本文關(guān)鍵詞：11條白樺BpSPL家族基因的生物信息學(xué)和表達(dá)分析

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【摘要】：[目的]研究白樺中SPL轉(zhuǎn)錄因子的基因序列特征及其在不同時(shí)期不同組織中的表達(dá)規(guī)律。[方法]依據(jù)白樺45個(gè)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果,共獲得12條全長(zhǎng)SPL基因,依次命名為白樺BpSPL1-BpSPL12,對(duì)其中11條BpSPL進(jìn)行了生物信息學(xué)及基因表達(dá)特征分析。[結(jié)果]生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),11條BpSPL均含有1個(gè)高度保守的SBP結(jié)構(gòu)域,且基因長(zhǎng)度差異較大,含有2 10個(gè)不等數(shù)目的外顯子,系統(tǒng)進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn)11條白樺SPL分屬于六大類SPL蛋白;qRT-PCR分析結(jié)果顯示,白樺BpSPL基因在不同時(shí)期的葉、頂芽、莖、雄花序中表達(dá)變化顯著,多數(shù)SPL基因在頂芽中7月5日和8月20日至9月20日時(shí)期表達(dá)較高,除BpSPL1基因外在雄花序從6月份到9月份的生長(zhǎng)階段中,SPL的表達(dá)水平呈現(xiàn)逐漸升高的總體趨勢(shì)。[結(jié)論]BpSPL基因可能參與到了白樺頂芽和雄花序的生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程。
【作者單位】： 林木遺傳育種國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室東北林業(yè)大學(xué);
【關(guān)鍵詞】： 白樺 BpSPL基因家族 生物信息學(xué) 基因表達(dá)
【基金】：“十二五”農(nóng)村領(lǐng)域國(guó)家科技計(jì)劃課題—“水曲柳和白樺珍貴用材林定向培育技術(shù)研究與示范”(2012BAD21B02)
【分類號(hào)】：S792.153
【正文快照】： SPL(SQUAMOSA PROMOTER BINDING PROTEIN-LIKE)基因編碼高等植物所特有的轉(zhuǎn)錄因子,其典型特征是含有一個(gè)高度保守的SBP(Squamosa promoterBinding Protein)結(jié)構(gòu)域。在擬南芥(Arabidopsis thalianaL.Heynh)中研究發(fā)現(xiàn),SPL基因是花時(shí)調(diào)控的關(guān)鍵基因。At SPL3編碼的蛋白能夠識(shí)別，

本文編號(hào)：1020120