基于Endo-M N175Q酶轉(zhuǎn)糖基活性的N-糖鏈分析
發(fā)布時間:2020-04-10 09:03
【摘要】:近年來,以質(zhì)譜為分析平臺的糖鏈分析研究取得了很大程度進展。糖鏈的釋放和衍生化等樣品制備方法不斷得到豐富和改進,糖鏈的各種分析策略相繼建立起來,本文主要對糖鏈的定性分析方法做分析和總結(jié)。本論文采用化學(xué)酶標(biāo)記法,酶標(biāo)記是糖基化分析的最有前途的方法之一,因為其簡單:標(biāo)記發(fā)生在酶消化過程中,可以避免額外的試劑,額外的步驟和副反應(yīng);瘜W(xué)酶法因其溫和的反應(yīng)條件、高度的空間區(qū)域選擇性,避免了化學(xué)合成繁瑣的保護步驟而成為研究的熱點,為研究糖蛋白中的N-糖鏈,提供了新的思路。第一章緒論的主要內(nèi)容是糖蛋白糖鏈現(xiàn)狀以及與疾病有哪些關(guān)聯(lián),并且詳細說明糖蛋白的組成結(jié)構(gòu)和應(yīng)用。目前研究糖鏈的方法多用PNGaseF酶,但本文使用了胰蛋白酶,所以緒論部分對此進行了簡短介紹和說明,同時對最后一步轉(zhuǎn)糖基酶Endo-MN175Q的作用及優(yōu)點做出詳盡解釋。第二章實驗部分,著重說明實驗所需各種溶液的配制,以及實驗過程中涉及的脫鹽,胰蛋白酶切,丙酮富集糖肽,酶反應(yīng)條件及方法,并且通過最后優(yōu)化的方法對三種標(biāo)準(zhǔn)品進行定性檢測分析,結(jié)果較好。第三章結(jié)果與討論中,著重探討了三種糖蛋白分析方法,其中方法一是糖蛋白在Endo-MN175Q的作用下,直接將寡糖轉(zhuǎn)移到受體上。方法二使用PNGase F酶對糖鏈進行分析,將寡糖轉(zhuǎn)移到受體。而第三種方法是本文著重討論的方法,用胰蛋白酶將糖蛋白酶切,對肽鏈進行丙酮富集,而現(xiàn)在大多數(shù)論文的一般方法都是對肽段進行分析,而本文方法具有新穎性,采用丙酮富集糖肽的方法,將寡糖轉(zhuǎn)移至受體后與175Q酶反應(yīng),經(jīng)過譜圖檢測后發(fā)現(xiàn)丙酮富集糖肽方法效果非常好,隨后細致的探討了各步驟反應(yīng)條件優(yōu)化情況,確定了最終方法。然后將此方法應(yīng)用于三種標(biāo)準(zhǔn)糖蛋白,分別是牛胰核糖核酸酶B,卵清蛋白,胎球蛋白。其中著重突出了丙酮在-25度冰柜中,以及5倍體積量富集糖肽效果最好,檢測到的糖肽鏈最多。通過糖鏈在丙酮和水中的溶解度不同,而形成清液和沉淀,接著對沉淀進行丙酮富集,得到豐富的糖鏈信息。最后用Endo-M的突變體175Q酶進行轉(zhuǎn)移,效率高,結(jié)果好。以牛胰核糖核酸酶B共檢測到5種糖鏈,分別是M5N2,M6N2,M7N2,M8N2,M9N2。卵清蛋白檢測到5種,分別是M5N2,M6N2,M8N2,M3N4,M3N6。胎球蛋白檢測到 6 種,分別是 M3N4G2,M3N4G2Ac2,M3N4G2Ac3,M3N5G3Ac,M3N5G3Ac2,M3N6G4Ac4。本文建立高效、高選擇性的丙酮富集糖肽方法,利用175Q酶轉(zhuǎn)糖基反應(yīng)特性,使用化學(xué)酶衍生化法對糖蛋白進行定性定量分析。
【圖文】:
加5mUEndo-M-N175Q酶5隊,在金屬浴32°C條件下反應(yīng)3小時,反應(yīng)結(jié)束后加逡逑10隊乙腈使酶失活,總體積為40邋nL,進LC-MS液質(zhì)檢測分析。逡逑_果如圖7所示。邐逡逑xlO7邋*SSl邋TIC邐Frag-13S.0V邋669.d逡逑6-邋|逡逑,|邋A-TIC逡逑3-邐|逡逑2.邐i邋j,逡逑0-1邐邐邐邐邐邐邐邐邐邐邐邐邐邐邐邐邋邐邐,邐邐邐v邋"A…N:二一工:-二、.“…丫.…}.二;:二"..….............;Y,………,….…|.......>..,,v..r.;..,,v.;,Tr(逡逑15邋I6邋1?邋18邋19邋20邋21邋22邋23邋24邋if)邋26邋2:邋^邋29邋30邋31邋32邋^邋^邋36邋36邋37邋38邋39邋40邋4邋1邋42邋4邋3邋44逡逑Cm\ts邋vs.邋f邋jfefftfo]邋(.in)逡逑12逡逑
