番茄JMJ524基因調(diào)控SlGLD1的DNA甲基化分析
發(fā)布時間:2017-10-10 08:14
本文關(guān)鍵詞:番茄JMJ524基因調(diào)控SlGLD1的DNA甲基化分析
更多相關(guān)文章: JmjC GLD DNA甲基化 番茄
【摘要】:旨在分析番茄JMJ524基因如何通過影響Sl GLD1的DNA甲基化程度來調(diào)控其表達(dá),從而導(dǎo)致番茄的赤霉素不敏感的矮化。利用生物信息學(xué)和BSP(Bisulfite sequencing PCR)分析JMJ524抑制系和野生型的Sl GLD1的DNA甲基化程度。結(jié)果顯示,分離出Sl GLD1的啟動子序列,發(fā)現(xiàn)其啟動子區(qū)域含有3個GA響應(yīng)的順式作用元件;Sl GLD1的啟動子區(qū)域和編碼區(qū)的DNA是高度甲基化的,而且在不同組織部位和突變體中的甲基化模式是不一樣的;在基因的編碼區(qū)發(fā)現(xiàn)了兩個GC島,推測Sl GLD1的甲基化可能發(fā)生在基因的編碼區(qū);針對這兩個GC島進(jìn)行的BSP分析結(jié)果表明:Sl GLD1的這兩個區(qū)段的DNA Cp G是高度甲基化的,而且在JMJ524抑制系中,DNA的整體甲基化,特別是Cp G甲基化程度顯著低于野生型對照M82。JMJ524抑制表達(dá)導(dǎo)致了Sl GLD1的基因甲基化程度降低,從而激活這個基因的表達(dá),可能是導(dǎo)致番茄植株矮化的一個因素。
【作者單位】: 西南大學(xué)園藝園林學(xué)院南方山地園藝學(xué)重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】: JmjC GLD DNA甲基化 番茄
【基金】:國家自然科學(xué)基金項目(31301779) 重慶市基礎(chǔ)與前沿研究計劃一般項目(cstc2015jcyj A80030) 中央高;緲I(yè)務(wù)費專項基金項目(XDJK2014B045,XDJK2016E148)
【分類號】:S641.2;Q943.2
【正文快照】: 組蛋白修飾、染色體重塑、DNA甲基化和小RNA介導(dǎo)的m RNA降解等,這些表觀遺傳機(jī)制在調(diào)控相關(guān)基因的表達(dá)過程中具有很重要的作用和功能,而且是植物生長發(fā)育和對環(huán)境的適應(yīng)過程中必不可少的。其中DNA甲基化不僅在表觀途徑中調(diào)控著相關(guān)基因的表達(dá),而且還會影響基因組的穩(wěn)定性[1,2],
本文編號:1005273
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