多維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜分析水稻葉片蛋白質(zhì)組學(xué)的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-03-24 23:14
水稻,作為重要的糧食作物,是全球超過(guò)一半以上人口生存的食物來(lái)源,深入了解水稻生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程及調(diào)控具有重要的意義。結(jié)合目前多維液相色譜分析植物蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展趨勢(shì),本論文建立二維液相色譜和三維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù),以灌漿期的水稻葉片為實(shí)驗(yàn)材料,通過(guò)優(yōu)化多維液相色譜的流動(dòng)相酸堿度及餾分收集數(shù)目等參數(shù),旨在建立正交性高、分離度好的多維液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)分析水稻葉片蛋白質(zhì)組學(xué)。實(shí)驗(yàn)主要研究成果包括如下:1.本實(shí)驗(yàn)建立了離線親水作用-反相二維液相色譜結(jié)合餾分收集技術(shù)分析水稻葉片蛋白質(zhì)。通過(guò)考察親水作用色譜和反相色譜流動(dòng)相的酸堿度對(duì)系統(tǒng)正交性的影響,得到如下結(jié)論:親水作用色譜(pH 9.3)和反相色譜(pH 3.3)的條件下結(jié)合可實(shí)現(xiàn)較好正交性R2=0.34113,并且該方法在實(shí)際水稻葉片蛋白質(zhì)分析中也表現(xiàn)出較好的正交性和分離能力。2.分別優(yōu)化了二維液相色譜系統(tǒng)中餾分收集數(shù)目和一維液相色譜粗肽段上樣量等參數(shù)。實(shí)驗(yàn)從鑒定蛋白質(zhì)數(shù)目、蛋白物理化學(xué)性質(zhì)等方面考察了餾分收集數(shù)目(12組、22組和42組)和一維液相色譜粗肽段上樣量(2 mg、4 mg和6 mg)對(duì)水稻葉片蛋白質(zhì)鑒定數(shù)目...
【文章來(lái)源】:浙江工業(yè)大學(xué)浙江省
【文章頁(yè)數(shù)】:89 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
離線方式的多維液相色譜系統(tǒng)
圖 2.1 22 組餾分收集組合示意圖Fig. 2.1 Scheme of 22 concatenation strategy第二維納升液相色譜系統(tǒng)采用 Thermo EASY 1000 Nanoflow 液相色維液相色譜條件:Acclaim PepMap RSLC (50 μm × 15 cm, 2 μm) 色譜cclaim PepMap 100 (70 μm × 2 cm,3 μm) Trap 柱;流動(dòng)相 A:0.1%甲酸酸乙腈;流速:0.3 μL/min;進(jìn)樣體積:2 μL。梯度洗脫如下:4%–8%%–30% B,102 min;30%–90% B,10 min;90% B,4 min。質(zhì)譜鑒定利用 Thermo LTQ 線性離子阱質(zhì)譜儀,質(zhì)譜條件如下:N子掃描方式,設(shè)置離子傳輸毛細(xì)管溫度為 300°C,電噴霧電壓:1.9 撞能量為 35%。數(shù)據(jù)依賴模式對(duì) MS 和 MS/MS 進(jìn)行圖譜信息掃描,掃描 (m/z 300–2000),全掃描中豐度最高的 10 個(gè)離子峰進(jìn)行 MS/M排除 (dynamic exclusion) 設(shè)置為:重復(fù)次數(shù)為 1 次,動(dòng)態(tài)排除時(shí)間
