應用Stepped NCE串級質(zhì)譜法研究完整糖肽序列
發(fā)布時間:2021-04-06 14:33
蛋白質(zhì)糖基化是一種重要的翻譯后修飾,在生理和病理過程中扮演著重要的角色。它不僅參與生命體內(nèi)的新陳代謝、免疫調(diào)節(jié)等許多生理過程,而且與癌癥等許多重大疾病的發(fā)生和發(fā)展也密切相關。因此,對于蛋白質(zhì)糖基化的研究具有十分重要的意義。近年來,隨著質(zhì)譜技術的發(fā)展,基于質(zhì)譜技術的蛋白質(zhì)糖基化研究已經(jīng)取得了巨大的成功。但由于糖蛋白低豐度、結構不均一等特性,導致糖蛋白/糖肽的高效富集方面仍然存在很大的困難。并且,將糖蛋白/糖肽從復雜樣品中有效地分離富集之后,完整糖肽水平上系統(tǒng)性、高通量的質(zhì)譜分析也面臨著極大的挑戰(zhàn)。針對上述問題,本論文關于蛋白質(zhì)糖基化的研究主要分為兩部分:1.應用Hybrid Quadrupole Orbitrap質(zhì)譜研究一種新合成脯氨酸-天冬氨酸二肽聚合物修飾的介孔二氧化硅(poly-PD@SiO2)材料對糖肽的富集效果。配置一系列不同質(zhì)量濃度(μg/μL)比的牛胎球蛋白(Bovine fetuin,糖蛋白)與牛血清蛋白(BSA,非糖蛋白、干擾蛋白)的混合干擾模型;旌系鞍讟悠废仁褂靡鹊鞍酌该附馓幚,再經(jīng)實驗室自主合成的poly-PD@SiO2...
【文章來源】:武漢理工大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:80 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
生命體內(nèi)諸多生理過程中的蛋白質(zhì)糖基化
異常的糖基化修飾,如糖蛋白含量的變化、糖鏈結構和糖基化的改變,通常與惡性腫瘤、糖尿病、自身免疫疾病、類風濕性關節(jié)炎、甲狀、阿茲海默綜合癥等許多疾病的發(fā)生和發(fā)展息息相關[10]。如圖 1-2 所示,與細胞相比,腫瘤細胞表面的聚糖結構發(fā)生了明顯改變,這種改變不僅發(fā)生在的核心結構,也可能表現(xiàn)在末端唾液酸化、巖藻糖化這些微小的變化上[11]。
結構決定性質(zhì),性質(zhì)決定功能,糖蛋白在生理和病理過程中獨特的生物學,離不開糖基側鏈對蛋白質(zhì)的修飾作用。糖白質(zhì)的糖基側鏈主要由戊糖、己及其衍生物等單糖構成,常見的單糖包括 N-乙酰葡糖胺(N-acetylglucosamlcNAc),甘露糖(Mannose,Man),N-乙酰半乳糖胺(N-acetylgalactosaminalNAc),半乳糖(Galactose,Gal),唾液酸(Sialic Acid,SA)等。根據(jù)糖連接方式不同,哺乳動物中蛋白質(zhì)的糖基化主要包括 N-linked 糖基化、O-lin基化、GPI 糖基磷脂酰肌醇錨、C-linked 糖基化 4 種類型[15-17]。目前糖蛋白學的研究工作主要集中在 N-linked 糖基化和 O-linked 糖基化這兩種連接方N-linked 糖基化發(fā)生在特定的 NXS/T 多肽特征序列中,是指糖鏈與蛋白中的天冬酰胺(Asparagine,N)共價連接的過程,其中 X 是除脯氨酸外的必需氨基酸[18]。常見 N-linked 糖基化的糖鏈可以按照其結構組成的核心來,主要分為高甘露糖型、復合型、雜合型三大類,如圖 1-3 所示[19, 20]。在這心結構上連接不同數(shù)量和種類的單糖,最終形成了無數(shù)種結構各異的糖鏈ked 糖蛋白多存在于血漿等體液中,因此又稱為血漿型糖蛋白。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]N-糖肽的規(guī)模化質(zhì)譜解析方法進展[J]. 曾文鋒,張揚,劉銘琪,吳建強,張曉今,楊皓,劉超,遲浩,張昆,孫瑞祥,楊芃原,賀思敏. 生物化學與生物物理進展. 2016(06)
