本文關鍵詞：miR-199a-3p靶基因預測及生物信息學分析

  更多相關文章： miR-a-p 生物信息學 mTOR GO富集分析 KEGG Pathway分析 膀胱癌 PIK-Akt MAPK 蛋白聚糖

【摘要】：目的為深入研究miR-199a-3p在膀胱癌形成和發(fā)展中的作用提供理論依據。方法分析miR-199a-3p序列,預測其靶基因和轉錄因子,并對靶基因進行GO富集和KEGG Pathway分析;構建TF-miR-199a-3p-靶基因網絡調控圖。結果 miR-199a-3p序列在多物種間具有高度保守性;GO分析發(fā)現miR-199a-3p的靶基因參與細胞調節(jié)、代謝調節(jié)、細胞大分子生物合成等生物過程(P0.01);KEGG Pathway分析發(fā)現miR-199a-3p的靶基因顯著富集在上皮細胞的細菌入侵通路、ECM受體的相互作用通路、PI3K-Akt信號通路、MAPK信號通路、小細胞肺癌通路、癌癥中的蛋白聚糖通路等;根據構建的TF-miR-199a-3p-靶基因網絡調控圖,挖掘出可能受miR-199a-3p調控的重要基因有MYC、SP1、mTOR、NFκB、NFκB1等。結論 miR-199a-3p可能通過直接靶向作用mTOR,調節(jié)PI3K-Akt-mTOR信號通路,從而參與膀胱癌的形成和發(fā)展。
【作者單位】： 陜西省臨床檢驗中心;西安交通大學第一附屬醫(yī)院檢驗科;
【關鍵詞】： miR-a-p 生物信息學 mTOR GO富集分析 KEGG Pathway分析 膀胱癌 PIK-Akt MAPK 蛋白聚糖
【分類號】：R737.14
【正文快照】： miRNA是高度保守的非蛋白編碼的小RNA,長度約22nt。成熟的miRNA通過介導目的基因沉默,使靶miRNA降解,從而調控轉錄后基因表達水平[1]。miRNA幾乎參與了所有生命活動過程的調節(jié),并且在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展中起重要作用。多項研究表明許多miRNA參與膀胱癌的進展,文獻報道m(xù)iR-199a-3

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