shù)據(jù)導(dǎo)入在線分析工具DAVID、Topp Gene、STRING中對差異表達(dá)基因進(jìn)行篩選,同時進(jìn)行GO分析及Pathway分析。結(jié)果:本次研究共納入3項以人腦海馬組織為樣本的獨立實驗。24個差異表達(dá)基因中上調(diào)的基因共有18個,下調(diào)基因6個。NEFM和SV2B基因與神經(jīng)突觸信號傳導(dǎo)關(guān)系密切,與AD的發(fā)病有一定的聯(lián)系。結(jié)論:AD的發(fā)病可能與NEFM和SV2B基因密切相關(guān),尚需具體實驗進(jìn)行更深一步研究。
【作者單位】: 首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京天壇醫(yī)院;首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京世紀(jì)壇醫(yī)院;
【關(guān)鍵詞】: 阿爾茨海默病 生物信息 表達(dá)譜芯片 基因
【基金】:國家自然科學(xué)基金青年基金資助項目(81402814)
【分類號】:R749.16
【正文快照】: 阿爾茨海默病(Alzheimer's disease,AD)是嚴(yán)重影響老年人生活質(zhì)量的危險疾病之一[1-2]。AD的發(fā)病機制很復(fù)雜,呈現(xiàn)多樣性和不確定性,臨床診斷的AD患者多已處于中晚期,現(xiàn)有治療均難以取得滿意療效[3]。自1906年11月德國病理學(xué)和精神病學(xué)醫(yī)師Alois Alzheimer首次報道1例老年性癡
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,本文編號:1040718
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