流動(dòng)相的酸堿度。在反相色譜流動(dòng)相確定為酸性條件的基礎(chǔ)上,如圖 2.2 (2D 和 2E) 所示:隨親水作用色譜 pH 從堿性降低到中性,21 種標(biāo)準(zhǔn)肽段在二維液相色譜系統(tǒng)的正交性幾乎沒(méi)有影響; 但當(dāng)親水作用色譜 pH 從中性降低到酸性圖 2.2 (2E 和 2F),二液相色譜對(duì)肽段的保留行為上表現(xiàn)出明顯的差異,校正保留時(shí)間線性擬合系數(shù)從0.59887 降低到 0.34113。以肽段 2 和 21 為例, 親水性肽段 2 (GRAVY = –1.625) HILIC 色譜柱到 RP 色譜柱的保留時(shí)間從 50 min 縮短到 14 min;疏水性肽段 21(GRAVY = 0.503) 在兩維色譜的保留時(shí)間從 25 min 延長(zhǎng)到 116 min。綜上所述,p9.3 和 pH 3.3 分別被選擇為親水作用色譜和反相色譜的流動(dòng)相酸堿度。此外,反相色譜因分離效率高、流動(dòng)相與質(zhì)譜兼容等優(yōu)點(diǎn)被前人廣泛的應(yīng)用于二維液相色譜系統(tǒng)的最后一維[67,59],因此我們選擇親水作用色譜和反相色譜分別作為二維液相色譜系統(tǒng)的第一維和第二維。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]一種反相/弱陽(yáng)離子交換混合模式色譜填料結(jié)合質(zhì)譜在蛋白質(zhì)組學(xué)中的應(yīng)用[J]. 周珊珊,劉佳玉,張養(yǎng)軍,錢小紅. 中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2018(02)
[2]高分辨飛行時(shí)間質(zhì)譜在蛋白質(zhì)組學(xué)相對(duì)定量分析中的應(yīng)用[J]. 洪曉愉,王浩,徐金玲,李水明,王勇. 分析化學(xué). 2016(03)
[3]植物激素調(diào)控水稻花器官發(fā)育分子機(jī)制的研究進(jìn)展[J]. 沈衛(wèi)平,蔡強(qiáng),周鋒利,張建中,張大兵,袁政. 植物生理學(xué)報(bào). 2015(05)
[4]親水/反相二維色譜法制備桔梗中的三萜皂苷[J]. 邢倩倩,傅青,金郁,梁鑫淼. 色譜. 2014(07)
[5]納升級(jí)反相液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜法分析蜈蚣提取蛋白質(zhì)[J]. 陳霞,文紅梅,劉睿,朱棟,李偉,周紅光,吳勉華. 分析化學(xué). 2014(02)
[6]多維液相色譜分離技術(shù)在復(fù)雜蛋白質(zhì)組學(xué)樣品鑒定中的應(yīng)用[J]. 張羅敷,胡曉芳,徐學(xué)敏. 現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2013(01)
[7]雙水相萃取結(jié)合液相色譜法分離蛋白質(zhì)[J]. 趙新穎,屈鋒,董敏,陳凡,羅愛芹,張經(jīng)華. 分析化學(xué). 2012(01)
[8]Thermo Scientific Q Exactive臺(tái)式四極桿-軌道阱高分辨質(zhì)譜儀[J]. 王勇為,葉芳挺. 中國(guó)食品. 2011(22)
[9]去除血漿中高豐度蛋白質(zhì)的二維液相色譜體系的建立[J]. 朱紹春,張學(xué)洋,高明霞,晏國(guó)全,張祥民. 色譜. 2011(09)
[10]高效液相色譜法在蛋白質(zhì)分離檢測(cè)中的應(yīng)用[J]. 吳少輝,張成桂,劉光明. 畜牧與飼料科學(xué). 2011(08)
碩士論文
[1]水稻半顯性卷葉突變體erll的遺傳分析與基因定位[D]. 徐靜.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
[2]三維串聯(lián)液質(zhì)聯(lián)用蛋白質(zhì)組學(xué)分離方法的建立[D]. 張羅敷.上海交通大學(xué) 2012
[3]中藥二維液相色譜分析體系的建立[D]. 梁征.華東理工大學(xué) 2012
[4]新型二維液相色譜體系的建立、評(píng)價(jià)及其應(yīng)用[D]. 余丹華.華東理工大學(xué) 2011
[5]在線蛋白二維液相色譜儀的構(gòu)建及應(yīng)用[D]. 張會(huì)強(qiáng).西北大學(xué) 2009
