本文關(guān)鍵詞：甜瓜乙烯應(yīng)答因子基因CmERF Ⅰ-14的生物信息學(xué)分析

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【摘要】：本研究采用生物信息學(xué)的方法對甜瓜數(shù)據(jù)庫中的甜瓜乙烯應(yīng)答因子基因ERFⅠ-14(登錄號:MEL O3C014441)的啟動子特性、RNA結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)、導(dǎo)肽、信號肽、跨膜結(jié)構(gòu)域、蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)、三級結(jié)構(gòu)及功能域等進(jìn)行預(yù)測和推斷。結(jié)果表明,CmERFⅠ-14基因的開放閱讀框(ORF)長645 bp,編碼214個氨基酸,蛋白質(zhì)的分子量約為23 kD,理論等電點(diǎn)為6.59,不存在導(dǎo)肽和信號肽,無跨膜結(jié)構(gòu)域,二級結(jié)構(gòu)中最主要的結(jié)構(gòu)元件是無規(guī)則卷曲,包含一個AP2/ERF功能結(jié)構(gòu)域,預(yù)測到8個可能的互作蛋白和多個啟動子元件,沒有預(yù)測到CpG島。系統(tǒng)發(fā)育分析發(fā)現(xiàn),其與黃瓜ERF3-like蛋白(XP_004140127.1)親緣關(guān)系最近。
【作者單位】： 內(nèi)蒙古大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院內(nèi)蒙古自治區(qū)牧草與特色作物生物技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 甜瓜 乙烯應(yīng)答因子 ERF 生物信息學(xué)分析
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31360486) 國家級大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計劃項(xiàng)目(201410126032)共同資助
【分類號】：S652;Q943.2
【正文快照】： Bioinformatics Analysis of Melon Ethylene Response Factor Gene Cm ERFⅠ-14Ju Linfang Duan Shangyao Zhang Yan Hasi Agula Niu Yiding*Inner Mongolia Key Laboratory of HerbageEndemic Crop Biotechnology,College of Life Sciences,Inner Mongolia University,Hohh，

本文編號：1010992