DNA磷酸化及T4多聚核苷酸激酶的納米孔單分子檢測(cè)研究
發(fā)布時(shí)間:2023-04-02 06:57
暴露于環(huán)境毒物和壓力源、輻射、藥物、炎癥、細(xì)胞呼吸以及常規(guī)DNA代謝都會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞毒性DNA鏈斷裂的產(chǎn)生,DNA鏈斷裂后通常缺少DNA合成和DNA連接所需的5’-磷酸和3’-羥基的部分。如果不能解決DNA末端的損傷,會(huì)導(dǎo)致DNA復(fù)制和修復(fù)異常,造成基因組不穩(wěn)定性、誘變、神經(jīng)疾病、衰老以及癌的發(fā)生。T4多聚核苷酸激酶(T4 PNK)是生物體內(nèi)常見(jiàn)的激酶之一,具有5’-激酶和3’-磷酸酶活性。該酶的5’-激酶活性能夠催化ATP的γ-磷酸轉(zhuǎn)移到多核苷酸的5’-羥基末端,是修復(fù)生物體基因損傷的重要生物酶。傳統(tǒng)上多采用放射性同位素32P-標(biāo)記、聚丙烯酰胺凝膠電泳和放射自顯影測(cè)定DNA的磷酸化和T4 PNK活性。這些方法過(guò)程繁瑣、耗時(shí)費(fèi)力且放射性標(biāo)記會(huì)引起健康問(wèn)題。近年來(lái),納米孔單分子技術(shù)因其具有免標(biāo)記、高通量、低成本等優(yōu)勢(shì)而迅速成為分析化學(xué)領(lǐng)域極具潛力的檢測(cè)手段。本文以α-溶血素(α-hemolysin,α-HL)蛋白質(zhì)納米孔為傳感元件,設(shè)計(jì)使用發(fā)夾結(jié)構(gòu)的DNA,實(shí)現(xiàn)了DNA磷酸化和T4多聚核苷酸激酶的單分子檢測(cè)分析。本論文主要研究?jī)?nèi)容如下:1、文獻(xiàn)綜述本章簡(jiǎn)要綜述了單分子技...
【文章頁(yè)數(shù)】:84 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 緒論
1.1 單分子分析技術(shù)的研究進(jìn)展
1.2 納米孔單分子分析技術(shù)的研究進(jìn)展
1.2.1 納米孔單分子技術(shù)的檢測(cè)原理
1.2.2 納米孔的分類(lèi)
1.3 α-溶血素納米孔簡(jiǎn)介
1.4 α-溶血素納米孔在檢測(cè)基因表觀遺傳修飾方面的應(yīng)用
1.4.1 DNA甲基化的檢測(cè)
1.4.2 DNA損傷的檢測(cè)
1.4.3 Micro RNA的檢測(cè)
1.4.4 G-四鏈體及其折疊過(guò)程的檢測(cè)
1.5 α-溶血素納米孔在單分子酶反應(yīng)研究方面的應(yīng)用
1.6 T4多聚核苷酸激酶
1.6.1 T4PNK簡(jiǎn)介
1.6.2 T4PNK活性的檢測(cè)以及抑制劑的篩選
1.7 本課題的研究意義
參考文獻(xiàn)
第二章 基于α-HL納米孔單分子技術(shù)對(duì)DNA磷酸化的檢測(cè)
2.1 前言
2.2 實(shí)驗(yàn)部分
2.2.1 實(shí)驗(yàn)試劑
2.2.2 實(shí)驗(yàn)儀器
2.2.3 實(shí)驗(yàn)裝置
2.2.4 電解池和電極的制備
2.2.5 磷脂雙分子層的形成
2.2.6 天然α-HL蛋白質(zhì)(WT)7的制備
2.2.7 DNA序列
2.2.8 溶液的配制
2.2.9 單通道電流記錄及數(shù)據(jù)處理
2.3 結(jié)果與討論
2.3.1 α-HL(WT)7納米通道檢測(cè)5'-磷酸化與未磷酸化的發(fā)夾DNA
2.3.2 電壓對(duì)發(fā)夾DNA穿孔信號(hào)的影響
2.3.3 鹽濃度對(duì)發(fā)夾DNA穿孔信號(hào)的影響
2.3.4 發(fā)夾DNA莖部的堿基配對(duì)數(shù)對(duì)5'-磷酸化檢測(cè)的影響
2.3.5 3 '-磷酸化對(duì)發(fā)夾DNA結(jié)構(gòu)的影響
2.3.6 5 '-磷酸化與3'-磷酸化對(duì)發(fā)夾DNA結(jié)構(gòu)影響的綜合對(duì)比
2.3.7 5'-磷酸化對(duì)發(fā)夾DNA與 Dox結(jié)合的影響
2.4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
第三章 基于納米孔單分子技術(shù)檢測(cè)T4多聚核苷酸激酶活性
3.1 前言
3.2 實(shí)驗(yàn)部分
