本文關(guān)鍵詞：miR-199a-3p靶基因預(yù)測(cè)及生物信息學(xué)分析

  更多相關(guān)文章： miR-a-p 生物信息學(xué) mTOR GO富集分析 KEGG Pathway分析 膀胱癌 PIK-Akt MAPK 蛋白聚糖

【摘要】：目的為深入研究miR-199a-3p在膀胱癌形成和發(fā)展中的作用提供理論依據(jù)。方法分析miR-199a-3p序列,預(yù)測(cè)其靶基因和轉(zhuǎn)錄因子,并對(duì)靶基因進(jìn)行GO富集和KEGG Pathway分析;構(gòu)建TF-miR-199a-3p-靶基因網(wǎng)絡(luò)調(diào)控圖。結(jié)果 miR-199a-3p序列在多物種間具有高度保守性;GO分析發(fā)現(xiàn)miR-199a-3p的靶基因參與細(xì)胞調(diào)節(jié)、代謝調(diào)節(jié)、細(xì)胞大分子生物合成等生物過程(P0.01);KEGG Pathway分析發(fā)現(xiàn)miR-199a-3p的靶基因顯著富集在上皮細(xì)胞的細(xì)菌入侵通路、ECM受體的相互作用通路、PI3K-Akt信號(hào)通路、MAPK信號(hào)通路、小細(xì)胞肺癌通路、癌癥中的蛋白聚糖通路等;根據(jù)構(gòu)建的TF-miR-199a-3p-靶基因網(wǎng)絡(luò)調(diào)控圖,挖掘出可能受miR-199a-3p調(diào)控的重要基因有MYC、SP1、mTOR、NFκB、NFκB1等。結(jié)論 miR-199a-3p可能通過直接靶向作用mTOR,調(diào)節(jié)PI3K-Akt-mTOR信號(hào)通路,從而參與膀胱癌的形成和發(fā)展。
【作者單位】： 陜西省臨床檢驗(yàn)中心;西安交通大學(xué)第一附屬醫(yī)院檢驗(yàn)科;
【關(guān)鍵詞】： miR-a-p 生物信息學(xué) mTOR GO富集分析 KEGG Pathway分析 膀胱癌 PIK-Akt MAPK 蛋白聚糖
【分類號(hào)】：R737.14
【正文快照】： miRNA是高度保守的非蛋白編碼的小RNA,長(zhǎng)度約22nt。成熟的miRNA通過介導(dǎo)目的基因沉默,使靶miRNA降解,從而調(diào)控轉(zhuǎn)錄后基因表達(dá)水平[1]。miRNA幾乎參與了所有生命活動(dòng)過程的調(diào)節(jié),并且在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展中起重要作用。多項(xiàng)研究表明許多miRNA參與膀胱癌的進(jìn)展,文獻(xiàn)報(bào)道m(xù)iR-199a-3

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