[2]完整糖肽質(zhì)譜解析的研究進展[J]. 王繼峰,江靜,彭博,鐘儒剛,應萬濤,錢小紅. 質(zhì)譜學報. 2014(02)
[3]糖蛋白質(zhì)組研究進展[J]. 王林杰,鄭德先,高友鶴. 基礎醫(yī)學與臨床. 2007(02)
碩士論文
[1]基于功能化磁性納米材料的糖肽富集與質(zhì)譜鑒定新方法研究[D]. 匡敏.復旦大學 2013
本文編號:3121609
【文章來源】:武漢理工大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:80 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
生命體內(nèi)諸多生理過程中的蛋白質(zhì)糖基化
異常的糖基化修飾,如糖蛋白含量的變化、糖鏈結構和糖基化的改變,通常與惡性腫瘤、糖尿病、自身免疫疾病、類風濕性關節(jié)炎、甲狀、阿茲海默綜合癥等許多疾病的發(fā)生和發(fā)展息息相關[10]。如圖 1-2 所示,與細胞相比,腫瘤細胞表面的聚糖結構發(fā)生了明顯改變,這種改變不僅發(fā)生在的核心結構,也可能表現(xiàn)在末端唾液酸化、巖藻糖化這些微小的變化上[11]。
結構決定性質(zhì),性質(zhì)決定功能,糖蛋白在生理和病理過程中獨特的生物學,離不開糖基側鏈對蛋白質(zhì)的修飾作用。糖白質(zhì)的糖基側鏈主要由戊糖、己及其衍生物等單糖構成,常見的單糖包括 N-乙酰葡糖胺(N-acetylglucosamlcNAc),甘露糖(Mannose,Man),N-乙酰半乳糖胺(N-acetylgalactosaminalNAc),半乳糖(Galactose,Gal),唾液酸(Sialic Acid,SA)等。根據(jù)糖連接方式不同,哺乳動物中蛋白質(zhì)的糖基化主要包括 N-linked 糖基化、O-lin基化、GPI 糖基磷脂酰肌醇錨、C-linked 糖基化 4 種類型[15-17]。目前糖蛋白學的研究工作主要集中在 N-linked 糖基化和 O-linked 糖基化這兩種連接方N-linked 糖基化發(fā)生在特定的 NXS/T 多肽特征序列中,是指糖鏈與蛋白中的天冬酰胺(Asparagine,N)共價連接的過程,其中 X 是除脯氨酸外的必需氨基酸[18]。常見 N-linked 糖基化的糖鏈可以按照其結構組成的核心來,主要分為高甘露糖型、復合型、雜合型三大類,如圖 1-3 所示[19, 20]。在這心結構上連接不同數(shù)量和種類的單糖,最終形成了無數(shù)種結構各異的糖鏈ked 糖蛋白多存在于血漿等體液中,因此又稱為血漿型糖蛋白。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]N-糖肽的規(guī)模化質(zhì)譜解析方法進展[J]. 曾文鋒,張揚,劉銘琪,吳建強,張曉今,楊皓,劉超,遲浩,張昆,孫瑞祥,楊芃原,賀思敏. 生物化學與生物物理進展. 2016(06)
[2]完整糖肽質(zhì)譜解析的研究進展[J]. 王繼峰,江靜,彭博,鐘儒剛,應萬濤,錢小紅. 質(zhì)譜學報. 2014(02)
[3]糖蛋白質(zhì)組研究進展[J]. 王林杰,鄭德先,高友鶴. 基礎醫(yī)學與臨床. 2007(02)
碩士論文
[1]基于功能化磁性納米材料的糖肽富集與質(zhì)譜鑒定新方法研究[D]. 匡敏.復旦大學 2013
本文編號:3121609
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