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cADO酶和錳氮配合物的理論計(jì)算研究

發(fā)布時(shí)間:2021-09-24 19:35
  本文運(yùn)用密度泛函理論(DFT)方法,計(jì)算研究了cADO酶催化長鏈脂肪醛轉(zhuǎn)化為烷烴的反應(yīng)機(jī)理。通過理論計(jì)算,我們提出了一條在熱力學(xué)上比較有利而且符合同位素標(biāo)記等實(shí)驗(yàn)的反應(yīng)路線。計(jì)算的結(jié)果預(yù)測了外圍還原系統(tǒng)的電子在cADO酶催化反應(yīng)的過程中起著關(guān)鍵的作用,這對深入了解cADO酶的催化反應(yīng)機(jī)理有著重要的理論指導(dǎo)作用。本論文的第二個(gè)工作是研究輔助配體的電子性質(zhì)對錳氮配合物氧化活性的調(diào)控作用。通過采用一系列不同的取代基去取代錳氮配合物的輔助配體,找到自由基分別占據(jù)在金屬原子和配體環(huán)上的兩種氧化態(tài)結(jié)構(gòu)。最后,對在配體自由基作用下所形成的兩種氧化態(tài)結(jié)構(gòu)的關(guān)系進(jìn)行了總結(jié)。本文包括五個(gè)章節(jié)。第一章簡單介紹含鐵酶以及過渡態(tài)金屬氮化物的一些基本知識(shí);第二章描述計(jì)算化學(xué)理論以及過渡態(tài)理論的背景知識(shí)與計(jì)算軟件(ORCA);第三章對cADO酶催化長鏈脂肪醛脫甲酰的反應(yīng)機(jī)理展開研究;第四章對輔助配體的電子性質(zhì)對錳氮配合物氧化活性的影響展開研究;第五章為本文的總結(jié)。 

【文章來源】:福建師范大學(xué)福建省

【文章頁數(shù)】:89 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

cADO酶和錳氮配合物的理論計(jì)算研究


圖1-1血紅素鐵酶與非血紅素鐵酶活性中心結(jié)構(gòu)的區(qū)別(a)血紅素蛋白P450cam??的結(jié)構(gòu)(b)非血紅素蛋甶SyrB2鹵化酶的結(jié)構(gòu)??

正鐵血紅素


現(xiàn)一種很特殊的細(xì)胞色素,其還原態(tài)與一氧化碳結(jié)合后在450nni光譜處存在特征的??最大吸收峰[91。6年后,Omura和Sato^l鑒別出這是一種含正鐵血紅素丨X的特殊的??血紅素蛋白,其結(jié)構(gòu)如下圖1-2所示。他們在文獻(xiàn)中第一次將該細(xì)胞色素命名為細(xì)??胞色素?P450(cytochrome?P450)。??pQ??COO'?COO'??圖1-2.正鐵血紅素W的結(jié)構(gòu)??細(xì)胞色素P450是一種含有鐵卟啉結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì),其作為一種末端單氧化酶,??廣泛存在于哺乳動(dòng)物、軟體動(dòng)物、植物、細(xì)菌、真菌、寄生蟲等不同的生物細(xì)胞中??的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和線粒體內(nèi)膜上。細(xì)胞色素P450催化的底物種類繁多,催化反應(yīng)類型廣??泛,是自然界生物酶催化中一個(gè)功能較齊全的大家族酶W1。細(xì)胞色素P450在催化??反應(yīng)中可以利用氧氣分子實(shí)現(xiàn)對多種有機(jī)底物分子的單加氧化作用,比較常見的如??C-H鍵的羥基化反應(yīng)、芳香烴的羥基化反應(yīng)以及C=C雙鍵的環(huán)氧化反應(yīng)等等,所有??的這些加氧化反應(yīng)都牽涉到生物體中電子傳遞和能量轉(zhuǎn)移的過程,可見細(xì)胞色素??P450在生物體新陳代謝活動(dòng)中起著不可替代的作用I14-1'??-3-??

單核,細(xì)胞色素,正鐵血紅素,羥基化反應(yīng)


現(xiàn)一種很特殊的細(xì)胞色素,其還原態(tài)與一氧化碳結(jié)合后在450nni光譜處存在特征的??最大吸收峰[91。6年后,Omura和Sato^l鑒別出這是一種含正鐵血紅素丨X的特殊的??血紅素蛋白,其結(jié)構(gòu)如下圖1-2所示。他們在文獻(xiàn)中第一次將該細(xì)胞色素命名為細(xì)??胞色素?P450(cytochrome?P450)。??pQ??COO'?COO'??圖1-2.正鐵血紅素W的結(jié)構(gòu)??細(xì)胞色素P450是一種含有鐵卟啉結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì),其作為一種末端單氧化酶,??廣泛存在于哺乳動(dòng)物、軟體動(dòng)物、植物、細(xì)菌、真菌、寄生蟲等不同的生物細(xì)胞中??的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和線粒體內(nèi)膜上。細(xì)胞色素P450催化的底物種類繁多,催化反應(yīng)類型廣??泛,是自然界生物酶催化中一個(gè)功能較齊全的大家族酶W1。細(xì)胞色素P450在催化??反應(yīng)中可以利用氧氣分子實(shí)現(xiàn)對多種有機(jī)底物分子的單加氧化作用,比較常見的如??C-H鍵的羥基化反應(yīng)、芳香烴的羥基化反應(yīng)以及C=C雙鍵的環(huán)氧化反應(yīng)等等,所有??的這些加氧化反應(yīng)都牽涉到生物體中電子傳遞和能量轉(zhuǎn)移的過程,可見細(xì)胞色素??P450在生物體新陳代謝活動(dòng)中起著不可替代的作用I14-1'??-3-??


本文編號(hào):3408324

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