3.2.1 實(shí)驗(yàn)試劑
3.2.2 實(shí)驗(yàn)儀器
3.2.3 電解池和電極的準(zhǔn)備
3.2.4 磷脂雙分子層的形成
3.2.5 天然α-HL蛋白質(zhì)(WT)7的制備
3.2.6 溶液的配制
3.2.7 DNA序列
3.2.8 實(shí)驗(yàn)步驟
3.3 結(jié)果與討論
3.3.1 檢測(cè)原理分析
3.3.2 實(shí)驗(yàn)方法的可行性研究
3.3.3 T4PNK活性分析
3.3.4 分析方法的選擇性研究
3.3.5 實(shí)際樣本的檢測(cè)
3.3.6 T4PNK激酶抑制劑分析
3.4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
結(jié)論
攻讀碩士學(xué)位期間取得的科研成果
致謝
本文編號(hào):3778775
【文章頁(yè)數(shù)】:84 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 緒論
1.1 單分子分析技術(shù)的研究進(jìn)展
1.2 納米孔單分子分析技術(shù)的研究進(jìn)展
1.2.1 納米孔單分子技術(shù)的檢測(cè)原理
1.2.2 納米孔的分類(lèi)
1.3 α-溶血素納米孔簡(jiǎn)介
1.4 α-溶血素納米孔在檢測(cè)基因表觀遺傳修飾方面的應(yīng)用
1.4.1 DNA甲基化的檢測(cè)
1.4.2 DNA損傷的檢測(cè)
1.4.3 Micro RNA的檢測(cè)
1.4.4 G-四鏈體及其折疊過(guò)程的檢測(cè)
1.5 α-溶血素納米孔在單分子酶反應(yīng)研究方面的應(yīng)用
1.6 T4多聚核苷酸激酶
1.6.1 T4PNK簡(jiǎn)介
1.6.2 T4PNK活性的檢測(cè)以及抑制劑的篩選
1.7 本課題的研究意義
參考文獻(xiàn)
第二章 基于α-HL納米孔單分子技術(shù)對(duì)DNA磷酸化的檢測(cè)
2.1 前言
2.2 實(shí)驗(yàn)部分
2.2.1 實(shí)驗(yàn)試劑
2.2.2 實(shí)驗(yàn)儀器
2.2.3 實(shí)驗(yàn)裝置
2.2.4 電解池和電極的制備
2.2.5 磷脂雙分子層的形成
2.2.6 天然α-HL蛋白質(zhì)(WT)7的制備
2.2.7 DNA序列
2.2.8 溶液的配制
2.2.9 單通道電流記錄及數(shù)據(jù)處理
2.3 結(jié)果與討論
2.3.1 α-HL(WT)7納米通道檢測(cè)5'-磷酸化與未磷酸化的發(fā)夾DNA
2.3.2 電壓對(duì)發(fā)夾DNA穿孔信號(hào)的影響
2.3.3 鹽濃度對(duì)發(fā)夾DNA穿孔信號(hào)的影響
2.3.4 發(fā)夾DNA莖部的堿基配對(duì)數(shù)對(duì)5'-磷酸化檢測(cè)的影響
2.3.5 3 '-磷酸化對(duì)發(fā)夾DNA結(jié)構(gòu)的影響
2.3.6 5 '-磷酸化與3'-磷酸化對(duì)發(fā)夾DNA結(jié)構(gòu)影響的綜合對(duì)比
2.3.7 5'-磷酸化對(duì)發(fā)夾DNA與 Dox結(jié)合的影響
2.4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
第三章 基于納米孔單分子技術(shù)檢測(cè)T4多聚核苷酸激酶活性
3.1 前言
3.2 實(shí)驗(yàn)部分
3.2.1 實(shí)驗(yàn)試劑
3.2.2 實(shí)驗(yàn)儀器
3.2.3 電解池和電極的準(zhǔn)備
3.2.4 磷脂雙分子層的形成
3.2.5 天然α-HL蛋白質(zhì)(WT)7的制備
3.2.6 溶液的配制
3.2.7 DNA序列
3.2.8 實(shí)驗(yàn)步驟
3.3 結(jié)果與討論
3.3.1 檢測(cè)原理分析
3.3.2 實(shí)驗(yàn)方法的可行性研究
3.3.3 T4PNK活性分析
3.3.4 分析方法的選擇性研究
3.3.5 實(shí)際樣本的檢測(cè)
3.3.6 T4PNK激酶抑制劑分析
3.4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
結(jié)論
攻讀碩士學(xué)位期間取得的科研成果
致謝
本文編號(hào):3778775
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