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熒光相關(guān)光譜測(cè)定酶活性新方法研究

發(fā)布時(shí)間:2020-05-08 10:37
【摘要】:酶是具有生物催化功能的生物大分子(蛋白質(zhì)或RNA)。酶活性的異常通常與一些重大疾病相關(guān)。酶活性的測(cè)定已成為基礎(chǔ)研究、疾病早期診斷、藥物篩選以及靶向治療的重要方法。傳統(tǒng)的酶活性測(cè)定方法需要試劑的量大、費(fèi)用高、分析時(shí)間長(zhǎng),因此需要開(kāi)發(fā)靈敏、快速、微量的分析新方法。熒光相關(guān)光譜法(Fluorescence correlation spectroscopy,FCS)是一種單分子檢測(cè)方法,具有靈敏度高、分析時(shí)間短、檢測(cè)體積小等優(yōu)點(diǎn),適用于酶活性的測(cè)定和酶抑制劑的篩選。本論文建立了FCS檢測(cè)端粒酶活性的新方法,發(fā)展了微孔芯片-熒光相關(guān)光譜(Microwell chip-fluorescence correlation spectroscopy,MC-FCS)系統(tǒng),并以MC-FCS系統(tǒng)進(jìn)行了含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶-3(Cysteinyl aspartate specific proteinase-3,Caspase-3)活性的檢測(cè)研究。本論文的主要內(nèi)容包括以下的幾個(gè)方面:(1)將單分子熒光相關(guān)光譜(FCS)與端粒酶重復(fù)擴(kuò)增法(Telomerase repeat amplification protocol,TRAP)相結(jié)合,發(fā)展了一種超靈敏和可靠的定量測(cè)定端粒酶活性的新方法(TRAP-FCS)。端粒酶是一種維持端粒長(zhǎng)度的關(guān)鍵酶,且由于其在癌癥和衰老中的重要作用,被認(rèn)為是一種通用的癌癥生物標(biāo)志物和潛在的藥物靶標(biāo)。由于端粒酶在細(xì)胞內(nèi)的含量水平非常低,因此有必要開(kāi)發(fā)一種靈敏可靠的端粒酶活性檢測(cè)方法。TRAP-FCS方法的原理是利用FCS對(duì)TRAP產(chǎn)物的特征擴(kuò)散時(shí)間和粒子數(shù)目的變化進(jìn)行測(cè)量。其特征擴(kuò)散時(shí)間與TRAP產(chǎn)物的長(zhǎng)度有關(guān),粒子數(shù)目代表了TRAP產(chǎn)物的濃度。實(shí)驗(yàn)優(yōu)化了TRAP程序和FCS檢測(cè)的條件。我們發(fā)現(xiàn),端粒酶活性與TRAP產(chǎn)物在最佳實(shí)驗(yàn)條件下的特征擴(kuò)散時(shí)間和粒子數(shù)呈正相關(guān)。該方法成功地測(cè)定了不同細(xì)胞個(gè)數(shù)和細(xì)胞系的端粒酶活性,實(shí)現(xiàn)了單個(gè)細(xì)胞檢測(cè)。同時(shí),采用該方法對(duì)抑制劑的抑制效果進(jìn)行了評(píng)價(jià),得到IC_(50)值與文獻(xiàn)資料基本一致。與目前的TRAP方法相比,該方法具有可靠的定量、超高的靈敏度、較短的檢測(cè)時(shí)間和無(wú)需分離等優(yōu)點(diǎn)。我們認(rèn)為T(mén)RAP-FCS方法在端粒酶活性檢測(cè)的臨床診斷和藥物篩選中具有潛在的應(yīng)用價(jià)值。(2)自行制作了一種PDMS/玻璃的微孔芯片,實(shí)現(xiàn)其與FCS檢測(cè)方法聯(lián)用,建立了MC-FCS方法。首先制作了適合于FCS檢測(cè)的PDMS/玻璃微孔芯片。采用薄膜封裝減小了芯片孔中微量的樣品蒸發(fā),還采用表面活性劑動(dòng)態(tài)修飾的方法消除了樣品的非特異性吸附。在優(yōu)化后的條件下,玻片和芯片上的樣品檢測(cè)結(jié)果基本一致,微孔芯片成功地用于熒光相關(guān)光譜系統(tǒng)檢測(cè)。優(yōu)化了芯片孔徑的大小,芯片最佳孔徑為0.9 mm。進(jìn)而,我們優(yōu)化了樣品溶液的體積,顯著地減少樣品體積至1μL。MC-FCS系統(tǒng)與現(xiàn)有的FCS方法相比,顯著地減少了樣品和試劑體積,極大地降低了酶活性測(cè)定和藥物篩選的成本。(3)基于MC-FCS技術(shù),提出了Caspase-3活性及其抑制常數(shù)測(cè)定新方法。Caspase-3是細(xì)胞生物個(gè)體發(fā)育和體內(nèi)平衡過(guò)程中細(xì)胞凋亡的關(guān)鍵酶,而且是治療細(xì)胞凋亡相關(guān)疾病中一個(gè)非常重要的潛在藥物靶點(diǎn)。到目前為止,還沒(méi)有用于Caspase-3靶點(diǎn)的商業(yè)藥物,因此急需開(kāi)發(fā)Caspase-3活性檢測(cè)和抑制劑篩選的有效方法。我們方法的原理是基于FCS測(cè)量酶反應(yīng)動(dòng)力學(xué)和均相檢測(cè)酶反應(yīng)的產(chǎn)物。該MC-FCS系統(tǒng)可以顯著地降低樣品體積至1μL。實(shí)驗(yàn)使用了熒光染料和生物素雙重標(biāo)記的Caspase-3底物。在產(chǎn)物中添加的鏈霉親和素不僅可以快速地終止酶反應(yīng),還由于增大了分子量差距使得反應(yīng)產(chǎn)物也可以被FCS選擇性的檢測(cè)。我們將FCS理論與酶反應(yīng)動(dòng)力學(xué)結(jié)合,建立了Caspase-3抑制劑的篩選模型。該新方法成功地用于抑制劑的抑制常數(shù)的測(cè)定以及藥物誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡的檢測(cè)。與現(xiàn)有的方法相比,該方法靈敏度高、試劑用量小、分析時(shí)間短。我們相信該系統(tǒng)和方法將成為對(duì)Caspase-3抑制劑篩選和細(xì)胞凋亡檢測(cè)的有效平臺(tái)。
【圖文】:

