核酸熒光探針的設(shè)計(jì)及生化分析應(yīng)用
【學(xué)位單位】:大連理工大學(xué)
【學(xué)位級別】:博士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:O657.3
【部分圖文】:
geporr??Labeled?MB?|??Label-free?MB??圖U分子信標(biāo)的結(jié)構(gòu)示意圖%。??Figure?1.1?Scheme?of?the?molecular?beacon?structure[18].??1996年Tyagi和Kramer首次使用分子信標(biāo)進(jìn)行定量分析W。相對于傳統(tǒng)的核針,分子信標(biāo)不僅靈敏度高、特異性強(qiáng),而且操作簡便、適用于活體分析,因此在傳感、生物成像和癌癥治療中都充當(dāng)著重要的角色t31_34]。分子信標(biāo)的工作原理如圖所示,在沒有靶標(biāo)序列存在時(shí),自由狀態(tài)的分子信標(biāo)呈莖環(huán)狀,莖部的熒光基團(tuán)和基團(tuán)間的距離小于10?nm。基于熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)原理,熒光團(tuán)發(fā)出的熒淬滅基團(tuán)吸收,并以熱的形式散發(fā)出去使熒光淬滅。當(dāng)目標(biāo)DNA出現(xiàn)時(shí),分子信目標(biāo)DNA進(jìn)行互補(bǔ)雜交形成雙鏈結(jié)構(gòu),莖環(huán)結(jié)構(gòu)被打開,熒光基團(tuán)和淬滅基團(tuán)距大,無法發(fā)生共振能量轉(zhuǎn)移,熒光信號恢復(fù)。熒光的強(qiáng)度與溶液中靶標(biāo)的量成正比關(guān)根據(jù)熒光信號的強(qiáng)度可以實(shí)現(xiàn)靶標(biāo)的精準(zhǔn)定量分析。根據(jù)熱力學(xué)平衡關(guān)系,分子信靶標(biāo)DNA的雜交特異性要明顯優(yōu)于常規(guī)的線性探針,因此通常具有較好的選擇性。??
1996年Tyagi和Kramer首次使用分子信標(biāo)進(jìn)行定量分析W。相對于傳統(tǒng)的核酸探??針,分子信標(biāo)不僅靈敏度高、特異性強(qiáng),而且操作簡便、適用于活體分析,因此在生物??傳感、生物成像和癌癥治療中都充當(dāng)著重要的角色t31_34]。分子信標(biāo)的工作原理如圖1.2??所示,在沒有靶標(biāo)序列存在時(shí),自由狀態(tài)的分子信標(biāo)呈莖環(huán)狀,莖部的熒光基團(tuán)和淬滅??基團(tuán)間的距離小于10?nm。基于熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)原理,熒光團(tuán)發(fā)出的熒光被??淬滅基團(tuán)吸收,并以熱的形式散發(fā)出去使熒光淬滅。當(dāng)目標(biāo)DNA出現(xiàn)時(shí),分子信標(biāo)與??目標(biāo)DNA進(jìn)行互補(bǔ)雜交形成雙鏈結(jié)構(gòu),莖環(huán)結(jié)構(gòu)被打開,熒光基團(tuán)和淬滅基團(tuán)距離增??大,無法發(fā)生共振能量轉(zhuǎn)移,熒光信號恢復(fù)。熒光的強(qiáng)度與溶液中靶標(biāo)的量成正比關(guān)系,??根據(jù)熒光信號的強(qiáng)度可以實(shí)現(xiàn)靶標(biāo)的精準(zhǔn)定量分析。根據(jù)熱力學(xué)平衡關(guān)系,分子信標(biāo)與??靶標(biāo)DNA的雜交特異性要明顯優(yōu)于常規(guī)的線性探針,因此通常具有較好的選擇性。??j?Target??F?Q??圖1.2分子
定性好、催化反應(yīng)速率快等優(yōu)勢。脫氧核酶的催化功能包括RNA切割活性、DNA切割??活性、卟啉金屬化酶和過氧化物酶活性、DNA激酶活性等。其中,應(yīng)用最廣泛的一類??脫氧核酶具有RNA切割活性。如圖1.3A所示,這類脫氧核酶通常由底物鏈和酶鏈組成,??底物鏈中包含RNA切割位點(diǎn)(rA),而酶鏈由催化環(huán)部和臂構(gòu)成。輔助因子可激活脫??氧核酶,使其可以特異性地將底物鏈中的RNA堿基水解切斷。參與脫氧核酶催化過程??的輔助因子包括金屬離子、中性分子和細(xì)菌等。金屬離子是一類比較常見的輔助因子,??在核酸酶工作時(shí)可以起到促進(jìn)脫氧核酶序列正確折疊以形成催化中心、保持酶的活性狀??態(tài)、穩(wěn)定核酸酶的中間過渡態(tài)、以及屏蔽磷酸骨架所帶負(fù)電荷等作用。不同結(jié)構(gòu)的脫氧??核酶依賴的金屬離子的種類和程度都不同,說明脫氧核酶存在一個(gè)或幾個(gè)對構(gòu)象有嚴(yán)格??要求的金屬離子結(jié)合位點(diǎn);诤怂崦富钚砸蕾囉谔囟ń饘匐x子的特性,多種核酸酶探??針陸續(xù)被開發(fā)并用于金屬離子的高靈敏檢測[37@。另一類常見的脫氧核酶是G-四聯(lián)體??DNAzyme,這類酶由一段或幾段富G堿基的序列構(gòu)成,能在K+,?Pb2+或NH4+的輔助下??折疊形成平行或反平行的四聯(lián)體構(gòu)型,并與氯化高鐵血紅素(hemin)結(jié)合,表現(xiàn)出類??過氧化物酶的活性
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本文編號:2882390
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