[6]正—反相正交二維液相色譜系統(tǒng)構(gòu)建及評(píng)價(jià)[D]. 蘭韜.南京理工大學(xué) 2008
[7]現(xiàn)代液相色譜和質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)用于半邊蓮藥材的研究[D]. 周穎.上海交通大學(xué) 2008
[8]蛋白質(zhì)組學(xué)中的多維液相色譜—質(zhì)譜技術(shù)研究及其在胰腺癌標(biāo)志物篩選中的應(yīng)用[D]. 陳剛.西北大學(xué) 2006
[9]稀土元素鑭對(duì)逆境脅迫下水稻幼苗生長(zhǎng)的影響研究[D]. 張杰.安徽師范大學(xué) 2005
[10]水稻無(wú)側(cè)根突變體RM109的蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 白月.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004
本文編號(hào):3098574
【文章來(lái)源】:浙江工業(yè)大學(xué)浙江省
【文章頁(yè)數(shù)】:89 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
離線方式的多維液相色譜系統(tǒng)
圖 2.1 22 組餾分收集組合示意圖Fig. 2.1 Scheme of 22 concatenation strategy第二維納升液相色譜系統(tǒng)采用 Thermo EASY 1000 Nanoflow 液相色維液相色譜條件:Acclaim PepMap RSLC (50 μm × 15 cm, 2 μm) 色譜cclaim PepMap 100 (70 μm × 2 cm,3 μm) Trap 柱;流動(dòng)相 A:0.1%甲酸酸乙腈;流速:0.3 μL/min;進(jìn)樣體積:2 μL。梯度洗脫如下:4%–8%%–30% B,102 min;30%–90% B,10 min;90% B,4 min。質(zhì)譜鑒定利用 Thermo LTQ 線性離子阱質(zhì)譜儀,質(zhì)譜條件如下:N子掃描方式,設(shè)置離子傳輸毛細(xì)管溫度為 300°C,電噴霧電壓:1.9 撞能量為 35%。數(shù)據(jù)依賴模式對(duì) MS 和 MS/MS 進(jìn)行圖譜信息掃描,掃描 (m/z 300–2000),全掃描中豐度最高的 10 個(gè)離子峰進(jìn)行 MS/M排除 (dynamic exclusion) 設(shè)置為:重復(fù)次數(shù)為 1 次,動(dòng)態(tài)排除時(shí)間
流動(dòng)相的酸堿度。在反相色譜流動(dòng)相確定為酸性條件的基礎(chǔ)上,如圖 2.2 (2D 和 2E) 所示:隨親水作用色譜 pH 從堿性降低到中性,21 種標(biāo)準(zhǔn)肽段在二維液相色譜系統(tǒng)的正交性幾乎沒(méi)有影響; 但當(dāng)親水作用色譜 pH 從中性降低到酸性圖 2.2 (2E 和 2F),二液相色譜對(duì)肽段的保留行為上表現(xiàn)出明顯的差異,校正保留時(shí)間線性擬合系數(shù)從0.59887 降低到 0.34113。以肽段 2 和 21 為例, 親水性肽段 2 (GRAVY = –1.625) HILIC 色譜柱到 RP 色譜柱的保留時(shí)間從 50 min 縮短到 14 min;疏水性肽段 21(GRAVY = 0.503) 在兩維色譜的保留時(shí)間從 25 min 延長(zhǎng)到 116 min。綜上所述,p9.3 和 pH 3.3 分別被選擇為親水作用色譜和反相色譜的流動(dòng)相酸堿度。此外,反相色譜因分離效率高、流動(dòng)相與質(zhì)譜兼容等優(yōu)點(diǎn)被前人廣泛的應(yīng)用于二維液相色譜系統(tǒng)的最后一維[67,59],因此我們選擇親水作用色譜和反相色譜分別作為二維液相色譜系統(tǒng)的第一維和第二維。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]一種反相/弱陽(yáng)離子交換混合模式色譜填料結(jié)合質(zhì)譜在蛋白質(zhì)組學(xué)中的應(yīng)用[J]. 周珊珊,劉佳玉,張養(yǎng)軍,錢小紅. 中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2018(02)