基本原理,熒光分子


4圖 1-1 FCS 檢測(cè)的基本原理。Fig.1-1 Principle of FCS detection.通過(guò)熒光波動(dòng)自相關(guān)函數(shù)擬合得到的自相關(guān)曲線可以提供以下幾個(gè)方面的信息:擬合曲線 G(0)值的大小反比于檢測(cè)微區(qū)內(nèi)熒光分子的平均數(shù)量;曲線隨時(shí)間衰退的速率和形態(tài)可以顯示出檢測(cè)微區(qū)內(nèi)熒光分子擴(kuò)散變化的動(dòng)力學(xué)特征;依據(jù)熒光強(qiáng)度和熒光分子的數(shù)量還可以得到單個(gè)粒子的熒光強(qiáng)度等。歸一化的 FCS 曲線如圖 1-2A 所示,隨著熒光分子的結(jié)合變大和特征擴(kuò)散時(shí)間的變慢,F(xiàn)CS 的曲線會(huì)逐漸右移。自相關(guān) FCS 曲線如圖 1-2B 所示,隨著熒光分子濃度的增加,粒子數(shù)目增加,,F(xiàn)CS 的曲線 G(0)值的大小會(huì)逐漸下降。這是當(dāng) FCS 的曲線發(fā)生變化時(shí)所代表的意義。通過(guò)計(jì)算可以得到熒光分子的濃度、擴(kuò)散系數(shù)、反應(yīng)常數(shù)等一系列重要的參數(shù)。

曲線,曲線變化,擴(kuò)散時(shí)間


5S 的曲線變化圖。(A)歸一化的 FCS 曲線反映了擴(kuò)散時(shí)間和分子大(B)FCS 曲線反映了粒子數(shù)和濃度的變化。inciple of FCS detection. (A) Normalized autocorrelation curves reflect thtime and molecular size. (B) FCS autocorrelation curves reflect the changnumbers and concentration.FCS 的理論公式微區(qū)內(nèi)熒光信號(hào)的強(qiáng)度在任一時(shí)間 t 的變化引起的漲落值為:F(t) = F(t) - F(t)
【學(xué)位授予單位】:上海交通大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類(lèi)號(hào)】:Q55;O657.3

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