本文關(guān)鍵詞：香蕉β-淀粉酶基因家族的系統(tǒng)進(jìn)化分析

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【摘要】：β-淀粉酶(beta-amylase,Bmy)是一類關(guān)鍵的淀粉水解酶,在香蕉果實(shí)成熟淀粉降解轉(zhuǎn)化為可溶性糖的過(guò)程中發(fā)揮著重要的作用。為了全面了解Bmy基因在香蕉基因組中的特征,研究基于香蕉基因組數(shù)據(jù),通過(guò)生物信息學(xué)的方法對(duì)香蕉Bmy基本理化性質(zhì)、二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)、亞細(xì)胞定位、內(nèi)含子和外顯子結(jié)構(gòu)和保守結(jié)構(gòu)域進(jìn)行初步的預(yù)測(cè)與分析,并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。結(jié)果表明:編碼香蕉β-淀粉酶的基因有15個(gè),根據(jù)在染色體的位置命名為Ma Bmy1~15,Ma Bmy基因家族編碼的氨基酸范圍在68~1 453 aa,編碼的蛋白相對(duì)分子量介于7.8~162.6 ku之間,15個(gè)Ma Bmy蛋白中有10個(gè)偏酸性,5個(gè)偏堿性。不穩(wěn)定指數(shù)分析發(fā)現(xiàn)6個(gè)Ma Bmy蛋白為穩(wěn)定蛋白;疏水性分析表明,所有的Ma Bmy蛋白為親水性蛋白;香蕉Ma Bmy家族內(nèi)含子最少含有2個(gè),最多的含有10個(gè);進(jìn)化分析表明,Ma Bmy家族分4個(gè)亞家族,且與水稻的親緣關(guān)系較近。研究結(jié)果為深入探討Ma Bmy基因的功能及調(diào)控香蕉果實(shí)成熟的應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。
【作者單位】： 中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院南亞熱帶作物研究所農(nóng)業(yè)部熱帶果樹(shù)生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 香蕉 β-淀粉酶 基因家族 系統(tǒng)進(jìn)化分析
【基金】：國(guó)家香蕉產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系湛江試驗(yàn)站項(xiàng)目(No.CARS-32-12) 海南省自然科學(xué)基金(No.20153134)
【分類號(hào)】：S668.1
【正文快照】： Bmy(EC3.2.1.2)是一種外切酶,作用于α-1,4-線性糖苷鏈的非還原末端,逐次以麥芽糖為單位切斷α-1,4-葡聚糖鏈,從而產(chǎn)生麥芽糖和有限糊精[1]。Bmy屬于糖苷水解酶家族14,含有一個(gè)保守結(jié)構(gòu)域Glyco_hydro_14結(jié)構(gòu)域(PF01373)。這個(gè)保守結(jié)構(gòu)域含有2個(gè)高度保守的區(qū)域,分別位于N端以及

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 王慧超;冉燕;喬辰;;發(fā)芽蠶豆β-淀粉酶的提取研究[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2010年01期

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 段念;PtrBAM1的抗寒功能鑒定及其與CBF的互作研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

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本文編號(hào)：1025243