[2]高分辨飛行時(shí)間質(zhì)譜在蛋白質(zhì)組學(xué)相對(duì)定量分析中的應(yīng)用[J]. 洪曉愉,王浩,徐金玲,李水明,王勇. 分析化學(xué). 2016(03)
[3]植物激素調(diào)控水稻花器官發(fā)育分子機(jī)制的研究進(jìn)展[J]. 沈衛(wèi)平,蔡強(qiáng),周鋒利,張建中,張大兵,袁政. 植物生理學(xué)報(bào). 2015(05)
[4]親水/反相二維色譜法制備桔梗中的三萜皂苷[J]. 邢倩倩,傅青,金郁,梁鑫淼. 色譜. 2014(07)
[5]納升級(jí)反相液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜法分析蜈蚣提取蛋白質(zhì)[J]. 陳霞,文紅梅,劉睿,朱棟,李偉,周紅光,吳勉華. 分析化學(xué). 2014(02)
[6]多維液相色譜分離技術(shù)在復(fù)雜蛋白質(zhì)組學(xué)樣品鑒定中的應(yīng)用[J]. 張羅敷,胡曉芳,徐學(xué)敏. 現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2013(01)
[7]雙水相萃取結(jié)合液相色譜法分離蛋白質(zhì)[J]. 趙新穎,屈鋒,董敏,陳凡,羅愛芹,張經(jīng)華. 分析化學(xué). 2012(01)
[8]Thermo Scientific Q Exactive臺(tái)式四極桿-軌道阱高分辨質(zhì)譜儀[J]. 王勇為,葉芳挺. 中國(guó)食品. 2011(22)
[9]去除血漿中高豐度蛋白質(zhì)的二維液相色譜體系的建立[J]. 朱紹春,張學(xué)洋,高明霞,晏國(guó)全,張祥民. 色譜. 2011(09)
[10]高效液相色譜法在蛋白質(zhì)分離檢測(cè)中的應(yīng)用[J]. 吳少輝,張成桂,劉光明. 畜牧與飼料科學(xué). 2011(08)
碩士論文
[1]水稻半顯性卷葉突變體erll的遺傳分析與基因定位[D]. 徐靜.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013
[2]三維串聯(lián)液質(zhì)聯(lián)用蛋白質(zhì)組學(xué)分離方法的建立[D]. 張羅敷.上海交通大學(xué) 2012
[3]中藥二維液相色譜分析體系的建立[D]. 梁征.華東理工大學(xué) 2012
[4]新型二維液相色譜體系的建立、評(píng)價(jià)及其應(yīng)用[D]. 余丹華.華東理工大學(xué) 2011
[5]在線蛋白二維液相色譜儀的構(gòu)建及應(yīng)用[D]. 張會(huì)強(qiáng).西北大學(xué) 2009
[6]正—反相正交二維液相色譜系統(tǒng)構(gòu)建及評(píng)價(jià)[D]. 蘭韜.南京理工大學(xué) 2008
[7]現(xiàn)代液相色譜和質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)用于半邊蓮藥材的研究[D]. 周穎.上海交通大學(xué) 2008
[8]蛋白質(zhì)組學(xué)中的多維液相色譜—質(zhì)譜技術(shù)研究及其在胰腺癌標(biāo)志物篩選中的應(yīng)用[D]. 陳剛.西北大學(xué) 2006
[9]稀土元素鑭對(duì)逆境脅迫下水稻幼苗生長(zhǎng)的影響研究[D]. 張杰.安徽師范大學(xué) 2005
[10]水稻無(wú)側(cè)根突變體RM109的蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 白月.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004
本文編號(hào):3098574
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