圖9表示牛胰核糖核酸酶B經(jīng)過DTT-IAA變性處理后,直接與175Q酶反應(yīng),譜圖結(jié)逡逑果雖比熱變性清晰,但仍然只能檢測到兩種糖鏈,M5N2和M6N2。C-丨是M5N2的色譜逡逑圖EIC,邋C-2是萃取后M5N2的質(zhì)譜圖ESI,邋D_1是M6N2的色譜圖EIC,邋D-2是M6N2萃逡逑取后的質(zhì)譜圖ESI。M6N2峰不是單獨尖峰,不是很清晰,需要放大后才可以找到相應(yīng)分逡逑子量。綜合兩種變性方法得到的LC-MS譜圖,這種將糖蛋白變性后,不經(jīng)任何處理直接逡逑與175Q反應(yīng)的方法有局限性,不能有效轉(zhuǎn)移寡糖鏈。所以我們又繼續(xù)進行了其他方法的逡逑嘗試。逡逑3.邋4邋PNGase邋F酶切對糖肋分析逡逑根據(jù)文獻,一般方法基本是將糖蛋白變性,PNGaseF酶切,純化分離,與175Q酶反逡逑應(yīng),所以我們根據(jù)論文對2種標(biāo)準(zhǔn)糖蛋白,牛胰核糖核酸酶B和胎球蛋白采用PNGase邋F逡逑酶切,得到寡糖,對糖鏈分析。逡逑PNGaseF酶使用條件也比較麻煩,pH邋=邋7.5緩沖溶液條件,還需要同SDS,邋NP-40搭逡逑配使用,這樣就會引起多余的雜質(zhì),引出雜質(zhì)就要除去雜質(zhì),這個過程浪費時間,也會浪逡逑17逡逑
【學(xué)位授予單位】:延邊大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:Q55;O657.63
本文編號:2622031
【圖文】:
加5mUEndo-M-N175Q酶5隊,在金屬浴32°C條件下反應(yīng)3小時,反應(yīng)結(jié)束后加逡逑10隊乙腈使酶失活,總體積為40邋nL,進LC-MS液質(zhì)檢測分析。逡逑_果如圖7所示。邐逡逑xlO7邋*SSl邋TIC邐Frag-13S.0V邋669.d逡逑6-邋|逡逑,|邋A-TIC逡逑3-邐|逡逑2.邐i邋j,逡逑0-1邐邐邐邐邐邐邐邐邐邐邐邐邐邐邐邐邋邐邐,邐邐邐v邋"A…N:二一工:-二、.“…丫.…}.二;:二"..….............;Y,………,….…|.......>..,,v..r.;..,,v.;,Tr(逡逑15邋I6邋1?邋18邋19邋20邋21邋22邋23邋24邋if)邋26邋2:邋^邋29邋30邋31邋32邋^邋^邋36邋36邋37邋38邋39邋40邋4邋1邋42邋4邋3邋44逡逑Cm\ts邋vs.邋f邋jfefftfo]邋(.in)逡逑12逡逑
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【學(xué)位授予單位】:延邊大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:Q55;O657.63
【參考文獻】
相關(guān)碩士學(xué)位論文 前1條
1 徐長帥;利用HPLC/ESI-MS建立糖蛋白中N-糖鏈的分析方法[D];延邊大學(xué);2016年
本文編號:2622031
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/huaxue/2622031.html
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